Cashmere is an important economic resource for the agricultural industry. The secondary hair follicle cycle can control the yield and quality of cashmere. Therefore, to improve the yield and quality of cashmere in Liaoning cashmere goats, an understanding of the skin proteomic changes in the secondary hair follicle cycle is needed. In this study, we used a label-free proteomics approach to analyze the protein expression profile of the secondary hair follicle cycle at three stages (telogen, anagen, and catagen) in goat neck skin. Proteomics, bioinformatics, and immunofluorescence assays were employed. We identified 57 differentially abundant proteins (DAPs) and discovered that the proteins of the keratin family were highly expressed in the anagen and catagen phases. The analyses indicated that nine keratin proteins (KRT25, KRT27, KRT19, KRT10, KRT77, KRT1, KRT24, KRT14, and KRT4) can be regarded as markers of the hair follicle cycle. KRT1 was located in both the inner and outer root sheath, whereas KRT14 was located in the inner root sheath and KRT19 only in the outer sheath. Phylogenetic analysis showed that these nine keratin proteins have common evolutionary precursors, and each category has similar expression patterns. Functional enrichment analysis indicated that the estrogen and ECM-receptor interaction signaling pathways play important roles in secondary hair follicle phases/cycles. These findings provide an important resource for protein information related to cashmere goats, and the identified DAPs can be further applied to improve cashmere quality and production.

羊绒是农业的重要经济资源。次级毛囊周期可以控制羊绒的产量和质量。因此，为了提高辽宁绒山羊的绒山羊产量和质量，需要了解次要毛囊周期中皮肤蛋白质组学的变化。在这项研究中，我们使用了无标记的蛋白质组学方法来分析山羊脖子皮肤中三个阶段（毛发生长，生长期和生长期）的次级毛囊周期的蛋白质表达谱。使用了蛋白质组学，生物信息学和免疫荧光测定法。我们鉴定出57种差异丰富的蛋白质（DAP），并发现角蛋白家族的蛋白质在生长期和后生阶段中高度表达。分析表明，有九种角蛋白（KRT25，KRT27，KRT19，KRT10，KRT77，KRT1，KRT24，KRT14和KRT4）可以视为毛囊周期的标志。KRT1位于内部和外部根鞘中，而KRT14位于内部根鞘中，而KRT19仅位于外部根鞘中。系统发育分析表明，这九种角蛋白具有共同的进化前体，并且每个类别具有相似的表达模式。功能富集分析表明，雌激素和ECM-受体相互作用的信号传导途径在继发性毛囊阶段/周期中起重要作用。这些发现为有关羊绒山羊的蛋白质信息提供了重要的资源，并且已确定的DAP可以进一步用于改善羊绒质量和生产。KRT1位于内部和外部根鞘中，而KRT14位于内部根鞘中，而KRT19仅位于外部根鞘中。系统发育分析表明，这九种角蛋白具有共同的进化前体，并且每个类别具有相似的表达模式。功能富集分析表明，雌激素和ECM-受体相互作用的信号传导途径在继发性毛囊阶段/周期中起重要作用。这些发现为有关羊绒山羊的蛋白质信息提供了重要的资源，并且已确定的DAP可以进一步用于改善羊绒质量和生产。KRT1位于内部和外部根鞘中，而KRT14位于内部根鞘中，而KRT19仅位于外部根鞘中。系统发育分析表明，这九种角蛋白具有共同的进化前体，并且每个类别具有相似的表达模式。功能富集分析表明，雌激素和ECM-受体相互作用的信号传导途径在继发性毛囊阶段/周期中起重要作用。这些发现为有关羊绒山羊的蛋白质信息提供了重要的资源，并且已确定的DAP可以进一步用于改善羊绒质量和生产。系统发育分析表明，这九种角蛋白具有共同的进化前体，并且每个类别具有相似的表达模式。功能富集分析表明，雌激素和ECM-受体相互作用的信号传导途径在继发性毛囊阶段/周期中起重要作用。这些发现为有关羊绒山羊的蛋白质信息提供了重要的资源，并且已确定的DAP可以进一步用于改善羊绒质量和生产。系统发育分析表明，这九种角蛋白具有共同的进化前体，并且每个类别具有相似的表达模式。功能富集分析表明，雌激素和ECM-受体相互作用的信号传导途径在继发性毛囊阶段/周期中起重要作用。这些发现为有关羊绒山羊的蛋白质信息提供了重要的资源，并且已确定的DAP可以进一步用于改善羊绒质量和生产。