Marine heterotrophic flagellates (HFs) form a diverse and ecologically relevant functional group of bacterial grazers and nutrient remineralizers in oceanic waters. Despite playing a crucial role in marine biogeochemical cycles, there is still a lack of information on which specific taxa dominate HF assemblages and what are their patterns of distribution in a global context. In the present work, we addressed this issue by analyzing amplicon sequencing data sets retrieved from samples taken in tropical and subtropical oceanic regions at depths from surface to 4000 m. Only a few dozens of widespread taxa, mostly affiliating to MAST clades, Picozoa, Bicosoecida and Chrysophyceae, seemed to dominate surface HF assemblages. The majority of these dominant HFs were present at relatively constant abundances, while others were influenced by temperature or displayed a patchy distribution. In the deep ocean, only a handful of taxa belonging to Bicosoecida and Chrysophyceae, together with Diplonemea and Kinetoplastida, explained most of the HF signal. Co-occurrence networks between HF and prokaryotic taxa at the surface ocean revealed two main clusters influenced by temperature that did not seem to show specific patterns of interaction. However, some correlations emerged outside these thermal groups that could represent new prey–predator interactions. Overall, we identified the putatively most ecologically relevant HF taxa in the ocean, which become promising targets for further experimental and genomic studies.

中文翻译：

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海洋异养鞭毛虫由少数分布广泛的分类群主导

海洋异养鞭毛虫 (HFs) 在海水中形成了一个多样化的生态相关功能群，包括细菌食草动物和营养再矿化剂。尽管在海洋生物地球化学循环中发挥着至关重要的作用，但仍然缺乏关于哪些特定分类群在 HF 组合中占主导地位以及它们在全球范围内的分布模式的信息。在目前的工作中，我们通过分析从热带和亚热带海洋区域从地表到 4000 米深处采集的样本中检索到的扩增子测序数据集来解决这个问题。只有几十个广泛分布的分类群，主要隶属于 MAST 进化枝、皮科动物纲、双壳纲和金藻纲，似乎在表面 HF 组合中占主导地位。这些主要 HF 中的大多数以相对恒定的丰度存在，而另一些则受温度影响或呈不规则分布。在深海中，只有少数属于 Bicosoecida 和 Chrysocyceae 的分类群，以及 Diplonemea 和 Kinetoplastida，解释了大部分 HF 信号。HF 和海洋表面原核生物类群之间的共生网络揭示了两个受温度影响的主要集群，它们似乎没有显示出特定的相互作用模式。然而，在这些热群之外出现了一些可能代表新的猎物-捕食者相互作用的相关性。总体而言，我们确定了海洋中公认的与生态最相关的 HF 类群，它们成为进一步实验和基因组研究的有希望的目标。与 Diplonemea 和 Kinetoplastida 一起解释了大部分 HF 信号。HF 和海洋表面原核生物类群之间的共生网络揭示了两个受温度影响的主要集群，它们似乎没有显示出特定的相互作用模式。然而，在这些热群之外出现了一些可能代表新的猎物-捕食者相互作用的相关性。总体而言，我们确定了海洋中公认的与生态最相关的 HF 类群，它们成为进一步实验和基因组研究的有希望的目标。与 Diplonemea 和 Kinetoplastida 一起解释了大部分 HF 信号。HF 和海洋表面原核生物类群之间的共生网络揭示了两个受温度影响的主要集群，它们似乎没有显示出特定的相互作用模式。然而，在这些热群之外出现了一些可能代表新的猎物-捕食者相互作用的相关性。总体而言，我们确定了海洋中公认的与生态最相关的 HF 类群，它们成为进一步实验和基因组研究的有希望的目标。在这些热群之外出现了一些相关性，可以代表新的猎物-捕食者相互作用。总体而言，我们确定了海洋中公认的与生态最相关的 HF 类群，它们成为进一步实验和基因组研究的有希望的目标。在这些热群之外出现了一些相关性，可以代表新的猎物-捕食者相互作用。总体而言，我们确定了海洋中公认的与生态最相关的 HF 类群，它们成为进一步实验和基因组研究的有希望的目标。