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scCorr:用于单细胞基因-基因相关性分析的基于图的k划分方法
bioRxiv - Bioinformatics Pub Date : 2021-03-05 , DOI: 10.1101/2021.03.04.433945
Heng Xu , Ying Hu , Xinyu Zhang , Bradley E. Aouizerat , Chunhua Yan , Ke Xu

单细胞RNA测序分析中的一个重要挑战是零值的丰度,这会导致下游分析的基因-基因相关性估计有偏差。在这里,我们通过合并“同源性”单元以减少零值的数量,提出了一种新颖的基于图的k划分方法。我们的方法对于相关基因对的检测是可靠且可靠的,这对于网络构建,基因-基因相互作用和细胞组学分析至关重要。



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更新日期:2021-03-05
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