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将药物化学扩展到3D领域:金属碎片作为3D支架用于基于片段的药物发现
Chemical Science ( IF 7.6 ) Pub Date : 2019-12-12 00:00:00 , DOI: 10.1039/c9sc05586j
Christine N. Morrison 1, 2, 3, 4 , Kathleen E. Prosser 1, 2, 3, 4 , Ryjul W. Stokes 1, 2, 3, 4 , Anna Cordes 5, 6, 7, 8, 9 , Nils Metzler-Nolte 5, 6, 7, 8, 9 , Seth M. Cohen 1, 2, 3, 4
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基于片段的药物发现(FBDD)是识别新的生物活性分子的有力策略。FBDD依赖通常大小适中但化学多样性高的片段库。尽管在许多方面都已在FBDD库中实现了良好的化学多样性,但要实现形状多样性(尤其是具有三维(3D)结构的片段)仍然具有挑战。最近的分析表明,所有常规有机片段中超过75%的形状主要为1D或至多为2D。但是,由于分子形状是生物分子识别分子中最重要的因素之一,因此特别需要3D片段。为了应对这一挑战,作者使用惰性金属配合物(所谓的“金属片段”(mFs))构建了一个3D片段库。他们制备了一个71种化合物的适度数据库,其具有丰富的形状多样性(通过归一化的主惯性矩(PMI)分析测得)。PMI分析表明,与包含更多数量级的分子的常规有机片段库相比,这些金属片段占据了一个独特且具有高度未代表性的片段空间区域。通过对几种不同类型的蛋白质靶标(包括抗病毒、抗菌和抗癌靶标)进行筛选,证明了该金属片段库具有潜在价值。作者成功确定了一类含有几种蛋白质的片段的IC50和热移值,从而验证了该金属片段对未来先导发展的适应性。这些发现证明了mF库用于获得针对各种蛋白质靶标的FBDD的未充分利用3D片段空间。




中文翻译:

将药物化学扩展到3D领域:金属碎片作为3D支架用于基于片段的药物发现

基于片段的药物发现(FBDD)是识别新的生物活性分子的有力策略。FBDD依赖通常大小适中但化学多样性高的片段库。尽管在许多方面都已在FBDD库中实现了良好的化学多样性,但要实现形状多样性(尤其是具有三维(3D)结构的片段)仍然具有挑战。最近的分析表明,所有常规有机片段中超过75%的形状主要为1D或至多为2D。但是,由于分子形状是生物分子识别分子中最重要的因素之一,因此特别需要3D片段。为了应对这一挑战,作者使用惰性金属配合物(所谓的“金属片段”(mFs))建成了一个3D片段库。他们制备了一个71种化合物的适度数据库,其具有丰富的形状多样性(通过归一化的主惯性矩(PMI)分析测得)。库类别,这些金属片段残留了一个独特且具有高度未定义的片段空间区域。通过对几种不同类型的蛋白质靶标(包括抗病毒,抗菌和抗癌靶标)进行筛选,证明了该金属片段库具有潜在价值。作者成功确定了一类包含多个蛋白质的片段的IC 50和热移值,从而验证了该金属片段对未来先导发展的适应性。种蛋白质靶标的FBDD的未充分利用3D片段空间。


更新日期:2019-12-13
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