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使用1类整合子整合酶基因作为人为污染的替代物。
The ISME Journal ( IF 10 ) Pub Date : 2015-Jun-01 , DOI: 10.1038/ismej.2014.226 Michael R Gillings , William H Gaze , Amy Pruden , Kornelia Smalla , James M Tiedje , Yong-Guan Zhu
The ISME Journal ( IF 10 ) Pub Date : 2015-Jun-01 , DOI: 10.1038/ismej.2014.226 Michael R Gillings , William H Gaze , Amy Pruden , Kornelia Smalla , James M Tiedje , Yong-Guan Zhu
在整个人类活动中,都存在着农药,重金属,药品,个人护理产品以及与人类废物流和农业有关的微生物污染的区域。这种污染物的浓度随时间而变化的多样性是监测的主要挑战。在这里,我们认为临床1类整合素整合酶基因intI1的相对丰度是污染的良好替代,因为:(1)intI1与赋予对抗生素,消毒剂和重金属的抗性的基因相关;(2)在多种致病性和非致病性细菌中发现;(3)它的丰度可以快速变化,因为它的宿主细胞可以快速生成,并且可以通过水平基因转移在细菌之间移动。(4)现在在各种各样的异种分子中发现了intI1的单个DNA序列变异体,这些是通过人类选择机构固定的复杂的镶嵌DNA分子。在这里,我们回顾了研究人为影响与intI1丰度之间关系的文献,并概述了intI1可以用作人为污染的替代方法。
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