We analyzed the peculiarities of the copy number variation of genes that regulate apoptosis, DNA repair, cell proliferation, metabolism, and estrogen reception in tumor and normal cells of high-grade and low-grade serous adenocarcinoma of the ovaries. Using real-time qPCR method, the relative copy number of 34 genes ( BAX , BCL2 , TP53 , MDM2 , CASP9 , CASP3 , CASP7 , CASP8 , PRKCI , SOX2 , OCT4 , PIK3 , PTEN , C-MYC , SOX18 , AKT1 , NOTCH1 , BRCA1 , BRCA2 , EXO1 , SCNN1A , KRAS , EGFR , BRAF , CYP1A1 , CYP1A2 , CYP1B1 , CYP19A , ESR1 , ESR2 , GPER , STS , SULT1A , and SULT1E1 ) was determined in normal and tumor cells of the ovaries extracted by contactless capture laser microsection from FFPE-blocks of 200 patients. The most typical molecular markers of ovarian serous adenocarcinoma cells were identified: copy number of PIK3CA , BCL2 , BAX , CASP3 , and CASP8 genes. Based on the differences in the gene copy number variation, two molecular subtypes of serous adenocarcinoma were identified, corresponding to two histological subtypes: high-grade ( MDM2 , SOX2 , ESR1 , CYP1B1 , SULT1E1 , TP53 , BRCA2 ) and low-grade ( PIK3CA , PTEN , BCL2 , BAX , and CASP3 ). Each of these subtypes was also characterized by molecular heterogeneity and can be subdivided into several subgroups: 3 subgroups for high-grade and 4 subgroups for low-grade serous adenocarcinoma. These findings extend our understanding of the molecular mechanisms of carcinogenesis in the ovarian tissue, confirm molecular difference between the two histological subtypes of serous adenocarcinoma probably underlying their different clinical course.

中文翻译：

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浆液性卵巢腺癌患者肿瘤细胞中某些基因拷贝数变异的特征

我们分析了卵巢高级别和低级别浆液性腺癌的肿瘤和正常细胞中调节凋亡、DNA 修复、细胞增殖、代谢和雌激素接收的基因拷贝数变异的特性。使用实时qPCR方法，34个基因（BAX、BCL2、TP53、MDM2、CASP9、CASP3、CASP7、CASP8、PRKCI、SOX2、OCT4、PIK3、PTEN、C-MYC、SOX18、NOTCH1AK）的相对拷贝数, BRCA1 , BRCA2 , EXO1 , SCNN1A , KRAS , EGFR , BRAF , CYP1A1 , CYP1A2 , CYP1B1 , CYP19A , ESR1 , ESR2 , GPER , STS , SULT1A , 和 SULT1E1来自 200 名患者的 FFPE 块的激光显微切片。鉴定出卵巢浆液性腺癌细胞最典型的分子标志物：PIK3CA、BCL2、BAX、CASP3 和 CASP8 基因。根据基因拷贝数变异的差异，确定了浆液性腺癌的两种分子亚型，对应于两种组织学亚型：高级别（MDM2、SOX2、ESR1、CYP1B1、SULT1E1、TP53、BRCA2）和低级别（PIK3CA） 、 PTEN 、 BCL2 、 BAX 和 CASP3 ）。这些亚型中的每一个还具有分子异质性的特征，可以细分为几个亚组：3 个亚组用于高级别浆液性腺癌，4 个亚组用于低级别浆液性腺癌。这些发现扩展了我们对卵巢组织癌变分子机制的理解，证实了浆液性腺癌的两种组织学亚型之间的分子差异，这可能是它们不同临床过程的基础。鉴定了浆液性腺癌的两种分子亚型，对应于两种组织学亚型：高级别（MDM2、SOX2、ESR1、CYP1B1、SULT1E1、TP53、BRCA2）和低级别（PIK3CA、PTEN、BCL2、BAX3）。这些亚型中的每一个还具有分子异质性的特征，可以细分为几个亚组：3 个亚组用于高级别浆液性腺癌，4 个亚组用于低级别浆液性腺癌。这些发现扩展了我们对卵巢组织癌变分子机制的理解，证实了浆液性腺癌的两种组织学亚型之间的分子差异，这可能是它们不同临床过程的基础。鉴定了浆液性腺癌的两种分子亚型，对应于两种组织学亚型：高级别（MDM2、SOX2、ESR1、CYP1B1、SULT1E1、TP53、BRCA2）和低级别（PIK3CA、PTEN、BCL2、BAX3）。这些亚型中的每一个还具有分子异质性的特征，可以细分为几个亚组：3 个亚组用于高级别浆液性腺癌，4 个亚组用于低级别浆液性腺癌。这些发现扩展了我们对卵巢组织癌变分子机制的理解，证实了浆液性腺癌的两种组织学亚型之间的分子差异，这可能是它们不同临床过程的基础。BRCA2 ）和低级（ PIK3CA 、 PTEN 、 BCL2 、 BAX 和 CASP3 ）。这些亚型中的每一个还具有分子异质性的特征，可以细分为几个亚组：3 个亚组用于高级别浆液性腺癌，4 个亚组用于低级别浆液性腺癌。这些发现扩展了我们对卵巢组织癌变分子机制的理解，证实了浆液性腺癌的两种组织学亚型之间的分子差异，这可能是它们不同临床过程的基础。BRCA2 ）和低级（ PIK3CA 、 PTEN 、 BCL2 、 BAX 和 CASP3 ）。这些亚型中的每一个还具有分子异质性的特征，可以细分为几个亚组：3 个亚组用于高级别浆液性腺癌，4 个亚组用于低级别浆液性腺癌。这些发现扩展了我们对卵巢组织癌变分子机制的理解，证实了浆液性腺癌的两种组织学亚型之间的分子差异，这可能是它们不同临床过程的基础。