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DPYSL2 as potential diagnostic and prognostic biomarker linked to immune infiltration in lung adenocarcinoma
World Journal of Surgical Oncology ( IF 2.5 ) Pub Date : 2021-09-13 , DOI: 10.1186/s12957-021-02379-z
Yang-Jie Wu 1 , Ai-Tao Nai 2 , Gui-Cheng He 3 , Fei Xiao 1 , Zhi-Min Li 1 , San-Yuan Tang 4 , Yan-Ping Liu 1 , Xiao-Hong Ai 1
Affiliation  

Dihydropyrimidinase like 2 (DPYSL2) has been linked to tumor metastasis. However, the function of DPSY2L in lung adenocarcinoma (LUAD) is yet to be explored. Herein, we assessed DPYSL2 expression in various tumor types via online databases such as Oncomine and Tumor Immune Estimation Resource (TIMER). Further, we verified the low protein and mRNA expressions of DPYSL2 in LUAD via the ULCAN, The TCGA and GEPIA databases. We applied the ROC curve to examine the role of DPYSL2 in diagnosis. The prognostic significance of DPYSL2 was established through the Kaplan–Meier plotter and the Cox analyses (univariate and multivariate). TIMER was used to explore DPYSL2 expression and its connection to immune infiltrated cells. Through Gene Set Enrichment Analysis, the possible mechanism of DPYSL2 in LUAD was investigated. In this study, database analysis revealed lower DPYSL2 expression in LUAD than in normal tissues. The ROC curve suggested that expression of DPYSL2 had high diagnostic efficiency in LUAD. The DPYSL2 expression had an association with the survival time of LUAD patients in the Kaplan–Meier plotter and the Cox analyses. The results from TIMER depicted a markedly positive correlation of DPYSL2 expression with immune cells infiltrated in LUAD, such as macrophages, dendritic cells, CD4+ T cells, and neutrophils. Additionally, many gene markers for the immune system had similar positive correlations in the TIMER analysis. In Gene Set Enrichment Analysis, six immune-related signaling pathways were associated with DPYSL2. In summary, DPYSL2 is a novel biomarker with diagnostic and prognostic potential for LUAD as well as an immunotherapy target.

中文翻译:

DPYSL2 作为与肺腺癌免疫浸润相关的潜在诊断和预后生物标志物

二氢嘧啶酶样 2 (DPYSL2) 与肿瘤转移有关。然而,DPSY2L 在肺腺癌 (LUAD) 中的功能尚待探索。在此,我们通过 Oncomine 和肿瘤免疫估计资源 (TIMER) 等在线数据库评估了 DPYSL2 在各种肿瘤类型中的表达。此外,我们通过 ULCAN、TCGA 和 GEPIA 数据库验证了 LUAD 中 DPYSL2 的低蛋白和 mRNA 表达。我们应用 ROC 曲线来检查 DPYSL2 在诊断中的作用。DPYSL2 的预后意义是通过 Kaplan-Meier 绘图仪和 Cox 分析(单变量和多变量)确定的。TIMER 用于探索 DPYSL2 表达及其与免疫浸润细胞的联系。通过基因集富集分析,研究了DPYSL2在LUAD中的可能机制。在这项研究中,数据库分析显示 LUAD 中 DPYSL2 的表达低于正常组织。ROC曲线表明DPYSL2的表达在LUAD中具有较高的诊断效率。在 Kaplan-Meier 绘图仪和 Cox 分析中,DPYSL2 表达与 LUAD 患者的生存时间相关。TIMER 的结果表明 DPYSL2 表达与浸润在 LUAD 中的免疫细胞(如巨噬细胞、树突细胞、CD4+ T 细胞和中性粒细胞)呈显着正相关。此外,免疫系统的许多基因标记在 TIMER 分析中具有类似的正相关性。在基因集富集分析中,6 个免疫相关信号通路与 DPYSL2 相关。总之,DPYSL2 是一种新型生物标志物,具有 LUAD 的诊断和预后潜力以及免疫治疗靶点。ROC曲线表明DPYSL2的表达在LUAD中具有较高的诊断效率。在 Kaplan-Meier 绘图仪和 Cox 分析中,DPYSL2 表达与 LUAD 患者的生存时间相关。TIMER 的结果表明 DPYSL2 表达与浸润在 LUAD 中的免疫细胞(如巨噬细胞、树突细胞、CD4+ T 细胞和中性粒细胞)呈显着正相关。此外,免疫系统的许多基因标记在 TIMER 分析中具有类似的正相关性。在基因集富集分析中,6 个免疫相关信号通路与 DPYSL2 相关。总之,DPYSL2 是一种新型生物标志物,具有 LUAD 的诊断和预后潜力以及免疫治疗靶点。ROC曲线表明DPYSL2的表达在LUAD中具有较高的诊断效率。在 Kaplan-Meier 绘图仪和 Cox 分析中,DPYSL2 表达与 LUAD 患者的生存时间相关。TIMER 的结果表明 DPYSL2 表达与浸润在 LUAD 中的免疫细胞(如巨噬细胞、树突细胞、CD4+ T 细胞和中性粒细胞)呈显着正相关。此外,免疫系统的许多基因标记在 TIMER 分析中具有类似的正相关性。在基因集富集分析中,6 个免疫相关信号通路与 DPYSL2 相关。总之,DPYSL2 是一种新型生物标志物,具有 LUAD 的诊断和预后潜力以及免疫治疗靶点。在 Kaplan-Meier 绘图仪和 Cox 分析中,DPYSL2 表达与 LUAD 患者的生存时间相关。TIMER 的结果表明 DPYSL2 表达与浸润在 LUAD 中的免疫细胞(如巨噬细胞、树突细胞、CD4+ T 细胞和中性粒细胞)呈显着正相关。此外,免疫系统的许多基因标记在 TIMER 分析中具有类似的正相关性。在基因集富集分析中,6 个免疫相关信号通路与 DPYSL2 相关。总之,DPYSL2 是一种新型生物标志物,具有 LUAD 的诊断和预后潜力以及免疫治疗靶点。在 Kaplan-Meier 绘图仪和 Cox 分析中,DPYSL2 表达与 LUAD 患者的生存时间相关。TIMER 的结果表明 DPYSL2 表达与浸润在 LUAD 中的免疫细胞(如巨噬细胞、树突细胞、CD4+ T 细胞和中性粒细胞)呈显着正相关。此外,免疫系统的许多基因标记在 TIMER 分析中具有类似的正相关性。在基因集富集分析中,6 个免疫相关信号通路与 DPYSL2 相关。总之,DPYSL2 是一种新型生物标志物,具有 LUAD 的诊断和预后潜力以及免疫治疗靶点。TIMER 的结果表明 DPYSL2 表达与浸润在 LUAD 中的免疫细胞(如巨噬细胞、树突细胞、CD4+ T 细胞和中性粒细胞)呈显着正相关。此外,免疫系统的许多基因标记在 TIMER 分析中具有类似的正相关性。在基因集富集分析中,6 个免疫相关信号通路与 DPYSL2 相关。总之,DPYSL2 是一种新型生物标志物,具有 LUAD 的诊断和预后潜力以及免疫治疗靶点。TIMER 的结果表明 DPYSL2 表达与浸润在 LUAD 中的免疫细胞(如巨噬细胞、树突细胞、CD4+ T 细胞和中性粒细胞)呈显着正相关。此外,免疫系统的许多基因标记在 TIMER 分析中具有类似的正相关性。在基因集富集分析中,6 个免疫相关信号通路与 DPYSL2 相关。总之,DPYSL2 是一种新型生物标志物,具有 LUAD 的诊断和预后潜力以及免疫治疗靶点。
更新日期:2021-09-13
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