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A GX2GX3G motif facilitates acyl chain sequestration by Saccharomyces cerevisiae acyl carrier protein.
Journal of Biological Chemistry ( IF 4.0 ) Pub Date : 2021-11-09 , DOI: 10.1016/j.jbc.2021.101394
Garima 1 , Rashima Prem 1 , Usha Yadav 1 , Monica Sundd 1
Affiliation  

Saccharomyces cerevisiae acyl carrier protein (ScACP) is a component of the large fungal fatty acid synthase I (FAS I) complex. ScACP comprises two subdomains: a conserved ACP domain that shares extensive structural homology with other ACPs and a unique structural domain. Unlike the metazoan type I ACP that does not sequester the acyl chain, ScACP can partially sequester the growing acyl chain within its hydrophobic core by a mechanism that remains elusive. Our studies on the acyl-ScACP intermediates disclose a unique 188GX2GX3G195 sequence in helix II important for ACP function. Complete loss of sequestration was observed upon mutation of the three glycines in this sequence to valine (G188V/G191V/G195V), while G191V and G188V/G191V double mutants displayed a faster rate of acyl chain hydrolysis. Likewise, mutation of Thr216 to Ala altered the size of the hydrophobic cavity, resulting in loss of C12- chain sequestration. Combining NMR studies with insights from the crystal structure, we show that three glycines in helix II and a threonine in helix IV favor conformational change, which in turn generate space for acyl chain sequestration. Furthermore, we identified the primary hydrophobic cavity of ScACP, present between the carboxyl end of helix II and IV. The opening of the cavity lies between the second and third turns of helix II and loop II. Overall, the study highlights a novel role of the GX2GX3G motif in regulating acyl chain sequestration, vital for ScACP function.

中文翻译:

GX2GX3G 基序有助于酿酒酵母酰基载体蛋白对酰基链的螯合。

酿酒酵母酰基载体蛋白 (ScACP) 是大型真菌脂肪酸合酶 I (FAS I) 复合物的一个组成部分。ScACP 包含两个子域:一个与其他 ACP 具有广泛结构同源性的保守 ACP 域和一个独特的结构域。与不隔离酰基链的后生动物 I 型 ACP 不同,ScACP 可以通过一种仍然难以捉摸的机制将正在生长的酰基链部分隔离在其疏水核心内。我们对酰基-ScACP 中间体的研究揭示了螺旋 II 中独特的 188GX2GX3G195 序列,这对 ACP 功能很重要。在该序列中的三个甘氨酸突变为缬氨酸 (G188V/G191V/G195V) 后,观察到完全丧失隔离作用,而 G191V 和 G188V/G191V 双突变体显示出更快的酰基链水解速率。同样地,Thr216 突变为 Ala 改变了疏水腔的大小,导致 C12 链螯合丧失。将 NMR 研究与晶体结构的见解相结合,我们表明螺旋 II 中的三个甘氨酸和螺旋 IV 中的一个苏氨酸有利于构象变化,这反过来又为酰基链螯合创造了空间。此外,我们确定了存在于螺旋 II 和 IV 的羧基端之间的 ScACP 的主要疏水腔。空腔的开口位于螺旋 II 和环 II 的第二和第三圈之间。总体而言,该研究强调了 GX2GX3G 基序在调节酰基链螯合中的新作用,这对 ScACP 功能至关重要。我们表明螺旋 II 中的三个甘氨酸和螺旋 IV 中的一个苏氨酸有利于构象变化,这反过来又为酰基链螯合创造空间。此外,我们确定了存在于螺旋 II 和 IV 的羧基端之间的 ScACP 的主要疏水腔。空腔的开口位于螺旋 II 和环 II 的第二和第三圈之间。总体而言,该研究强调了 GX2GX3G 基序在调节酰基链螯合中的新作用,这对 ScACP 功能至关重要。我们表明螺旋 II 中的三个甘氨酸和螺旋 IV 中的一个苏氨酸有利于构象变化,这反过来又为酰基链螯合创造空间。此外,我们确定了存在于螺旋 II 和 IV 的羧基端之间的 ScACP 的主要疏水腔。空腔的开口位于螺旋 II 和环 II 的第二和第三圈之间。总体而言,该研究强调了 GX2GX3G 基序在调节酰基链螯合中的新作用,这对 ScACP 功能至关重要。
更新日期:2021-11-09
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