当前位置: X-MOL 学术Virus Genes › 论文详情
Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)
Full genome-based characterization of G4P[6] rotavirus strains from diarrheic patients in Thailand: Evidence for independent porcine-to-human interspecies transmission events
Virus Genes ( IF 1.9 ) Pub Date : 2021-06-09 , DOI: 10.1007/s11262-021-01851-y
Ratana Tacharoenmuang 1, 2 , Ratigorn Guntapong 1 , Sompong Upachai 1 , Phakapun Singchai 1 , Saori Fukuda 2 , Tomihiko Ide 2 , Riona Hatazawa 2 , Karun Sutthiwarakom 1 , Santip Kongjorn 1 , Napa Onvimala 1 , Tipsuda Luechakham 1 , Kriangsak Ruchusatsawast 1 , Yoshiki Kawamura 3 , Busarawan Sriwanthana 4 , Kazushi Motomura 5, 6 , Masashi Tatsumi 5 , Naokazu Takeda 5 , Tetsushi Yoshikawa 3 , Takayuki Murata 2 , Ballang Uppapong 1 , Koki Taniguchi 2 , Satoshi Komoto 2
Affiliation  

The exact evolutionary patterns of human G4P[6] rotavirus strains remain to be elucidated. Such strains possess unique and strain-specific genotype constellations, raising the question of whether G4P[6] strains are primarily transmitted via independent interspecies transmission or human-to-human transmission after interspecies transmission. Two G4P[6] rotavirus strains were identified in fecal specimens from hospitalized patients with severe diarrhea in Thailand, namely, DU2014-259 (RVA/Human-wt/THA/DU2014-259/2014/G4P[6]) and PK2015-1-0001 (RVA/Human-wt/THA/PK2015-1-0001/2015/G4P[6]). Here, we analyzed the full genomes of the two human G4P[6] strains, which provided the opportunity to study and confirm their evolutionary origin. On whole genome analysis, both strains exhibited a unique Wa-like genotype constellation of G4-P[6]-I1-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1. The NSP1 genotype A8 is commonly found in porcine rotavirus strains. Furthermore, on phylogenetic analysis, each of the 11 genes of strains DU2014-259 and PK2015-1-0001 appeared to be of porcine origin. On the other hand, the two study strains consistently formed distinct clusters for nine of the 11 gene segments (VP4, VP6, VP1-VP3, and NSP2-NSP5), strongly indicating the occurrence of independent porcine-to-human interspecies transmission events. Our observations provide important insights into the origin of zoonotic G4P[6] strains, and into the dynamic interaction between porcine and human rotavirus strains.



中文翻译:

来自泰国腹泻患者的 G4P[6] 轮状病毒株的全基因组特征:独立的猪到人种间传播事件的证据

人类 G4P[6] 轮状病毒株的确切进化模式仍有待阐明。此类菌株具有独特的菌株特异性基因型群,提出了 G4P[6] 菌株主要是通过独立的种间传播还是在种间传播后通过人际传播传播的问题。在泰国重症腹泻住院患者的粪便标本中鉴定出两种G4P[6]轮状病毒株,即DU2014-259(RVA/Human-wt/THA/DU2014-259/2014/G4P[6])和PK2015-1 -0001(RVA/人体重量/THA/PK2015-1-0001/2015/G4P[6])。在这里,我们分析了两种人类 G4P[6] 菌株的全基因组,这为研究和确认它们的进化起源提供了机会。在全基因组分析中,两种菌株均表现出独特的 Wa 样基因型星座 G4-P[6]-I1-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1。NSP1 基因型 A8 常见于猪轮状病毒株中。此外,在系统发育分析中,菌株 DU2014-259 和 PK2015-1-0001 的 11 个基因中的每一个似乎都源自猪。另一方面,这两个研究菌株在 11 个基因片段中的 9 个(VP4、VP6、VP1-VP3 和 NSP2-NSP5)始终形成不同的簇,强烈表明发生了独立的猪到人种间传播事件。我们的观察为了解人畜共患病 G4P[6] 毒株的起源以及猪和人轮状病毒毒株之间的动态相互作用提供了重要见解。菌株 DU2014-259 和 PK2015-1-0001 的 11 个基因中的每一个似乎都源自猪。另一方面,这两个研究菌株在 11 个基因片段中的 9 个(VP4、VP6、VP1-VP3 和 NSP2-NSP5)始终形成不同的簇,强烈表明发生了独立的猪到人种间传播事件。我们的观察为了解人畜共患病 G4P[6] 毒株的起源以及猪和人轮状病毒毒株之间的动态相互作用提供了重要见解。菌株 DU2014-259 和 PK2015-1-0001 的 11 个基因中的每一个似乎都源自猪。另一方面,这两个研究菌株在 11 个基因片段中的 9 个(VP4、VP6、VP1-VP3 和 NSP2-NSP5)始终形成不同的簇,强烈表明发生了独立的猪到人种间传播事件。我们的观察为了解人畜共患病 G4P[6] 毒株的起源以及猪和人轮状病毒毒株之间的动态相互作用提供了重要见解。

更新日期:2021-06-09
down
wechat
bug