Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your
feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)
LINC01149 variant modulates MICA expression that facilitates hepatitis B virus spontaneous recovery but increases hepatocellular carcinoma risk.
Oncogene ( IF 6.9 ) Pub Date : 2019-11-21 , DOI: 10.1038/s41388-019-1117-7 Rong Zhong 1 , Jianbo Tian 1 , Mingpeng Fu 2 , Simin Ma 2 , Li Liu 3 , Jiaoyuan Li 1 , Na Shen 4 , Juntao Ke 1 , Yang Yang 1 , Yajie Gong 1 , Ying Zhu 1 , Ying Wang 5 , Jing Gong 1 , Jiang Chang 1 , Ping Lei 2 , Xiang Cheng 6 , Kun Huang 7 , Guanxin Shen 2 , Xiaoping Miao 1
Oncogene ( IF 6.9 ) Pub Date : 2019-11-21 , DOI: 10.1038/s41388-019-1117-7 Rong Zhong 1 , Jianbo Tian 1 , Mingpeng Fu 2 , Simin Ma 2 , Li Liu 3 , Jiaoyuan Li 1 , Na Shen 4 , Juntao Ke 1 , Yang Yang 1 , Yajie Gong 1 , Ying Zhu 1 , Ying Wang 5 , Jing Gong 1 , Jiang Chang 1 , Ping Lei 2 , Xiang Cheng 6 , Kun Huang 7 , Guanxin Shen 2 , Xiaoping Miao 1
Affiliation
|
Interpreting disease-causing variants, especially in noncoding regions by genome-wide association studies (GWAS), has become one of the most challenging and demanding tasks. We hypothesized that functional lncRNAs variants in GWAS-identified loci might alter expression level of genes associated with persistent HBV infection and hepatocellular carcinoma (HCC). Integrated bioinformatics approaches were used to prioritize potentially functional variants and a two-stage case-control study (2473 HBV positive HCC patients, 2248 persistent HBV carriers and 2294 spontaneously recovered subjects) was performed to assess the roles of these variants. The rs2844512 G > C variant in LINC01149 was identified to facilitate HBV spontaneous recovery (OR = 0.84, 95% CI = 0.77-0.92) but increase the risk of HCC (OR = 1.21, 95% CI = 1.11-1.32) in combined samples. Subsequent biological assays indicated this variant created a binding site for miR-128-3p and upregulated MICA expression by serving as a miRNA sponge, which might recruit NK-cells to lyse infected cells, but release highly soluble MICA by shedding to induce NK-cells exhaustion and tumor immune evasion. These findings highlight a regulatory circuit between LINC01149 and MICA, mediating by miR-128-3p, and the important role of upregulated MICA in conferring susceptibility to persistent HBV infection and HCC.
中文翻译：
LINC01149 变体调节 MICA 表达，促进乙型肝炎病毒自发恢复，但增加肝细胞癌风险。
通过全基因组关联研究 (GWAS) 解释致病变异，特别是在非编码区域，已成为最具挑战性和要求最高的任务之一。我们假设 GWAS 识别的基因座中的功能性 lncRNA 变体可能会改变与持续性 HBV 感染和肝细胞癌 (HCC) 相关的基因的表达水平。综合生物信息学方法用于优先考虑潜在的功能变异，并进行了两阶段病例对照研究（2473 名 HBV 阳性 HCC 患者、2248 名持续性 HBV 携带者和 2294 名自发康复的受试者）来评估这些变异的作用。LINC01149 中的 rs2844512 G > C 变异被鉴定为促进 HBV 自发恢复（OR = 0.84, 95% CI = 0.77-0.92），但增加了合并样本中 HCC 的风险（OR = 1.21, 95% CI = 1.11-1.32） . 随后的生物学分析表明，该变体为 miR-128-3p 创造了一个结合位点，并通过充当 miRNA 海绵上调 MICA 表达，这可能会募集 NK 细胞以裂解受感染的细胞，但通过脱落以诱导 NK 细胞释放高度可溶的 MICA衰竭和肿瘤免疫逃避。这些发现强调了 LINC01149 和 MICA 之间由 miR-128-3p 介导的调节回路，以及上调的 MICA 在赋予持续性 HBV 感染和 HCC 易感性中的重要作用。
更新日期：2019-11-21
中文翻译：
LINC01149 变体调节 MICA 表达，促进乙型肝炎病毒自发恢复，但增加肝细胞癌风险。
通过全基因组关联研究 (GWAS) 解释致病变异，特别是在非编码区域，已成为最具挑战性和要求最高的任务之一。我们假设 GWAS 识别的基因座中的功能性 lncRNA 变体可能会改变与持续性 HBV 感染和肝细胞癌 (HCC) 相关的基因的表达水平。综合生物信息学方法用于优先考虑潜在的功能变异，并进行了两阶段病例对照研究（2473 名 HBV 阳性 HCC 患者、2248 名持续性 HBV 携带者和 2294 名自发康复的受试者）来评估这些变异的作用。LINC01149 中的 rs2844512 G > C 变异被鉴定为促进 HBV 自发恢复（OR = 0.84, 95% CI = 0.77-0.92），但增加了合并样本中 HCC 的风险（OR = 1.21, 95% CI = 1.11-1.32） . 随后的生物学分析表明，该变体为 miR-128-3p 创造了一个结合位点，并通过充当 miRNA 海绵上调 MICA 表达，这可能会募集 NK 细胞以裂解受感染的细胞，但通过脱落以诱导 NK 细胞释放高度可溶的 MICA衰竭和肿瘤免疫逃避。这些发现强调了 LINC01149 和 MICA 之间由 miR-128-3p 介导的调节回路，以及上调的 MICA 在赋予持续性 HBV 感染和 HCC 易感性中的重要作用。
京公网安备 11010802027423号