RNA polymerase II plays critical roles in transcription in eukaryotic organisms. C-terminal Domain Phosphatase-like 1 (CPL1) regulates the phosphorylation state of the C-terminal domain of RNA polymerase II subunit B1, which is critical in determining RNA polymerase II activity. CPL1 plays an important role in miRNA biogenesis, plant growth and stress responses. Although cpl1 mutant showes delayed-flowering phenotype, the molecular mechanism behind CPL1’s role in floral transition is still unknown. To study the role of CPL1 during the floral transition, we first tested phenotypes of cpl1-3 mutant, which harbors a point-mutation. The cpl1-3 mutant contains a G-to-A transition in the second exon, which results in an amino acid substitution from Glu to Lys (E116K). Further analyses found that the mutated amino acid (Glu) was conserved in these species. As a result, we found that the cpl1-3 mutant experienced delayed flowering under both long- and short-day conditions, and CPL1 is involved in the vernalization pathway. Transcriptome analysis identified 109 genes differentially expressed in the cpl1 mutant, with 2 being involved in floral transition. Differential expression of the two flowering-related DEGs was further validated by qRT-PCR. Flowering genetic pathways analysis coupled with transciptomic analysis provides potential genes related to floral transition in the cpl1-3 mutant, and a framework for future studies of the molecular mechanisms behind CPL1’s role in floral transition.

中文翻译：

---

C末端结构域磷酸酶样1（CPL1）参与拟南芥的花转化

RNA 聚合酶 II 在真核生物的转录中起关键作用。C 末端结构域磷酸酶样 1 (CPL1) 调节 RNA 聚合酶 II 亚基 B1 的 C 末端结构域的磷酸化状态，这对于确定 RNA 聚合酶 II 活性至关重要。CPL1 在 miRNA 生物发生、植物生长和应激反应中发挥重要作用。虽然 cpl1 突变体显示延迟开花表型，但 CPL1 在花转变中的作用背后的分子机制仍然未知。为了研究 CPL1 在花转变过程中的作用，我们首先测试了具有点突变的 cpl1-3 突变体的表型。cpl1-3 突变体在第二个外显子中包含一个 G 到 A 的转变，这导致从 Glu 到 Lys 的氨基酸取代 (E116K)。进一步的分析发现，突变的氨基酸 (Glu) 在这些物种中是保守的。结果，我们发现 cpl1-3 突变体在长日照和短日照条件下都经历了延迟开花，并且 CPL1 参与了春化途径。转录组分析确定了 109 个在 cpl1 突变体中差异表达的基因，其中 2 个与花转化有关。通过 qRT-PCR 进一步验证了两种开花相关 DEG 的差异表达。开花遗传途径分析与转录组学分析相结合，提供了与 cpl1-3 突变体中的花转化相关的潜在基因，并为未来研究 CPL1 在花转化中的作用背后的分子机制提供了框架。CPL1 参与春化途径。转录组分析确定了 109 个在 cpl1 突变体中差异表达的基因，其中 2 个与花转化有关。通过 qRT-PCR 进一步验证了两种开花相关 DEG 的差异表达。开花遗传途径分析与转录组学分析相结合，提供了与 cpl1-3 突变体中的花转化相关的潜在基因，并为未来研究 CPL1 在花转化中的作用背后的分子机制提供了框架。CPL1 参与春化途径。转录组分析确定了 109 个在 cpl1 突变体中差异表达的基因，其中 2 个与花转化有关。通过 qRT-PCR 进一步验证了两种开花相关 DEG 的差异表达。开花遗传途径分析与转录组学分析相结合，提供了与 cpl1-3 突变体中的花转化相关的潜在基因，并为未来研究 CPL1 在花转化中的作用背后的分子机制提供了框架。