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Active repurposing of drug candidates for melanoma based on GWAS, PheWAS and a wide range of omics data
Molecular Medicine ( IF 6.0 ) Pub Date : 2019-06-20 , DOI: 10.1186/s10020-019-0098-x
Ali Khosravi 1 , B Jayaram 2 , Bahram Goliaei 3 , Ali Masoudi-Nejad 1
Affiliation  

BackgroundDrug repurposing is a swift, safe, and cheap drug discovery method. Melanoma disorders present low survival and high mortality rates and are challenging to diagnose and treat. Moreover, there is a high volume of worldwide investigations that are attempting to find melanoma-related genes of influence, which can be identified as responsive targets for reliable treatment.MethodIn this study, we used a wide range of data analyses to analyze over 1100 genes and proteins of influence with respect to cutaneous malignant melanoma. Our analysis included various investigational results from genome- and phenome-wide association studies (GWAS and PheWAS, respectively), biomedical, transcriptomic, and metabolomic datasets. We then researched the DrugBank for potential melanoma targets from the selected list. We excluded known melanoma targets to obtain a list of druggable proteins. We performed a precise analysis of the drugs’ pathogenesis and checked the expression profiles of the selected drugs having high associations with known anti-melanoma drugs.ResultWe found 35 drugs that interacted with 20 unique targets. These drugs appear to have high melanoma treatment potentials. We confirmed our results with previous studies and found supporting references for 30 of these drugs.In conclusion, this investigation can be applied to various diseases for the efficient and economical repurposing of various drug compounds. For further validation, the results may be applicable for in vivo tests and clinical trials.

中文翻译:

基于 GWAS、PheWAS 和广泛的组学数据积极重新利用黑色素瘤候选药物

背景药物再利用是一种快速、安全且廉价的药物发现方法。黑色素瘤疾病存在低存活率和高死亡率,并且诊断和治疗具有挑战性。此外,世界范围内有大量调查试图找到与黑色素瘤相关的影响基因,这些基因可以被确定为可靠治疗的响应目标。 方法在这项研究中,我们使用广泛的数据分析来分析 1100 多个基因和影响皮肤恶性黑色素瘤的蛋白质。我们的分析包括来自全基因组和全表型关联研究(分别为 GWAS 和 PheWAS)、生物医学、转录组学和代谢组学数据集的各种调查结果。然后,我们从选定的列表中研究了 DrugBank 中潜在的黑色素瘤靶点。我们排除了已知的黑色素瘤靶标以获得可成药蛋白质的列表。我们对药物的发病机制进行了精确分析,并检查了与已知抗黑色素瘤药物具有高度关联的所选药物的表达谱。结果我们发现了与 20 个独特靶点相互作用的 35 种药物。这些药物似乎具有很高的黑色素瘤治疗潜力。我们与之前的研究证实了我们的结果,并找到了其中 30 种药物的支持参考。总而言之,本研究可以应用于各种疾病,以实现对各种药物化合物的高效、经济的再利用。为了进一步验证,结果可能适用于体内测试和临床试验。我们对药物的发病机制进行了精确分析,并检查了与已知抗黑色素瘤药物高度相关的所选药物的表达谱。结果我们发现了与20个独特靶点相互作用的35种药物。这些药物似乎具有很高的黑色素瘤治疗潜力。我们与之前的研究证实了我们的结果,并找到了其中 30 种药物的支持参考。总而言之,本研究可以应用于各种疾病,以实现对各种药物化合物的高效、经济的再利用。为了进一步验证,结果可能适用于体内测试和临床试验。我们对药物的发病机制进行了精确分析,并检查了与已知抗黑色素瘤药物具有高度关联的所选药物的表达谱。结果我们发现了与 20 个独特靶点相互作用的 35 种药物。这些药物似乎具有很高的黑色素瘤治疗潜力。我们与之前的研究证实了我们的结果,并找到了其中 30 种药物的支持参考。总而言之,本研究可以应用于各种疾病,以实现对各种药物化合物的高效、经济的再利用。为了进一步验证,结果可能适用于体内测试和临床试验。我们与之前的研究证实了我们的结果,并找到了其中 30 种药物的支持参考。总而言之,本研究可以应用于各种疾病,以实现对各种药物化合物的高效、经济的再利用。为了进一步验证,结果可能适用于体内测试和临床试验。我们与之前的研究证实了我们的结果,并找到了其中 30 种药物的支持参考。总而言之,本研究可以应用于各种疾病,以实现对各种药物化合物的高效、经济的再利用。为了进一步验证,结果可能适用于体内测试和临床试验。
更新日期:2019-06-20
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