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A student centric method for calculation of fatty acid energetics: Integrated formula and web tool
Biochemistry and Molecular Biology Education ( IF 1.4 ) Pub Date : 2021-01-11 , DOI: 10.1002/bmb.21486
Paras Jain 1 , Sneha Singh 2 , Aditya Arya 2
Affiliation  

Mitochondrial beta-oxidation is one of the most common modes of fatty acids' oxidation in most organisms, particularly mammals. Biochemistry undergraduate curriculum often contains the description of the process, with emphasis on ATP calculations for various types of fatty acids. During our decade long teaching experience in biochemistry, we observed the difficulty faced by students in calculating energetics of several fatty acids beyond palmitic acid. We developed a canonical formula by mathematical transformations and logical derivation to aid the calculation in a much simpler manner to ease both teaching and learning experience. ATP yield of even-numbered fatty acids may be calculated using a formula [(7C - 6 - 1.5 D) - 2(D-2)], andadenosine triphosphate (ATP) yield for odd-numbered fatty acids can be calculated using [(7C - 19 - 1.5 D) - 2(D-2)], where C is the number of carbon atoms in fatty acids, D is the number of double bonds. The unbold part of the formulae is limited to polyunsaturated fatty acids. Moreover, we integrated these formulae into an HTML based web-interface for handily calculations, which is likely to augment fatty acids oxidation learning-teaching processes easier. This tool has been recently tested in our classroom programs on biochemistry and received an excellent feedback from the learners. Also, the mathematical formula is ready for being incorporated into standard biochemistry textbooks. The webtool as an opensource biochemical calculator can be effectively used in classrooms by both instructors and students while solving comprehension based questions on lipid metabolism.

中文翻译:

一种以学生为中心的脂肪酸能量计算方法:综合公式和网络工具

线粒体β-氧化是大多数生物体,尤其是哺乳动物中最常见的脂肪酸氧化模式之一。生物化学本科课程通常包含对过程的描述,重点是各种脂肪酸的 ATP 计算。在我们长达十年的生物化学教学经验中,我们观察到学生在计算棕榈酸以外的几种脂肪酸的能量时所面临的困难。我们通过数学变换和逻辑推导开发了一个规范公式,以更简单的方式帮助计算,以减轻教学和学习体验。偶数脂肪酸的 ATP 产量可以使用公式 [(7C - 6 - 1.5 D) - 2(D-2)] 计算,奇数脂肪酸的三磷酸腺苷 (ATP) 产量可以使用 [( 7C - 19 - 1。5 D) - 2(D-2)],其中C是脂肪酸中的碳原子数,D是双键数。公式的粗体部分仅限于多不饱和脂肪酸。此外,我们将这些公式集成到基于 HTML 的 Web 界面中以方便计算,这可能会更轻松地增加脂肪酸氧化的学习-教学过程。该工具最近在我们的生物化学课堂课程中进行了测试,并收到了学习者的极好反馈。此外,数学公式已准备好纳入标准生物化学教科书。作为开源生化计算器的 webtool 可以被教师和学生有效地在课堂上使用,同时解决基于理解的脂质代谢问题。D 是双键的数量。公式的粗体部分仅限于多不饱和脂肪酸。此外,我们将这些公式集成到基于 HTML 的 Web 界面中以方便计算,这可能会更轻松地增加脂肪酸氧化的学习-教学过程。该工具最近在我们的生物化学课堂课程中进行了测试,并收到了学习者的极好反馈。此外,数学公式已准备好纳入标准生物化学教科书。作为开源生化计算器的 webtool 可以被教师和学生有效地在课堂上使用,同时解决基于理解的脂质代谢问题。D 是双键的数量。公式的粗体部分仅限于多不饱和脂肪酸。此外,我们将这些公式集成到基于 HTML 的 Web 界面中以方便计算,这可能会更轻松地增加脂肪酸氧化的学习-教学过程。该工具最近在我们的生物化学课堂课程中进行了测试,并收到了学习者的极好反馈。此外,数学公式已准备好纳入标准生物化学教科书。作为开源生化计算器的 webtool 可以被教师和学生有效地在课堂上使用,同时解决基于理解的脂质代谢问题。我们将这些公式集成到一个基于 HTML 的网络界面中以方便计算,这可能会更容易地增加脂肪酸氧化的学习-教学过程。该工具最近在我们的生物化学课堂课程中进行了测试,并收到了学习者的极好反馈。此外,数学公式已准备好纳入标准生物化学教科书。作为开源生化计算器的 webtool 可以被教师和学生有效地在课堂上使用,同时解决基于理解的脂质代谢问题。我们将这些公式集成到一个基于 HTML 的网络界面中以方便计算,这可能会更容易地增加脂肪酸氧化的学习-教学过程。该工具最近在我们的生物化学课堂课程中进行了测试,并收到了学习者的极好反馈。此外,数学公式已准备好纳入标准生物化学教科书。作为开源生化计算器的 webtool 可以被教师和学生有效地用于课堂,同时解决基于理解的脂质代谢问题。数学公式已准备好纳入标准生物化学教科书。作为开源生化计算器的 webtool 可以被教师和学生有效地在课堂上使用,同时解决基于理解的脂质代谢问题。数学公式已准备好纳入标准生物化学教科书。作为开源生化计算器的 webtool 可以被教师和学生有效地在课堂上使用,同时解决基于理解的脂质代谢问题。
更新日期:2021-01-11
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