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A decade of enterovirus genetic diversity in Belgium.
Journal of Clinical Virology ( IF 4.0 ) Pub Date : 2019-10-25 , DOI: 10.1016/j.jcv.2019.104205
Elke Wollants 1 , Leen Beller 2 , Kurt Beuselinck 3 , Mandy Bloemen 1 , Katrien Lagrou 4 , Marijke Reynders 5 , Marc Van Ranst 6
Affiliation  

BACKGROUND Enteroviruses are responsible for a wide range of clinical symptoms.Enterovirus D68 was already known to cause mild to severe respiratory infections, but in the last few years, it has also been associated with neurological symptoms and acute flaccid paralysis. OBJECTIVES In this epidemiological surveillance in Belgium, 1521 enteroviruspositive samples were genotyped. STUDY DESIGN Enterovirus-positive patient samples were collected from the University Hospitals Leuven and other hospitals and medical practices in Belgium from 2007 to 2018. Molecular typing was done by RT-PCR using different primers sets. EV-A and EV-B were typed by sequencing part of VP1. For EVC and EV-D, the VP4/VP2 region was used together with the non-coding region. RESULTS In this epidemiological survey with samples collected over 12 years, 35 different EV types were detected in 1521 patient samples. Enterovirus species B was by far the most dominant species in our samples (93%). Echovirus 30 was most frequently found (24%), followed by echovirus 6 (8%) and echovirus 9 (7%). In 2018, there was an outbreak for the first time of enterovirus D68 with severe respiratory infections but no acute flaccid paralysis. Phylogenetic analyses showed that the collected outbreak strains coexist in different clades. CONCLUSIONS For more than a decade, the circulating enterovirus strains were investigated in Belgium. During this time span, echovirus 30 was the most frequently detected and peaked every 3 years. Enterovirus D68 began an upsurge in 2018, but thus far without being clinically associated with acute flaccid paralysis.

中文翻译:

比利时肠病毒遗传多样性十年。

背景肠道病毒是造成多种临床症状的原因。已知肠道病毒D68会引起轻度至重度呼吸道感染,但在最近几年中,它还与神经系统症状和急性弛缓性麻痹相关。目的在比利时进行的这种流行病学监测中,对1521例肠道病毒阳性样本进行了基因分型。研究设计2007年至2018年间,从比利时鲁汶大学医院以及比利时的其他医院和医疗机构收集了肠病毒阳性的患者样本。使用不同的引物对样本进行RT-PCR进行分子分型。EV-A和EV-B是通过对VP1的部分序列进行分型的。对于EVC和EV-D,VP4 / VP2区域与非编码区域一起使用。结果在这项流行病学调查中,我们收集了12年以上的样本,在1521个患者样本中检测到35种不同的EV类型。肠病毒种B是迄今为止在我们的样本中占主导地位的种(93%)。最常见的是回声病毒30(24%),其次是回声病毒6(8%)和回声病毒9(7%)。2018年,首次爆发了严重呼吸道感染但没有急性弛缓性麻痹的肠道病毒D68。系统发育分析表明,收集到的暴发菌株共存于不同进化枝中。结论十多年来,在比利时对循环肠道病毒株进行了研究。在此时间段内,回声病毒30被检测到频率最高,并且每3年达到峰值。肠病毒D68于2018年开始高涨,但到目前为止尚未在临床上与急性弛缓性麻痹相关。肠病毒种B是迄今为止在我们的样本中占主导地位的种(93%)。最常见的是回声病毒30(24%),其次是回声病毒6(8%)和回声病毒9(7%)。2018年,首次爆发了严重呼吸道感染但没有急性弛缓性麻痹的肠道病毒D68。系统发育分析表明,收集到的暴发菌株共存于不同进化枝中。结论十多年来,在比利时对循环肠道病毒株进行了研究。在此时间段内,回声病毒30被检测到频率最高,并且每3年达到峰值。肠病毒D68于2018年开始高涨,但到目前为止尚未在临床上与急性弛缓性麻痹相关。肠病毒种B是迄今为止在我们的样本中占主导地位的种(93%)。最常见的是回声病毒30(24%),其次是回声病毒6(8%)和回声病毒9(7%)。2018年,首次爆发了严重呼吸道感染但没有急性弛缓性麻痹的肠道病毒D68。系统发育分析表明,收集到的暴发菌株共存于不同进化枝中。结论十多年来,在比利时对循环肠道病毒株进行了研究。在此时间段内,回声病毒30被检测到频率最高,并且每3年达到峰值。肠病毒D68于2018年开始高涨,但到目前为止尚未在临床上与急性弛缓性麻痹相关。其次是echovirus 6(8%)和echovirus 9(7%)。2018年,首次爆发了严重呼吸道感染但没有急性弛缓性麻痹的肠道病毒D68。系统发育分析表明,收集到的暴发菌株共存于不同进化枝中。结论十多年来,在比利时对循环肠道病毒株进行了研究。在此时间段内,回声病毒30被检测到频率最高,并且每3年达到峰值。肠病毒D68于2018年开始高涨,但到目前为止尚未在临床上与急性弛缓性麻痹相关。其次是echovirus 6(8%)和echovirus 9(7%)。2018年,首次爆发了严重呼吸道感染但没有急性弛缓性麻痹的肠道病毒D68。系统发育分析表明,收集到的暴发菌株共存于不同进化枝中。结论十多年来,在比利时对循环肠道病毒株进行了研究。在此时间段内,回声病毒30被检测到频率最高,并且每3年达到峰值。肠病毒D68于2018年开始高涨,但到目前为止尚未在临床上与急性弛缓性麻痹相关。结论十多年来,在比利时对循环肠道病毒株进行了研究。在此时间段内,回声病毒30被检测到频率最高,并且每3年达到峰值。肠病毒D68于2018年开始高涨,但到目前为止尚未在临床上与急性弛缓性麻痹相关。结论十多年来,在比利时对循环肠道病毒株进行了研究。在此时间段内,回声病毒30被检测到频率最高,并且每3年达到峰值。肠病毒D68于2018年开始高涨,但到目前为止尚未在临床上与急性弛缓性麻痹相关。
更新日期:2019-10-25
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