594 fish genomes have been sequenced in past two decades, this represents 1.85% of the total reported fish species (32,000). Despite this no study represents the trends and only some studies have delved into how the genome size (GS) of the genomes are shaped by species taxonomy. However, all these studies have used data obtained by traditional cytometric methods and also have largely disregarded other genome attributes namely GC, number of chromosomes (CR), number of genes (GE), and protein count (PC). The present study used the most current data on genome attributes of fishes as generated by the whole genome sequencing projects to understand the trends, effect of taxonomy on the genome attributes (GS, GC, CR, GE, and PC) and the interrelation of genome attributes. The trends states that maximum number of fish genomes were sequenced in year 2020, order Cichliformes represents the highest number of published genomes, Illumina is the most used technology for sequencing fish genomes, etc. Our analyses exhibit some concrete trends for fishes as a whole and indicated a strong selection for smaller genomes among all vertebrates and a strong effect of taxonomy on all genome attributes. It also provides clear insights that the fish GS is significantly different from birds, amphibians, reptiles, mammals and insects while the GC only varied from insects. An inverse relation was observed between the GS and GC, and a direct relation was observed between the GS and CR, GE and PC. The results also signify that the per MB value of all the genome attributes decline with increasing GS.

中文翻译：

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鱼类基因组：测序趋势、分类和分类对基因组属性的影响

在过去的 20 年中，已对 594 条鱼类基因组进行了测序，占报告的鱼类总数 (32,000) 的 1.85%。尽管如此，没有研究代表趋势，只有一些研究深入研究了物种分类学如何塑造基因组的基因组大小 (GS)。然而，所有这些研究都使用了通过传统细胞计数方法获得的数据，并且在很大程度上忽略了其他基因组属性，即 GC、染色体数 (CR)、基因数 (GE) 和蛋白质计数 (PC)。本研究利用全基因组测序项目产生的鱼类基因组属性的最新数据来了解趋势、分类对基因组属性（GS、GC、CR、GE 和 PC）的影响以及基因组的相互关系。属性。趋势表明，最大数量的鱼类基因组在 2020 年被测序，Cichliformes 代表已发表基因组数量最多，Illumina 是最常用的鱼类基因组测序技术，等等。我们的分析显示了整个鱼类的一些具体趋势，并表明所有脊椎动物中对较小基因组的强烈选择以及所有基因组属性的分类。它还提供了清晰的见解，即鱼类 GS 与鸟类、两栖动物、爬行动物、哺乳动物和昆虫有显着不同，而 GC 仅与昆虫不同。在GS和GC之间观察到反比关系，在GS和CR、GE和PC之间观察到直接关系。结果还表明所有基因组属性的每 MB 值随着 GS 的增加而下降。Illumina 是对鱼类基因组等进行测序最常用的技术。我们的分析显示了整个鱼类的一些具体趋势，并表明所有脊椎动物中对较小基因组的选择很强，并且分类学对所有基因组属性都有很强的影响。它还提供了清晰的见解，即鱼类 GS 与鸟类、两栖动物、爬行动物、哺乳动物和昆虫有显着不同，而 GC 仅与昆虫不同。在GS和GC之间观察到反比关系，在GS和CR、GE和PC之间观察到直接关系。结果还表明所有基因组属性的每 MB 值随着 GS 的增加而下降。Illumina 是对鱼类基因组等进行测序最常用的技术。我们的分析显示了整个鱼类的一些具体趋势，并表明所有脊椎动物中对较小基因组的选择很强，并且分类学对所有基因组属性都有很强的影响。它还提供了清晰的见解，即鱼类 GS 与鸟类、两栖动物、爬行动物、哺乳动物和昆虫有显着不同，而 GC 仅与昆虫不同。在GS和GC之间观察到反比关系，在GS和CR、GE和PC之间观察到直接关系。结果还表明所有基因组属性的每 MB 值随着 GS 的增加而下降。我们的分析显示了整个鱼类的一些具体趋势，并表明所有脊椎动物中对较小基因组的强烈选择以及分类学对所有基因组属性的强烈影响。它还提供了清晰的见解，即鱼类 GS 与鸟类、两栖动物、爬行动物、哺乳动物和昆虫有显着不同，而 GC 仅与昆虫不同。在GS和GC之间观察到反比关系，在GS和CR、GE和PC之间观察到直接关系。结果还表明所有基因组属性的每 MB 值随着 GS 的增加而下降。我们的分析显示了整个鱼类的一些具体趋势，并表明所有脊椎动物中对较小基因组的强烈选择以及分类学对所有基因组属性的强烈影响。它还提供了清晰的见解，即鱼类 GS 与鸟类、两栖动物、爬行动物、哺乳动物和昆虫有显着不同，而 GC 仅与昆虫不同。在GS和GC之间观察到反比关系，在GS和CR、GE和PC之间观察到直接关系。结果还表明所有基因组属性的每 MB 值随着 GS 的增加而下降。在 GS 和 CR、GE 和 PC 之间观察到直接关系。结果还表明所有基因组属性的每 MB 值随着 GS 的增加而下降。在 GS 和 CR、GE 和 PC 之间观察到直接关系。结果还表明所有基因组属性的每 MB 值随着 GS 的增加而下降。