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MIKB: A manually curated and comprehensive knowledge base for myocardial infarction
Computational and Structural Biotechnology Journal ( IF 4.4 ) Pub Date : 2021-11-16 , DOI: 10.1016/j.csbj.2021.11.011 Chaoying Zhan 1 , Yingbo Zhang 1, 2 , Xingyun Liu 1 , Rongrong Wu 1 , Ke Zhang 1 , Wenjing Shi 1 , Li Shen 1 , Ke Shen 1 , Xuemeng Fan 1 , Fei Ye 1 , Bairong Shen 1
Computational and Structural Biotechnology Journal ( IF 4.4 ) Pub Date : 2021-11-16 , DOI: 10.1016/j.csbj.2021.11.011 Chaoying Zhan 1 , Yingbo Zhang 1, 2 , Xingyun Liu 1 , Rongrong Wu 1 , Ke Zhang 1 , Wenjing Shi 1 , Li Shen 1 , Ke Shen 1 , Xuemeng Fan 1 , Fei Ye 1 , Bairong Shen 1
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Myocardial infarction knowledge base (MIKB; ; latest update: December 31, 2020) is an open-access and manually curated database dedicated to integrating knowledge about MI to improve the efficiency of translational MI research. MIKB is an updated and expanded version of our previous MI Risk Knowledge Base (MIRKB), which integrated MI-related risk factors and risk models for providing help in risk assessment or diagnostic prediction of MI. The updated MIRKB includes 9701 records with 2054 single factors, 209 combined factors, 243 risk models, 37 MI subtypes and 3406 interactions between single factors and MIs collected from 4817 research articles. The expanded functional module, MIGD, is a database including not only MI associated genetic variants, but also the other multi-omics factors and the annotations for their functional alterations. The goal of MIGD is to provide a multi-omics level understanding of the molecular pathogenesis of MI. MIGD includes 1782 omics factors, 28 MI subtypes and 2347 omics factor-MI interactions as well as 1253 genes and 6 chromosomal alterations collected from 2647 research articles. The functions of MI associated genes and their interaction with drugs were analyzed. MIKB will be continuously updated and optimized to provide precision and comprehensive knowledge for the study of heterogeneous and personalized MI.
中文翻译：
MIKB：手动整理的心肌梗塞综合知识库
心肌梗死知识库（MIKB；最新更新：2020 年 12 月 31 日）是一个开放访问且手动管理的数据库，致力于整合有关 MI 的知识，以提高转化性 MI 研究的效率。 MIKB是我们之前的MI风险知识库（MIRKB）的更新和扩展版本，它集成了MI相关的风险因素和风险模型，为MI的风险评估或诊断预测提供帮助。更新后的 MIRKB 包括从 4817 篇研究文章中收集的 9701 条记录，其中包括 2054 个单因素、209 个组合因素、243 个风险模型、37 个 MI 亚型以及单因素与 MI 之间的 3406 个交互作用。扩展的功能模块 MIGD 是一个数据库，不仅包括 MI 相关的遗传变异，还包括其他多组学因素及其功能改变的注释。 MIGD 的目标是提供对 MI 分子发病机制的多组学水平理解。 MIGD 包括 1782 个组学因子、28 个 MI 亚型和 2347 个组学因子-MI 相互作用以及从 2647 篇研究文章中收集的 1253 个基因和 6 个染色体改变。分析了MI相关基因的功能及其与药物的相互作用。 MIKB将不断更新和优化，为异构、个性化MI的研究提供精准、全面的知识。
更新日期：2021-11-16
中文翻译：
MIKB：手动整理的心肌梗塞综合知识库
心肌梗死知识库（MIKB；最新更新：2020 年 12 月 31 日）是一个开放访问且手动管理的数据库，致力于整合有关 MI 的知识，以提高转化性 MI 研究的效率。 MIKB是我们之前的MI风险知识库（MIRKB）的更新和扩展版本，它集成了MI相关的风险因素和风险模型，为MI的风险评估或诊断预测提供帮助。更新后的 MIRKB 包括从 4817 篇研究文章中收集的 9701 条记录，其中包括 2054 个单因素、209 个组合因素、243 个风险模型、37 个 MI 亚型以及单因素与 MI 之间的 3406 个交互作用。扩展的功能模块 MIGD 是一个数据库，不仅包括 MI 相关的遗传变异，还包括其他多组学因素及其功能改变的注释。 MIGD 的目标是提供对 MI 分子发病机制的多组学水平理解。 MIGD 包括 1782 个组学因子、28 个 MI 亚型和 2347 个组学因子-MI 相互作用以及从 2647 篇研究文章中收集的 1253 个基因和 6 个染色体改变。分析了MI相关基因的功能及其与药物的相互作用。 MIKB将不断更新和优化，为异构、个性化MI的研究提供精准、全面的知识。
京公网安备 11010802027423号