当前位置: X-MOL 学术bioRxiv. Immunol. › 论文详情
Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)
考虑到B细胞行为和采样偏倚可产生膀胱癌中抗PD-L1反应的出色预测指标
bioRxiv - Immunology Pub Date : 2021-03-04 , DOI: 10.1101/2021.03.04.433370
I.A. Dyugay , D.K. Lukyanov , M.A. Turchaninova , A.R. Zaretsky , O. Khalmurzaev , V.B. Matveev , M. Shugay , P.V. Shelyakin , D.M. Chudakov

肿瘤浸润性B细胞和肿瘤内产生的免疫球蛋白(IG)在肿瘤微环境和对免疫疗法的反应中起重要作用。肿瘤内B细胞产生的IgG抗体可能会驱动抗体依赖性细胞毒性(ADCC),并增强树突状细胞的抗原呈递。此外,B细胞是有效的抗原特异性抗原呈递剂,可实质上调节辅助T细胞的行为。在这里,我们调查了肿瘤内IG同种型和克隆性在膀胱癌中的作用。我们的结果表明,IgG1 / IgA比为抗PD-L1免疫治疗中的基底鳞状亚型和整个ImVigor210队列提供了强大而独立的预后指标。我们的发现还表明,效应子B细胞的功能而不是克隆产生的抗体,参与抗肿瘤反应。较高的IgG1 / IgA比例与细胞毒性基因的相对丰度和IL-21 / IL-21R轴的突出有关,提示T细胞/ B细胞相互作用的重要性。我们整合了B,NK和T细胞成分,并采用类似immFocus的归一化方法来说明肿瘤组织采样的随机性。使用具有嵌套交叉验证的随机森林模型,我们开发了基于肿瘤RNA-Seq的抗PD-L1治疗反应的肌肉浸润性尿路上皮癌预测因子。与PD-L1表达评分或现有基因签名相比,所得的PRIMUS(预测分子签名)预测因子可实现更高的灵敏度,即使在作为分析集的沙漠患者亚组中也可以可靠地鉴定响应者。较高的IgG1 / IgA比例与细胞毒性基因的相对丰度和IL-21 / IL-21R轴的突出有关,提示T细胞/ B细胞相互作用的重要性。我们整合了B,NK和T细胞成分,并采用类似immFocus的归一化方法来说明肿瘤组织采样的随机性。使用具有嵌套交叉验证的随机森林模型,我们开发了基于肿瘤RNA-Seq的抗PD-L1治疗反应的肌肉浸润性尿路上皮癌预测因子。与PD-L1表达评分或现有基因签名相比,所得的PRIMUS(预测分子签名)预测因子可实现更高的灵敏度,即使在作为分析集的沙漠患者亚组中也可以可靠地鉴定响应者。较高的IgG1 / IgA比例与细胞毒性基因的相对丰度和IL-21 / IL-21R轴的突出有关,提示T细胞/ B细胞相互作用的重要性。我们整合了B,NK和T细胞成分,并采用类似immFocus的归一化方法来说明肿瘤组织采样的随机性。使用具有嵌套交叉验证的随机森林模型,我们开发了基于肿瘤RNA-Seq的抗PD-L1治疗反应的肌肉浸润性尿路上皮癌预测因子。与PD-L1表达评分或现有基因签名相比,所得的PRIMUS(预测分子签名)预测因子可实现更高的灵敏度,即使在作为分析支持集的沙漠患者亚组中,也可以可靠地鉴定响应者。



"点击查看英文标题和摘要"

更新日期:2021-03-05
down
wechat
bug