当前位置: X-MOL 学术Genome Biol. Evol. › 论文详情
Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)
Agrypnia vestita Walker 和 Hesperophylax magnus Banks 的基因组组装和注释草案揭示了管状制盒石蝇(昆虫纲:毛翅目)中的大量重复元素扩展
Genome Biology and Evolution ( IF 3.2 ) Pub Date : 2021-01-18 , DOI: 10.1093/gbe/evab013
Lindsey K Olsen 1 , Jacqueline Heckenhauer 2, 3 , John S Sproul 4 , Rebecca B Dikow 5 , Vanessa L Gonzalez 6 , Matthew P Kweskin 7 , Adam M Taylor 1 , Seth B Wilson 1 , Russell J Stewart 8 , Xin Zhou 9 , Ralph Holzenthal 10 , Steffen U Pauls 2, 3, 11 , Paul B Frandsen 1, 2, 5
Affiliation  

毛翅目(石蛾)在淡水生态系统中发挥着重要作用;例如,幼虫从水中加工有机物质,是各种捕食者的食物。关于石蝇基因组多样性的知识可以促进比较和系统发育研究,从而使科学家能够更好地了解石蝇的进化历史。尽管毛翅目是最多样化的水生昆虫目,但它们在基因组资源方面的代表性仍然很低。迄今为止,所有基于长读长的基因组都已从撤退亚目 Annulipalpia 中的个体中测序,留下 275 Ma 的进化没有高质量的基因组资源。在这里,我们报告了来自 Integripalpia 亚目的两个管壳毛翅目的第一个基于长读长的从头基因组组装,Agrypnia vestita Walker 和 Hesperophylax magnus Banks。我们发现,这些管壳制作的石蛾的基因组大小至少比目前测序的年长类动物基因组大 3 倍,并且这种模式至少部分是由重复元素的主要扩展驱动的。在 H. magnus 中,仅长散布的核元素就超过了一些环距动物对应物的整个基因组大小,这表明石蝇作为了解不同昆虫谱系中基因组大小进化的模型具有很高的潜力。



"点击查看英文标题和摘要"

更新日期:2021-01-18
down
wechat
bug