Alpha taxonomy endeavours to propose a coherent vision of existing species and, simultaneously, to individualize the natural entities useful to understand evolutionary processes. This ideal is especially difficult when available data lack congruence. Here we address the polytypic species Synallaxis rutilans (ruddy spinetail), a suboscine passerine widely distributed in the Amazon Basin and whose taxonomy could, potentially, aid our understanding of processes shaping its biodiversity. Combining genetic [genomic ultraconserved elements (UCE) and mtDNA] and morphological data, we demonstrate that while delimitation of genetic lineages and their phylogenetic relationships are strongly associated with classic Amazonian geographic barriers, such as rivers, different coloration patterns appear to be more associated with local selection processes for phenotype. Employing an evolutionary approach, whereby the species is considered a taxonomic category, rather than a nomenclatural rank, we propose to recognize five species: S. amazonica, S. caquetensis, S. dissors, S. omissa and S. rutilans. The taxonomic arrangement proposed here permits better understanding of the similarities and differences among taxa from different areas of endemism, and represents patterns of genetic and morphological diversity resulting from distinct processes acting across certain time frames. This arrangement draws attention to the importance of understanding the evolutionary processes operating in the complex and constantly changing Amazonian landscape.

中文翻译：

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亚马孙 Synallaxis rut​​ilans 群 (Aves: Furnariidae) 中分子和形态学数据支持的不和谐进化情景带来的分类挑战

Alpha 分类努力提出对现有物种的连贯愿景，同时将有助于理解进化过程的自然实体个体化。当可用数据缺乏一致性时，这种理想尤其困难。在这里，我们讨论了多型物种 Synallaxis rut​​ilans（红棘尾），这是一种广泛分布在亚马逊盆地的亚鳞雀形目，其分类学可能有助于我们了解塑造其生物多样性的过程。结合遗传[基因组超保守元素（UCE）和mtDNA]和形态学数据，我们证明虽然遗传谱系的划定及其系统发育关系与经典的亚马逊地理障碍密切相关，例如河流，不同的着色模式似乎与表型的局部选择过程更相关。采用进化方法，将物种视为分类类别，而不是命名等级，我们建议识别五个物种：S. amazonica、S. caquetensis、S. dissors、S. omissa 和 S. rutilans。这里提出的分类安排可以更好地理解来自不同地方特有区域的分类群之间的相似性和差异，并代表由在特定时间框架内起作用的不同过程产生的遗传和形态多样性模式。这种安排引起了人们对理解在复杂且不断变化的亚马逊景观中运行的进化过程的重要性的关注。因此，该物种被认为是一个分类类别，而不是一个命名等级，我们建议识别五个物种：S. amazonica、S. caquetensis、S. dissors、S. omissa 和 S. rutilans。这里提出的分类安排可以更好地理解来自不同地方特有区域的分类群之间的相似性和差异，并代表由在特定时间框架内起作用的不同过程产生的遗传和形态多样性模式。这种安排引起了人们对理解在复杂且不断变化的亚马逊景观中运行的进化过程的重要性的关注。因此，该物种被认为是一个分类类别，而不是一个命名等级，我们建议识别五个物种：S. amazonica、S. caquetensis、S. dissors、S. omissa 和 S. rutilans。这里提出的分类安排可以更好地理解来自不同地方特有区域的分类群之间的相似性和差异，并代表由在特定时间框架内起作用的不同过程产生的遗传和形态多样性模式。这种安排引起了人们对理解在复杂且不断变化的亚马逊景观中运行的进化过程的重要性的关注。这里提出的分类安排可以更好地理解来自不同地方特有区域的分类群之间的相似性和差异，并代表由在特定时间框架内起作用的不同过程产生的遗传和形态多样性模式。这种安排引起了人们对理解在复杂且不断变化的亚马逊景观中运行的进化过程的重要性的关注。这里提出的分类安排可以更好地理解来自不同地方特有区域的分类群之间的相似性和差异，并代表由在特定时间框架内起作用的不同过程产生的遗传和形态多样性模式。这种安排引起了人们对理解在复杂且不断变化的亚马逊景观中运行的进化过程的重要性的关注。