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Genomic differences between Campylobacter jejuni isolates identify surface membrane and flagellar function gene products potentially important for colonizing the chicken intestine.
Functional & Integrative Genomics ( IF 3.9 ) Pub Date : 2008-07-01 , DOI: 10.1007/s10142-008-0087-6
Kelli L Hiett 1 , Alain Stintzi , Tracy M Andacht , Robin L Kuntz , Bruce S Seal
Affiliation  

Campylobacter spp. are one of the leading bacterial etiologic agents of acute human gastroenteritis among industrialized countries. Poultry are implicated as a major source of the organism for human illness; however, the factors involved with colonization of poultry gastrointestinal systems remain unclear. Genomics and proteomics analyses were used to identify differences between poor- versus robust-colonizing Campylobacter jejuni isolates, 11168(GS) and A74/C, respectively. Sequence analyses of subtracted DNA resulted in A74/C-specifc genes similar to a dimethyl sulfoxide reductase, a serine protease, polysaccharide modification proteins, and restriction modification proteins. DNA microarray analyses were performed for comparison of A74/C to the complete genome sequences published for two C. jejuni. A total of 114 genes (7.1%) were determined absent from A74/C relative to those genomes. Additionally, proteomics was completed on both soluble and membrane protein extracts from 11168(GS) and A74/C. Variation in protein expression and physical characteristics such as pI was detected between the two isolates that included the major outer membrane protein, flagella, and aconitate hydratase. Several proteins including cysteine synthase and a Ni/Fe hydrogenase were determined to be differentially present between the two isolates. Finally, DNA hybridization analyses of 19 C. jejuni isolates recovered from chickens and humans worldwide over the past 20 years were performed to determine the distribution of a subset of differentially identified gene sequences.

中文翻译:

空肠弯曲杆菌分离株之间的基因组差异确定表面膜和鞭毛功能基因产物对鸡肠道定植可能很重要。

弯曲杆菌属 是工业化国家中急性人类胃肠炎的主要细菌病原体之一。家禽被认为是人类疾病的主要有机体来源;然而,与家禽胃肠系统定植有关的因素仍不清楚。基因组学和蛋白质组学分析分别用于确定定殖较差的空肠弯曲杆菌与健壮的空肠弯曲杆菌分离株、11168(GS) 和 A74/C 之间的差异。扣除 DNA 的序列分析导致 A74/C 特异性基因类似于二甲亚砜还原酶、丝氨酸蛋白酶、多糖修饰蛋白和限制性修饰蛋白。进行了 DNA 微阵列分析,以将 A74/C 与公开的两个空肠弯曲杆菌的完整基因组序列进行比较。共有 114 个基因(7. 1%) 被确定为 A74/C 相对于那些基因组不存在。此外,还对 11168(GS) 和 A74/C 的可溶性蛋白和膜蛋白提取物进行了蛋白质组学研究。在包括主要外膜蛋白、鞭毛和乌头酸水合酶的两个分离株之间检测到蛋白质表达和物理特征(如 pI)的变化。包括半胱氨酸合酶和 Ni/Fe 氢化酶在内的几种蛋白质被确定为在两种分离物之间存在差异。最后,对过去 20 年从全世界的鸡和人类中回收的 19 株空肠弯曲杆菌进行 DNA 杂交分析,以确定差异鉴定基因序列子集的分布。对 11168(GS) 和 A74/C 的可溶性蛋白和膜蛋白提取物进行了蛋白质组学研究。在包括主要外膜蛋白、鞭毛和乌头酸水合酶的两个分离株之间检测到蛋白质表达和物理特征(如 pI)的变化。包括半胱氨酸合酶和 Ni/Fe 氢化酶在内的几种蛋白质被确定为在两种分离物之间存在差异。最后,对过去 20 年从全世界的鸡和人类中回收的 19 株空肠弯曲杆菌进行 DNA 杂交分析,以确定差异鉴定基因序列子集的分布。对 11168(GS) 和 A74/C 的可溶性蛋白和膜蛋白提取物进行了蛋白质组学研究。在包括主要外膜蛋白、鞭毛和乌头酸水合酶的两个分离株之间检测到蛋白质表达和物理特征(如 pI)的变化。包括半胱氨酸合酶和 Ni/Fe 氢化酶在内的几种蛋白质被确定为在两种分离物之间存在差异。最后,对过去 20 年从全世界的鸡和人类中回收的 19 株空肠弯曲杆菌进行 DNA 杂交分析,以确定差异鉴定基因序列子集的分布。和乌头酸水合酶。包括半胱氨酸合酶和 Ni/Fe 氢化酶在内的几种蛋白质被确定为在两种分离物之间存在差异。最后,对过去 20 年从全世界的鸡和人类中回收的 19 株空肠弯曲杆菌进行 DNA 杂交分析,以确定差异鉴定基因序列子集的分布。和乌头酸水合酶。包括半胱氨酸合酶和 Ni/Fe 氢化酶在内的几种蛋白质被确定为在两种分离物之间存在差异。最后,对过去 20 年从全世界的鸡和人类中回收的 19 株空肠弯曲杆菌进行 DNA 杂交分析,以确定差异鉴定基因序列子集的分布。
更新日期:2019-11-01
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