Cancer is a major health problem which presents a high heterogeneity. In this work we explore omics data from Breast, Kidney and Lung cancers at different levels as signalling pathways, functions and miRNAs, as part of the CAMDA 2019 Hi-Res Cancer Data Integration Challenge. Our goal is to find common functional patterns which give rise to the generic microenvironment in these cancers and contribute to a better understanding of cancer pathogenesis and a possible clinical translation down further studies. After a tumor versus normal tissue comparison of the signaling pathways and cell functions, we found 828 subpathways, 912 Gene Ontology terms and 91 Uniprot keywords commonly significant to the three studied tumors. Such features interestingly show the power to classify tumor samples into subgroups with different survival times, and predict tumor state and tissue of origin through machine learning techniques. We also found cancer-specific alternative activation subpathways, such as the ones activating STAT5A in ErbB signaling pathway. miRNAs evaluation show the role of miRNAs, such as mir-184 and mir-206, as regulators of many cancer pathways and their value in prognoses. The study of the common functional and pathway activities of different cancers is an interesting approach to understand molecular mechanisms of the tumoral process regardless of their tissue of origin. The existence of platforms as the CAMDA challenges provide the opportunity to share knowledge and improve future scientific research and clinical practice.

中文翻译：

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常见的通路和功能特征揭示了乳腺癌、肾癌和肺癌的潜在模式

癌症是一个主要的健康问题，具有高度的异质性。在这项工作中，作为 CAMDA 2019 高分辨率癌症数据集成挑战的一部分，我们探索了来自乳腺癌、肾癌和肺癌的不同水平的组学数据，如信号通路、功能和 miRNA。我们的目标是找到在这些癌症中产生通用微环境的共同功能模式，并有助于更好地了解癌症发病机制和可能的临床转化进一步研究。在对信号通路和细胞功能进行肿瘤与正常组织的比较后，我们发现了 828 个亚通路、912 个基因本体术语和 91 个 Uniprot 关键字，这些关键字对三种研究的肿瘤通常具有重要意义。这些特征有趣地显示了将肿瘤样本分类为具有不同存活时间的亚组的能力，并通过机器学习技术预测肿瘤状态和起源组织。我们还发现了癌症特异性替代激活子通路，例如在 ErbB 信号通路中激活 STAT5A 的那些。miRNA 评估显示了 miRNA，如 mir-184 和 mir-206，作为许多癌症通路的调节剂的作用及其在预后中的价值。研究不同癌症的共同功能和途径活动是一种有趣的方法，可以了解肿瘤过程的分子机制，而不管其组织来源如何。作为 CAMDA 挑战的平台的存在提供了分享知识和改进未来科学研究和临床实践的机会。例如在 ErbB 信号通路中激活 STAT5A 的那些。miRNA 评估显示了 miRNA，如 mir-184 和 mir-206，作为许多癌症通路的调节剂的作用及其在预后中的价值。研究不同癌症的共同功能和途径活动是一种有趣的方法，可以了解肿瘤过程的分子机制，而不管其组织来源如何。作为 CAMDA 挑战的平台的存在提供了分享知识和改进未来科学研究和临床实践的机会。例如在 ErbB 信号通路中激活 STAT5A 的那些。miRNA 评估显示了 miRNA，如 mir-184 和 mir-206，作为许多癌症通路的调节剂的作用及其在预后中的价值。研究不同癌症的共同功能和途径活动是一种有趣的方法，可以了解肿瘤过程的分子机制，而不管其组织来源如何。作为 CAMDA 挑战的平台的存在提供了分享知识和改进未来科学研究和临床实践的机会。研究不同癌症的共同功能和途径活动是一种有趣的方法，可以了解肿瘤过程的分子机制，而不管其组织来源如何。作为 CAMDA 挑战的平台的存在提供了分享知识和改进未来科学研究和临床实践的机会。研究不同癌症的共同功能和途径活动是一种有趣的方法，可以了解肿瘤过程的分子机制，而不管其组织来源如何。作为 CAMDA 挑战的平台的存在提供了分享知识和改进未来科学研究和临床实践的机会。