The baculovirus Spodoptera littoralis nucleopolyhedrovirus (SpliNPV) is an entomopathogenic virus utilized as a biological control agent of the Egyptian cotton leaf worm, Spodoptera littoralis. Several studies have focused on the identification of different SpliNPV isolates from a biological and molecular point of view, but few of them conducted in-depth analyses of the genomic composition of these isolates. Identification of a novel isolate of SpliNPV, termed Tun2, which was purified from infected S. littoralis larvae from Tunisia was reported. This isolate was propagated in vivo and its median lethal concentration (LC50) was determined to be 1.5 × 104 occlusion bodies (OBs)/ml for third instar S. littoralis larvae at 7 days of post-infection. OB production in late fourth instar larvae was estimated to be at least 2.7 × 109 OBs/g larval weight. The completely sequenced genome of SpliNPV-Tun2 was 137,099 bp in length and contained 132 open reading frames (ORF). It showed a 98.2% nucleotide identity to the Egyptian isolate SpliMNPV-AN1956, with some striking differences; between both genomes, insertion and deletion mutations were noticed in 9 baculovirus core genes, and also in the highly conserved polyhedrin gene. The homologs of ORF 106 and ORF 107 of SpliNPV-AN1956 appeared to be fused to a single ORF 106 in SpliNPV-Tun2, similar to the homologous ORF 110 in SpltNPV-G2. SpliNPV-Tun2 is proposed as a new variant of SpliNPV and a potential candidate for further evaluation as a biocontrol agent for S. littoralis and probably other Spodoptera species.

中文翻译：

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一个突尼斯分离的 Spodoptera littoralis 核多角体病毒 (SpliNPV-Tun2) 的生物学活性和基因组组成

杆状病毒 Spodoptera littoralis nucleopolyhedrovirus (SpliNPV) 是一种昆虫病原病毒，用作埃及棉叶虫 Spodoptera littoralis 的生物防治剂。一些研究从生物学和分子学的角度关注不同 SpliNPV 分离株的鉴定，但很少有人对这些分离株的基因组组成进行深入分析。据报道，鉴定了一种新的 SpliNPV 分离株，称为 Tun2，它是从突尼斯受感染的 S. littoralis 幼虫中纯化的。该分离物在体内繁殖，在感染后 7 天，其第三龄 S. littoralis 幼虫的中位致死浓度 (LC50) 确定为 1.5 × 104 个包涵体 (OB)/ml。估计晚期第四龄幼虫的 OB 产量至少为 2.7 × 109 OBs/g 幼虫体重。SpliNPV-Tun2 完全测序的基因组长度为 137,099 bp，包含 132 个开放阅读框 (ORF)。它与埃及分离株 SpliMNPV-AN1956 显示出 98.2% 的核苷酸同一性，但有一些显着差异；在两个基因组之间，在9个杆状病毒核心基因中发现了插入和缺失突变，在高度保守的多角体基因中也发现了插入和缺失突变。SpliNPV-AN1956 的 ORF 106 和 ORF 107 的同源物似乎融合到 SpliNPV-Tun2 中的单个 ORF 106，类似于 SpltNPV-G2 中的同源 ORF 110。SpliNPV-Tun2 被提议作为 SpliNPV 的一个新变体，并且是进一步评估作为 S. littoralis 和可能其他 Spodoptera 物种的生物防治剂的潜在候选者。与埃及分离株 SpliMNPV-AN1956 有 2% 的核苷酸同一性，有一些显着差异；在两个基因组之间，在9个杆状病毒核心基因中发现了插入和缺失突变，在高度保守的多角体基因中也发现了插入和缺失突变。SpliNPV-AN1956 的 ORF 106 和 ORF 107 的同源物似乎融合到 SpliNPV-Tun2 中的单个 ORF 106，类似于 SpltNPV-G2 中的同源 ORF 110。SpliNPV-Tun2 被提议作为 SpliNPV 的一个新变体，并且是进一步评估作为 S. littoralis 和可能其他 Spodoptera 物种的生物防治剂的潜在候选者。与埃及分离株 SpliMNPV-AN1956 有 2% 的核苷酸同一性，有一些显着差异；在两个基因组之间，在9个杆状病毒核心基因中发现了插入和缺失突变，在高度保守的多角体基因中也发现了插入和缺失突变。SpliNPV-AN1956 的 ORF 106 和 ORF 107 的同源物似乎融合到 SpliNPV-Tun2 中的单个 ORF 106，类似于 SpltNPV-G2 中的同源 ORF 110。SpliNPV-Tun2 被提议作为 SpliNPV 的一个新变体，并且是进一步评估作为 S. littoralis 和可能其他 Spodoptera 物种的生物防治剂的潜在候选者。SpliNPV-AN1956 的 ORF 106 和 ORF 107 的同源物似乎融合到 SpliNPV-Tun2 中的单个 ORF 106，类似于 SpltNPV-G2 中的同源 ORF 110。SpliNPV-Tun2 被提议作为 SpliNPV 的一个新变体，并且是进一步评估作为 S. littoralis 和可能其他 Spodoptera 物种的生物防治剂的潜在候选者。SpliNPV-AN1956 的 ORF 106 和 ORF 107 的同源物似乎融合到 SpliNPV-Tun2 中的单个 ORF 106，类似于 SpltNPV-G2 中的同源 ORF 110。SpliNPV-Tun2 被提议作为 SpliNPV 的一个新变体，并且是进一步评估作为 S. littoralis 和可能其他 Spodoptera 物种的生物防治剂的潜在候选者。