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使用组织图从不精确和不完整的标签中学习全幻灯片分割
arXiv - CS - Computer Vision and Pattern Recognition Pub Date : 2021-03-04 , DOI: arxiv-2103.03129
Valentin Anklin, Pushpak Pati, Guillaume Jaume, Behzad Bozorgtabar, Antonio Foncubierta-Rodríguez, Jean-Philippe Thiran, Mathilde Sibony, Maria Gabrani, Orcun Goksel

必须将组织学图像分割为诊断相关区域,以支持病理学家及时,可靠地做出决定。为此,已经提出了计算机辅助技术来描绘扫描的组织学幻灯片中的相关区域。然而,这些技术需要注释像素的特定于任务的大型数据集,这对于许多组织学任务而言既乏味,耗时,昂贵且难以获取。因此,提出了弱监督语义分割技术,以利用便宜监督和便宜获取的弱监督。在本文中,我们提出了一种使用图形的弱监督分割方法SegGini,该方法可以利用弱多路复用注解(即不精确和不完整的注解)对任意图像和大图像进行分割,从组织微阵列(TMA)缩放到整个幻灯片图像(WSI) 。形式上,SegGini会为输入的组织学图像构造组织图表示,其中图节点描述组织区域。然后,它通过使用不精确的图像级标签,不完整的涂鸦或同时通过两者进行节点分类,执行弱监督分割。我们在两个包含TMA和WSI的公共前列腺癌数据集上评估了SegGini。我们的方法在各种注释设置的两个数据集上均实现了最新的分割性能,同时可与病理学家的基线相媲美。我们在两个包含TMA和WSI的公共前列腺癌数据集上评估了SegGini。我们的方法在各种注释设置的两个数据集上均实现了最新的分割性能,同时可与病理学家的基线相媲美。我们在两个包含TMA和WSI的公共前列腺癌数据集上评估了SegGini。我们的方法在各种注释设置的两个数据集上均实现了最新的分割性能,同时可与病理学家的基线相媲美。



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更新日期:2021-03-05
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