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Characterization of EST-SSRs for European beech (Fagus sylvatica L.) and their transferability to Fagus orientalis Lipsky, Castanea dentata Bork., and Quercus rubra L.
Silvae Genetica ( IF 1.1 ) Pub Date : 2018-12-01 , DOI: 10.2478/sg-2018-0019
Katrin Burger 1 , Markus Müller 1 , Oliver Gailing 1
Affiliation  

Abstract Due to ongoing climate change, forests are exposed to changing environmental conditions, such as increasing temperatures and lower precipitation, to which trees have to adapt. Successful adaptation to changing and variable environments requires sufficient genetic variation within tree populations. Knowledge of the genetic variation of trees is therefore essential, as it provides information for the long-term conservation, stability and productivity of forests. The genetic variation of a species can be analysed with molecular markers. Despite growing genomic and genetic resources for European beech (Fagus sylvatica L.), which is one of the economically and ecologically most important forest tree species in Central Europe, the number of molecular markers for population genetic analyses is still limited. Therefore, the aim of the work is the development of new EST-SSR markers for this species. A total of 72 DNA samples of European beech from three widely separated regions in Germany were used to test 41 primers for variation and polymorphism, 35 of which were originally developed for American beech (Fagus grandifolia Ehrh.) and 6 for red oak (Quercus rubra L.). Fifteen of the primers were polymorphic, 13 monomorphic and 13 did not amplify. In addition, the transferability of the markers was successfully tested in the related species Castanea dentata Bork., Fagus orientalis Lipsky and Q. rubra. The EST-SSR markers tested in this study will be useful for future population genetic analyses and extend the set of available markers in European beech.

中文翻译:

欧洲山毛榉 (Fagus sylvatica L.) EST-SSR 的表征及其对 Fagus orientalis Lipsky、Castanea dentata Bork. 和 Quercus rubra L. 的转移性。

摘要 由于持续的气候变化,森林面临着不断变化的环境条件,例如气温升高和降水减少,树木必须适应这些条件。成功适应不断变化的环境需要树木种群内有足够的遗传变异。因此,了解树木的遗传变异至关重要,因为它为森林的长期保护、稳定性和生产力提供了信息。一个物种的遗传变异可以用分子标记进行分析。尽管欧洲山毛榉 (Fagus sylvatica L.) 是中欧经济和生态上最重要的森林树种之一,但其基因组和遗传资源不断增加,但用于种群遗传分析的分子标记数量仍然有限。所以,这项工作的目的是为该物种开发新的 EST-SSR 标记。来自德国三个相距很远的地区的总共 72 个欧洲山毛榉 DNA 样本被用来测试 41 个引物的变异和多态性,其中 35 个最初为美国山毛榉 (Fagus grandifolia Ehrh.) 开发,6 个为红橡木 (Quercus rubra) 开发。 L.)。15 个引物是多态的,13 个是单态的,13 个没有扩增。此外,标记的可转移性已在相关物种 Castanea dentata Bork.、Fagus orientalis Lipsky 和 ​​Q. rubra 中成功测试。本研究中测试的 EST-SSR 标记将有助于未来的种群遗传分析,并扩展欧洲山毛榉的可用标记集。来自德国三个相距很远的地区的总共 72 个欧洲山毛榉 DNA 样本被用来测试 41 个引物的变异和多态性,其中 35 个最初为美国山毛榉 (Fagus grandifolia Ehrh.) 开发,6 个为红橡木 (Quercus rubra) 开发。 L.)。15 个引物是多态的,13 个是单态的,13 个没有扩增。此外,标记的可转移性已在相关物种 Castanea dentata Bork.、Fagus orientalis Lipsky 和 ​​Q. rubra 中成功测试。本研究中测试的 EST-SSR 标记将有助于未来的种群遗传分析,并扩展欧洲山毛榉的可用标记集。来自德国三个相距很远的地区的总共 72 个欧洲山毛榉 DNA 样本被用来测试 41 个引物的变异和多态性,其中 35 个最初为美国山毛榉 (Fagus grandifolia Ehrh.) 开发,6 个为红橡木 (Quercus rubra) 开发。 L.)。15 个引物是多态的,13 个是单态的,13 个没有扩增。此外,标记的可转移性已在相关物种 Castanea dentata Bork.、Fagus orientalis Lipsky 和 ​​Q. rubra 中成功测试。本研究中测试的 EST-SSR 标记将有助于未来的种群遗传分析,并扩展欧洲山毛榉的可用标记集。) 和 6 代表红橡木 (Quercus rubra L.)。15 个引物是多态的,13 个是单态的,13 个没有扩增。此外,标记的可转移性已在相关物种 Castanea dentata Bork.、Fagus orientalis Lipsky 和 ​​Q. rubra 中成功测试。本研究中测试的 EST-SSR 标记将有助于未来的种群遗传分析,并扩展欧洲山毛榉的可用标记集。) 和 6 代表红橡木 (Quercus rubra L.)。15 个引物是多态的,13 个是单态的,13 个没有扩增。此外,标记的可转移性已在相关物种 Castanea dentata Bork.、Fagus orientalis Lipsky 和 ​​Q. rubra 中成功测试。本研究中测试的 EST-SSR 标记将有助于未来的种群遗传分析,并扩展欧洲山毛榉的可用标记集。
更新日期:2018-12-01
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