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Integrated analysis of exosomal lncRNA and mRNA expression profiles reveals the involvement of lnc-MKRN2-42:1 in the pathogenesis of Parkinson's disease.
CNS Neuroscience & Therapeutics ( IF 4.8 ) Pub Date : 2019-12-08 , DOI: 10.1111/cns.13277
Qiao Wang 1, 2 , Chun-Lei Han 1, 2 , Kai-Liang Wang 1, 2 , Yun-Peng Sui 1, 2 , Zhi-Bao Li 1, 2 , Ning Chen 3 , Shi-Ying Fan 1, 2 , Michitomo Shimabukuro 1, 2 , Feng Wang 4 , Fan-Gang Meng 1, 2, 3
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BACKGROUND Parkinson's disease (PD) is a common movement disorder for which diagnosis mainly depends on the medical history and clinical symptoms. Exosomes are now considered an additional mechanism for intercellular communication, allowing cells to exchange proteins, lipids, and genetic material. Long noncoding (lnc) RNA in exosomes plays a critical role in many diseases, including neurodegenerative disease. AIM To study expression differences for lncRNAs in peripheral blood exosomes of PD patients compared with healthy individuals and to look for lncRNAs that might be related to the pathogenesis of PD. MATERIALS AND METHODS We recruited PD patients along with age- and sex-matched healthy individuals as healthy controls and evaluated levels of lncRNAs extracted from exosomes in plasma samples via next-generation sequencing and real-time quantitative PCR. Correlation analysis was conducted for the clinical characteristics of PD patients and the expression of selected lncRNAs. RESULTS We found 15 upregulated and 24 downregulated exosomal lncRNAs in the PD group. According to bioinformatics analyses, we chose lnc-MKRN2-42:1 for further study. Interestingly, lnc-MKRN2-42:1 was positively correlated with the MDS-UPDRS III score for PD patients. CONCLUSION Our study suggested that lnc-MKRN2-42:1 may be involved in the occurrence and development of PD.

中文翻译:

外泌体 lncRNA 和 mRNA 表达谱的综合分析揭示了 lnc-MKRN2-42:1 参与帕金森病的发病机制。

背景帕金森病(PD)是一种常见的运动障碍,其诊断主要取决于病史和临床症状。外泌体现在被认为是细胞间通讯的一种额外机制,允许细胞交换蛋白质、脂质和遗传物质。外泌体中的长链非编码 (lnc) RNA 在包括神经退行性疾病在内的许多疾病中起着关键作用。目的 研究与健康人相比,PD患者外周血外泌体lncRNAs的表达差异,寻找可能与PD发病机制相关的lncRNAs。材料和方法 我们招募了 PD 患者以及年龄和性别匹配的健康个体作为健康对照,并通过下一代测序和实时定量 PCR 评估了从血浆样品中的外泌体中提取的 lncRNA 的水平。对PD患者的临床特征与所选lncRNAs的表达进行相关分析。结果 我们在 PD 组中发现了 15 个上调和 24 个下调的外泌体 lncRNA。根据生物信息学分析,我们选择 lnc-MKRN2-42:1 进行进一步研究。有趣的是,lnc-MKRN2-42:1 与 PD 患者的 MDS-UPDRS III 评分呈正相关。结论 本研究提示lnc-MKRN2-42:1可能参与了PD的发生发展。对PD患者的临床特征与所选lncRNAs的表达进行相关分析。结果 我们在 PD 组中发现了 15 个上调和 24 个下调的外泌体 lncRNA。根据生物信息学分析,我们选择 lnc-MKRN2-42:1 进行进一步研究。有趣的是,lnc-MKRN2-42:1 与 PD 患者的 MDS-UPDRS III 评分呈正相关。结论 本研究提示lnc-MKRN2-42:1可能参与了PD的发生发展。对PD患者的临床特征与所选lncRNAs的表达进行相关分析。结果 我们在 PD 组中发现了 15 个上调和 24 个下调的外泌体 lncRNA。根据生物信息学分析,我们选择 lnc-MKRN2-42:1 进行进一步研究。有趣的是,lnc-MKRN2-42:1 与 PD 患者的 MDS-UPDRS III 评分呈正相关。结论 本研究提示lnc-MKRN2-42:1可能参与了PD的发生发展。
更新日期:2019-12-08
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