Burkholderia pseudomallei is the bacterial causative agent of melioidosis, a difficult disease to diagnose clinically with high mortality if not appropriately treated. Definitive diagnosis requires isolation and identification of the organism. With the increased adoption of MALDI-TOF MS for the identification of bacteria, we established a method for rapid identification of B. pseudomallei using the Vitek MS, a system that does not currently have B. pseudomallei in its in-vitro diagnostic database. A routine direct spotting method was employed to create spectra and SuperSpectra. An initial B. pseudomallei SuperSpectrum was created at Shoklo Malaria Research Unit (SMRU) from 17 reference isolates (46 spectra). When tested, this initial SMRU SuperSpectrum was able to identify 98.2 % (54/55) of Asian isolates, but just 46.7 % (35/75) of Australian isolates. Using spectra (430) from different reference and clinical isolates, two additional SMRU SuperSpectra were created. Using the combination of all SMRU SuperSpectra with seven existing SuperSpectra from Townsville, Australia 119 (100 %) Asian isolates and 31 (100 %) Australian isolates were correctly identified. In addition, no misidentifications were obtained when using these 11 SuperSpectra when tested with 34 isolates of other bacteria including the closely related species Burkholderia thailandensis and Burkholderia cepacia. This study has established a method for identification of B. pseudomallei using Vitek MS, and highlights the impact of geographical differences between strains for identification using this technique.

中文翻译：

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使用 MALDI-TOF 质谱法快速鉴定鼻疽伯克霍尔德菌的多国研究

鼻疽伯克霍尔德菌是类鼻疽的细菌病原体，类鼻疽是一种临床上难以诊断的疾病，如果治疗不当，死亡率会很高。确诊需要分离和鉴定生物体。随着越来越多地采用 MALDI-TOF MS 来识别细菌，我们建立了一种使用 Vitek MS 快速识别假鼻疽的方法，该系统目前在其体外诊断数据库中没有假鼻疽。使用常规的直接点样方法来创建光谱和 SuperSpectra。Shoklo 疟疾研究单位 (SMRU) 从 17 个参考分离株（46 个光谱）中创建了最初的假鼻疽芽孢杆菌 SuperSpectrum。经过测试，这个最初的 SMRU SuperSpectrum 能够识别 98.2% (54/55) 的亚洲分离株，但只有 46 个。7 % (35/75) 的澳大利亚分离株。使用来自不同参考和临床分离株的光谱 (430)，创建了两个额外的 SMRU SuperSpectra。使用所有 SMRU SuperSpectra 与来自澳大利亚汤斯维尔的 7 个现有 SuperSpectra 的组合，119 (100%) 个亚洲分离株和 31 (100%) 个澳大利亚分离株被正确识别。此外，当使用这 11 种 SuperSpectra 对 34 种其他细菌（包括密切相关的物种 Burkholderia thailandensis 和 Burkholderia cepacia）进行测试时，没有发现错误识别。本研究建立了一种使用 Vitek MS 鉴定假鼻疽芽孢杆菌的方法，并强调了使用该技术进行鉴定的菌株之间的地理差异的影响。创建了两个额外的 SMRU SuperSpectra。使用所有 SMRU SuperSpectra 与来自澳大利亚汤斯维尔的 7 个现有 SuperSpectra 的组合，119 (100%) 个亚洲分离株和 31 (100%) 个澳大利亚分离株被正确识别。此外，当使用这 11 种 SuperSpectra 对 34 种其他细菌（包括密切相关的物种 Burkholderia thailandensis 和 Burkholderia cepacia）进行测试时，没有发现错误识别。本研究建立了一种使用 Vitek MS 鉴定假鼻疽芽孢杆菌的方法，并强调了使用该技术进行鉴定的菌株之间的地理差异的影响。创建了两个额外的 SMRU SuperSpectra。使用所有 SMRU SuperSpectra 与来自澳大利亚汤斯维尔的 7 个现有 SuperSpectra 的组合，119 (100%) 个亚洲分离株和 31 (100%) 个澳大利亚分离株被正确识别。此外，当使用这 11 种 SuperSpectra 对 34 种其他细菌（包括密切相关的物种 Burkholderia thailandensis 和 Burkholderia cepacia）进行测试时，没有发现错误识别。本研究建立了一种使用 Vitek MS 鉴定假鼻疽芽孢杆菌的方法，并强调了使用该技术进行鉴定的菌株之间的地理差异的影响。澳大利亚 119 (100%) 个亚洲分离株和 31 (100%) 个澳大利亚分离株被正确鉴定。此外，当使用这 11 种 SuperSpectra 对 34 种其他细菌（包括密切相关的物种 Burkholderia thailandensis 和 Burkholderia cepacia）进行测试时，没有发现错误识别。本研究建立了一种使用 Vitek MS 鉴定假鼻疽芽孢杆菌的方法，并强调了使用该技术进行鉴定的菌株之间的地理差异的影响。澳大利亚 119 (100%) 个亚洲分离株和 31 (100%) 个澳大利亚分离株被正确鉴定。此外，当使用这 11 种 SuperSpectra 对 34 种其他细菌（包括密切相关的物种 Burkholderia thailandensis 和 Burkholderia cepacia）进行测试时，没有发现错误识别。本研究建立了一种使用 Vitek MS 鉴定假鼻疽芽孢杆菌的方法，并强调了使用该技术进行鉴定的菌株之间的地理差异的影响。