The ability to properly identify species present in a landscape is foundational to ecology and essential for natural resource management and conservation. However, many species are often unaccounted for due to ineffective direct capture and visual surveys, especially in aquatic environments. Environmental DNA metabarcoding is an approach that overcomes low detection probabilities and should consequently enhance estimates of biodiversity and its proxy, species richness. Here, we synthesize 37 studies in natural aquatic systems to compare species richness estimates for bony fish between eDNA metabarcoding and conventional methods, such as nets, visual census, and electrofishing. In freshwater systems with fewer than 100 species, we found eDNA metabarcoding detected more species than conventional methods. Using multiple genetic markers further increased species richness estimates with eDNA metabarcoding. For more diverse freshwater systems and across marine systems, eDNA metabarcoding reported similar values of species richness to conventional methods; however, more studies are needed in these environments to better evaluate relative performance. In systems with greater biodiversity, eDNA metabarcoding will require more populated reference databases, increased sampling effort, and multi-marker assays to ensure robust species richness estimates to further validate the approach. eDNA metabarcoding is reliable and provides a path for broader biodiversity assessments that can outperform conventional methods for estimating species richness.

中文翻译：

---

将环境 DNA 元条形码校准到用于测量鱼类物种丰富度的常规调查

正确识别景观中物种的能力是生态学的基础，对自然资源管理和保护至关重要。然而，由于直接捕获和目视调查无效，许多物种经常下落不明，尤其是在水生环境中。环境 DNA 元条形码是一种克服低检测概率的方法，因此应提高对生物多样性及其代理物种丰富度的估计。在这里，我们综合了自然水生系统中的 37 项研究，以比较 eDNA 元条形码和传统方法（如网、视觉普查和电子捕鱼）之间对硬骨鱼的物种丰富度估计。在少于 100 个物种的淡水系统中，我们发现 eDNA 元条形码检测到的物种比传统方法多。使用多个遗传标记进一步增加了 eDNA 元条形码的物种丰富度估计。对于更多样化的淡水系统和跨海洋系统，eDNA 元条形码报告的物种丰富度值与传统方法相似；然而，需要在这些环境中进行更多研究以更好地评估相对性能。在具有更大生物多样性的系统中，eDNA 元条形码将需要更多的参考数据库、更多的采样工作和多标记分析，以确保可靠的物种丰富度估计，以进一步验证该方法。eDNA 元条形码是可靠的，并为更广泛的生物多样性评估提供了一条途径，其性能优于估计物种丰富度的传统方法。对于更多样化的淡水系统和跨海洋系统，eDNA 元条形码报告的物种丰富度值与传统方法相似；然而，需要在这些环境中进行更多研究以更好地评估相对性能。在具有更大生物多样性的系统中，eDNA 元条形码将需要更多的参考数据库、更多的采样工作和多标记分析，以确保可靠的物种丰富度估计，以进一步验证该方法。eDNA 元条形码是可靠的，并为更广泛的生物多样性评估提供了一条途径，其性能优于估计物种丰富度的传统方法。对于更多样化的淡水系统和跨海洋系统，eDNA 元条形码报告的物种丰富度值与传统方法相似；然而，需要在这些环境中进行更多研究以更好地评估相对性能。在具有更大生物多样性的系统中，eDNA 元条形码将需要更多的参考数据库、更多的采样工作和多标记分析，以确保可靠的物种丰富度估计，以进一步验证该方法。eDNA 元条形码是可靠的，并为更广泛的生物多样性评估提供了一条途径，其性能优于估计物种丰富度的传统方法。在具有更大生物多样性的系统中，eDNA 元条形码将需要更多的参考数据库、更多的采样工作和多标记分析，以确保可靠的物种丰富度估计，以进一步验证该方法。eDNA 元条形码是可靠的，并为更广泛的生物多样性评估提供了一条途径，其性能优于估计物种丰富度的传统方法。在具有更大生物多样性的系统中，eDNA 元条形码将需要更多的参考数据库、更多的采样工作和多标记分析，以确保可靠的物种丰富度估计，以进一步验证该方法。eDNA 元条形码是可靠的，并为更广泛的生物多样性评估提供了一条途径，其性能优于估计物种丰富度的传统方法。