BACKGROUND In the field of malignant hematology, most microbiome studies have focused on recipients of allogeneic hematopoietic cell transplantation (allo-HCT). As a result, this population has remained the primary target for novel microbiota therapeutics. Because the types of insults to the microbiome are similar during hematopoietic cell transplantation and intensive antileukemia therapy, this study evaluated whether the dysbiosis states are similar in the 2 settings. METHODS This study compared gut microbiota assemblages and community domination states in 2 cohorts of patients: patients with intensively treated acute leukemia (AL) and allo-HCT recipients. 16S ribosomal RNA gene profiling of thrice weekly stool samples was performed. Linear discriminant analysis effect size was used to determine differentially abundant taxa in groups of interest, and mixed modes were used to determine the predictors of microbiome states. RESULTS Microbiome changes in both cohorts were characterized by a marked loss of diversity and domination of low-diversity communities by Enterococcus. In the AL cohort, the relative abundance of Lactobacillus was also inversely correlated with diversity. Communities dominated by these genera were compositionally different. CONCLUSIONS Similarities in microbiota assemblages between the 2 cohorts support a broader scope for microbiota-directed therapeutics than previously considered, whereas specific differences suggest a personalized aspect to such therapeutics with the possibility of a differential response.

中文翻译：

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抗白血病化学疗法与异基因造血细胞移植过程中的肠道营养不良。

背景技术在恶性血液学领域，大多数微生物组研究集中于同种异体造血细胞移植（allo-HCT）的接受者。结果，该人群仍然是新型微生物治疗的主要目标。由于在造血细胞移植和强化抗白血病治疗过程中，对微生物组的侵害类型相似，因此本研究评估了两种环境下的营养不良状态是否相似。方法该研究比较了两组患者的肠道菌群和社区支配状态：急性白血病（AL）强化治疗的患者和异源HCT接受者。每周进行三次三次粪便样品的16S核糖体RNA基因谱分析。线性判别分析效果大小用于确定感兴趣组中差异丰富的分类单元，混合模式用于确定微生物组状态的预测因子。结果两组人群的微生物组变化均以肠球菌显着丧失多样性和支配低多样性群落为特征。在AL队列中，乳酸杆菌的相对丰度也与多样性成反比。这些属主导的社区在组成上有所不同。结论这两个队列之间在微生物群组合上的相似性为微生物群定向治疗提供了比先前考虑的更广泛的范围，而具体的差异则暗示了这种治疗的个性化方面，可能会产生不同的反应。混合模式用于确定微生物组状态的预测因子。结果两组人群的微生物组变化均以肠球菌显着丧失多样性和支配低多样性群落为特征。在AL队列中，乳酸杆菌的相对丰度也与多样性成反比。这些属主导的社区在组成上有所不同。结论这两个队列之间在微生物群组合上的相似性为微生物群定向治疗提供了比先前考虑的更广泛的范围，而具体的差异则暗示了这种治疗的个性化方面，可能会产生不同的反应。混合模式用于确定微生物组状态的预测因子。结果两组人群的微生物组变化均以肠球菌显着丧失多样性和支配低多样性群落为特征。在AL队列中，乳酸杆菌的相对丰度也与多样性成反比。这些属主导的社区在组成上有所不同。结论这两个队列之间在微生物群组合上的相似性为微生物群定向治疗提供了比先前考虑的更广泛的范围，而具体的差异则暗示了这种治疗的个性化方面，可能会产生不同的反应。结果两组人群的微生物组变化均以肠球菌显着丧失多样性和支配低多样性群落为特征。在AL队列中，乳酸杆菌的相对丰度也与多样性成反比。这些属主导的社区在组成上有所不同。结论这两个队列之间在微生物群组合上的相似性为微生物群定向治疗提供了比先前考虑的更广泛的范围，而具体的差异则暗示了这种治疗的个性化方面，可能会产生不同的反应。结果两组人群的微生物组变化均以肠球菌显着丧失多样性和支配低多样性群落为特征。在AL队列中，乳酸杆菌的相对丰度也与多样性成反比。这些属主导的社区在组成上有所不同。结论这两个队列之间在微生物群组合上的相似性为微生物群定向治疗提供了比先前考虑的更广泛的范围，而具体的差异则暗示了这种治疗的个性化方面，并可能产生不同的反应。