研究基因表达的遗传变异为揭示复杂性状的分子组成提供了一种有力的方法。已经在几种不同的模型物种中进行了表达QTL研究，但是大多数这些连锁研究都基于两个亲本等位基因的遗传分离。最近，我们从线虫秀丽隐杆线虫的四个野生分离株（JU1511，JU1926，JU1931和JU1941）中开发了200个重组自交系（mpRIL）的多亲分离群体。。我们使用RNA-seq来研究多个等位基因如何影响这些mpRILs中的基因表达。我们发现了1,789个基因在亲本系之间差异表达。发现了超过7,896个基因的超越，超出了mpRILs的任何亲本系的表达。对于表达QTL定位，近9,000个SNP可用。通过将这些SNP和mpRIL的RNA-seq谱图相结合，我们检测到了近6,800个eQTL。大多数trans-eQTL（63％）共位于六个新识别的跨频带中。在先前的2亲本等位基因eQTL实验中发现的trans-eQTL和这项研究显示出一些重叠（17.5％-46.8％），一方面强调了一大批基因受人群和条件的多态性调控因素的影响，另一方面，它表明mpRIL群体可以鉴定新的基因表达调控基因座。两者合计，对我们的mpRIL人群的分析为您提供了更精细的见解秀丽隐杆线虫的复杂性状遗传学和eQTL一般而言，也是进一步测试和开发用于检测多等位基因eQTL和系统遗传学以研究基因型与表型关系的高级统计模型的起点。



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