Abstract

To study the molecular genetic structure of hepatitis B virus (HBV) D4 isolates first identified in the Russian Federation. Blood plasma samples of patients from the Republic of Dagestan with previously identified HBV subgenotype D4 were used in the work. For amplification and sequencing reaction, overlapping pairs of specific primers, jointly flanking the entire HBV genome, were used. HBV subgenotype D4 isolates were first detected in the Russian Federation. All 3 isolates were of the ayw2 serotype. Pharmacoresistance mutations L80V and M204I were found in the HIV-infected patient with HBsAg-negative occult HBV. A high frequency of natural polymorphic variants of the Pol gene was shown in all three isolates. In the Precore/Core region, Precore mutations A1846T, C1858T and Core mutations E40D, N74T, N87S, I97F were detected in all 3 isolates. In the X region, all 3 isolates had V5L and P38S mutations. Phylogenetic analysis of the full-length HBV genome showed that the isolates were grouped together with the subgenotype D4 isolate from South Africa. The origin of all three patients with the above isolates from the same geographic region, the phylogenetic proximity of the nucleotide sequences of the complete virus genomes, and a number of identical mutations and polymorphic variants in different genes in all three isolates indicate an independent single import of the virus with the subsequent spread. The routes of distribution, as well as the frequency of HBV D4 occurrence in the Republic of Dagestan, remain unknown and require further research.

中文翻译：

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在俄罗斯联邦的慢性，急性和隐匿性乙型肝炎患者中检测到乙型肝炎病毒D4亚型的首例病例

摘要

为了研究乙型肝炎病毒（HBV）D4分离株的分子遗传结构，首先在俄罗斯联邦进行了鉴定。在这项工作中，使用了达吉斯坦共和国先前鉴定为HBV亚型D4基因型的患者的血浆样本。为了进行扩增和测序反应，使用了重叠的一对特异性引物，它们共同位于整个HBV基因组的侧面。HBV亚型D4分离株首先在俄罗斯联邦发现。所有3个分离株均为ayw2血清型。在感染了HBsAg阴性潜伏性HBV的HIV感染患者中发现了药物抗性突变L80V和M204I。在所有三个分离物中均显示出高频率的Pol基因天然多态变体。在Precore / Core区域中，在所有3个分离物中均检测到Precore突变A1846T，C1858T和Core突变E40D，N74T，N87S，I97F。在X区域，所有3个分离株均具有V5L和P38S突变。全长HBV基因组的系统发育分析表明，分离株与来自南非的D4亚型分离株一起分组。具有上述分离株的所有三名患者的起源均来自同一地理区域，完整病毒基因组核苷酸序列的系统进化接近性，以及所有三种分离物中不同基因中的许多相同突变和多态性变体表明它们是独立的单次输入病毒并随后传播。在达吉斯坦共和国的传播途径以及HBV D4发生的频率仍然未知，需要进一步研究。全长HBV基因组的系统发育分析表明，分离株与来自南非的D4亚型分离株一起分组。具有上述分离株的所有三名患者的起源均来自同一地理区域，完整病毒基因组核苷酸序列的系统进化接近性，以及所有三种分离物中不同基因中的许多相同突变和多态性变体表明它们是独立的单次输入病毒并随后传播。在达吉斯坦共和国的传播途径以及HBV D4发生的频率仍然未知，需要进一步研究。全长HBV基因组的系统发育分析表明，分离株与来自南非的D4亚型分离株一起分组。具有上述分离株的所有三名患者的起源均来自同一地理区域，完整病毒基因组核苷酸序列的系统进化接近性，以及所有三种分离物中不同基因中的许多相同突变和多态性变体表明它们是独立的单次输入病毒并随后传播。在达吉斯坦共和国的传播途径以及HBV D4发生的频率仍然未知，需要进一步研究。完整病毒基因组核苷酸序列的系统发生亲缘关系以及所有三个分离物中不同基因中许多相同的突变和多态性变体表明病毒的独立单次导入及其随后的传播。在达吉斯坦共和国的传播途径以及HBV D4发生的频率仍然未知，需要进一步研究。完整病毒基因组核苷酸序列的系统发生亲缘关系以及所有三个分离物中不同基因中许多相同的突变和多态性变体表明病毒的独立单次导入及其随后的传播。在达吉斯坦共和国的传播途径以及HBV D4发生的频率仍然未知，需要进一步研究。