Seaside Sparrows (Ammospiza maritima) are tidal salt marsh endemic passerines found along the Atlantic and Gulf coasts of North America. Currently, there are 7 described subspecies, and “MacGillivray’s” Seaside Sparrow (A. m. macgillivraii) is the name given to the Atlantic coast subspecies breeding from North Carolina to northern Florida. In 2019 the US Fish and Wildlife Service received a petition to list this subspecies under the Endangered Species Act due to shrinking populations and loss of marsh habitat, which necessitated a Species Status Assessment. As part of the Species Status Assessment, we analyzed genetic (microsatellite and mitochondria) data from 464 Seaside Sparrows from Connecticut to Florida, USA, to infer population connectivity (gene flow) among Atlantic coast populations, and to assess the concordance of population genetic data with the putative ranges of the subspecies. Bayesian cluster analysis (program Structure) indicates three genetically distinct population segments: (1) Florida + Georgia, (2) Charleston, South Carolina, and (3) North Carolina to Connecticut. The population in Charleston, South Carolina was the most strongly differentiated based on microsatellite data, and harbored a unique mitochondrial haplotype not shared by other sampling locations, possibly reflecting long-standing isolation. Our results indicate population genetic discordance with currently described ranges of the subspecies of Seaside Sparrow and provide grounds for the consideration of separate management plans for the three populations.

中文翻译：

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遗传数据与描述的大西洋沿岸海滨麻雀的亚种范围不一致

海边麻雀 (Ammospiza maritima) 是沿北美大西洋和墨西哥湾沿岸发现的潮汐盐沼特有雀形目。目前，有 7 个被描述的亚种，“MacGillivray 的”海边麻雀 (A. m. macgillivraii) 是从北卡罗来纳州到佛罗里达州北部繁殖的大西洋沿岸亚种的名称。2019 年，由于人口减少和沼泽栖息地丧失，美国鱼类和野生动物管理局收到了一份请愿书，要求根据《濒危物种法》列出该亚种，这需要进行物种状况评估。作为物种状态评估的一部分，我们分析了从康涅狄格州到美国佛罗里达州的 464 只海边麻雀的遗传（微卫星和线粒体）数据，以推断大西洋沿岸种群之间的种群连通性（基因流），并评估种群遗传数据与亚种假定范围的一致性。贝叶斯聚类分析（程序结构）表明三个遗传上不同的人口部分：(1) 佛罗里达州 + 乔治亚州，(2) 南卡罗来纳州查尔斯顿和 (3) 北卡罗来纳州到康涅狄格州。根据微卫星数据，南卡罗来纳州查尔斯顿的人口差异最大，并且拥有其他采样地点不共享的独特线粒体单倍型，这可能反映了长期的孤立。我们的结果表明种群遗传与目前描述的海滨麻雀亚种范围不一致，并为考虑对三个种群进行单独管理计划提供了依据。贝叶斯聚类分析（程序结构）表明三个遗传上不同的人口部分：(1) 佛罗里达州 + 乔治亚州，(2) 南卡罗来纳州查尔斯顿和 (3) 北卡罗来纳州到康涅狄格州。根据微卫星数据，南卡罗来纳州查尔斯顿的人口差异最大，并且拥有其他采样地点不共享的独特线粒体单倍型，这可能反映了长期的孤立。我们的结果表明种群遗传与目前描述的海滨麻雀亚种范围不一致，并为考虑对三个种群进行单独管理计划提供了依据。贝叶斯聚类分析（程序结构）表明三个遗传上不同的人口部分：(1) 佛罗里达州 + 乔治亚州，(2) 南卡罗来纳州查尔斯顿和 (3) 北卡罗来纳州到康涅狄格州。根据微卫星数据，南卡罗来纳州查尔斯顿的人口差异最大，并且拥有其他采样地点不共享的独特线粒体单倍型，这可能反映了长期的孤立。我们的结果表明种群遗传与目前描述的海滨麻雀亚种范围不一致，并为考虑对三个种群进行单独管理计划提供了依据。南卡罗来纳州是基于微卫星数据差异最大的地区，并且具有其他采样地点不共享的独特线粒体单倍型，这可能反映了长期的隔离。我们的结果表明种群遗传与目前描述的海滨麻雀亚种范围不一致，并为考虑对三个种群进行单独管理计划提供了依据。南卡罗来纳州是基于微卫星数据差异最大的地区，并且具有其他采样地点不共享的独特线粒体单倍型，这可能反映了长期的隔离。我们的结果表明种群遗传与目前描述的海滨麻雀亚种范围不一致，并为考虑对三个种群进行单独管理计划提供了依据。