异戊烯基二磷酸 (IPP) 是类异戊二烯生物合成的核心中间体，类异戊二烯是最古老、最多样化的一类天然产物。自然界中存在两种不同的 IPP 生物合成途径：甲羟戊酸途径和最近发现的脱氧木酮糖 5-磷酸 (DXP) 途径。参与这两条途径的酶的进化历史及其基因在基因组中的系统发育分布表明，甲羟戊酸途径与古细菌有密切关系，DXP途径与真细菌有密切关系，真核生物从原核生物遗传了IPP生物合成的基因。DXP 途径特异基因的出现仅限于携带质体的真核生物，表明这些基因是从质体的蓝细菌祖先获得的。然而，除了一个例外，这些基因的个体系统发育并没有为植物基因与其蓝藻同源物之间的特定亲和力提供证据。结果表明，质体起源后真细菌之间的横向基因转移在该途径的进化中发挥了重要作用。



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