Diversity and also the molecular analysis of genotypes and association analysis among molecular markers and quantitative traits are the important methods in breeding programs. In this study, 30 safflower genotypes were evaluated in the research farm of the Graduate University of Advanced Technology, Kerman, Iran based on randomized complete block design with three replications. The phenotypic and agronomic traits were evaluated and, also, these genotypes were studied with 24 start codon targeted polymorphism (SCoT) and 10 inter-simple sequence repeat (ISSR) markers at the molecular level. The differences among genotypes were significant for the studied traits based on analysis of variance. The genotypes divided into three groups by using cluster analysis based on quantitative traits. Cluster analysis method by Jaccard's similarity coefficient as well as Bayesian statistical method based on molecular data classified genotypes into two groups. The molecular variance analysis showed that diversity among populations is much more than within populations. Nineteen and thirty one gene loci had identified by (G + P + K) and (G + P + K + Q) of mixed linear model for the studied traits, and some of these loci were the same in two models. Some of these markers controlled several traits that named co-location markers, so these markers are effective in plant breeding programs. The SCoT and ISSR markers can be developed as the sequence-tagged site markers and used in marker-assisted selection and breeding programs of safflower genotypes when they linked to agronomic traits.

多样性以及基因型的分子分析和分子标记与数量性状之间的关联分析是育种计划中的重要方法。在这项研究中，基于随机完整区组设计和三个重复，在伊朗克尔曼先进技术研究生大学的研究农场评估了 30 种红花基因型。评估了表型和农艺性状，并且在分子水平上用 24 个起始密码子靶向多态性 (SCoT) 和 10 个简单序列间重复 (ISSR) 标记研究了这些基因型。基于方差分析的研究性状基因型之间的差异显着。通过基于数量性状的聚类分析将基因型分为三组。Jaccard'的聚类分析方法 s相似系数以及基于分子数据的贝叶斯统计方法将基因型分为两组。分子方差分析表明，种群间的多样性远大于种群内的多样性。所研究性状的(G+P+K)和(G+P+K+Q)混合线性模型共鉴定出19个和31个基因位点，其中部分位点在两个模型中是相同的。这些标记中的一些控制称为共位标记的几个性状，因此这些标记在植物育种计划中是有效的。SCoT 和 ISSR 标记可以开发为序列标记的位点标记，当它们与农艺性状相关联时，可用于红花基因型的标记辅助选择和育种计划。分子方差分析表明，种群间的多样性远大于种群内的多样性。所研究性状的(G+P+K)和(G+P+K+Q)混合线性模型共鉴定出19个和31个基因位点，其中部分位点在两个模型中是相同的。这些标记中的一些控制称为共位标记的几个性状，因此这些标记在植物育种计划中是有效的。SCoT 和 ISSR 标记可以开发为序列标记的位点标记，当它们与农艺性状相关联时，可用于红花基因型的标记辅助选择和育种计划。分子方差分析表明，种群间的多样性远大于种群内的多样性。所研究性状的(G+P+K)和(G+P+K+Q)混合线性模型共鉴定出19个和31个基因位点，其中部分位点在两个模型中是相同的。这些标记中的一些控制了称为共位标记的几个性状，因此这些标记在植物育种计划中是有效的。SCoT 和 ISSR 标记可以开发为序列标记的位点标记，当它们与农艺性状相关联时，可用于红花基因型的标记辅助选择和育种计划。所研究性状的(G+P+K)和(G+P+K+Q)混合线性模型共鉴定出19个和31个基因位点，其中部分位点在两个模型中是相同的。这些标记中的一些控制了称为共位标记的几个性状，因此这些标记在植物育种计划中是有效的。SCoT 和 ISSR 标记可以开发为序列标记的位点标记，当它们与农艺性状相关联时，可用于红花基因型的标记辅助选择和育种计划。所研究性状的(G+P+K)和(G+P+K+Q)混合线性模型共鉴定出19个和31个基因位点，其中部分位点在两个模型中是相同的。这些标记中的一些控制了称为共位标记的几个性状，因此这些标记在植物育种计划中是有效的。SCoT 和 ISSR 标记可以开发为序列标记的位点标记，当它们与农艺性状相关联时，可用于红花基因型的标记辅助选择和育种计划。