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Pathogen surveillance in Southern Ocean pinnipeds
Polar Research ( IF 1.9 ) Pub Date : 2020-12-17 , DOI: 10.33265/polar.v39.3841
Sandra Núñez-Egido , Andrew Lowther , Ingebjørg H. Nymo , Jörn Klein , Eva M. Breines , Morten Tryland

Knowledge of the health status and potential effect of disease outbreaks among Southern Ocean fauna may be decisive for its conservation. We assessed the exposure and infection of Antarctic fur seals (Arctocephalus gazella, AFS) and Southern elephant seals (Mirounga leonine, SES) to parapoxvirus, Phocid alphaherpesvirus-1 (PhHV-1), smooth Brucella spp. and Toxoplasma gondii. AFS (n = 65) serum and swab samples, and SES (n = 13) serum samples from the sub--Antarctic island of Bouvetoya (54°25’S, 03°22’E) were collected during two austral summers (2014/15, 2017/18). Three polymerase chain reaction (PCR) tests amplifying the DNA polymerase, B2L and GIF parapoxvirus genomic regions were performed, investigating DNA from mucosal swab samples. The glycoprotein B gene was targeted to detect PhHV-1 viral DNA. Sera were assayed for T. gondii and smooth Brucella spp. antibodies with indirect enzyme-linked immunosorbent assays. Parapoxvirus PCR amplicons of the expected size were generated in two of the 29 AFS pups (nasal swabs, 2014/15), targeting the B2L (n = 2) and DNA polymerase (n = 1) genes, whereas the GIF PCR did not amplify target sequences. The PCR amplicons were sequenced and blasted in GenBank, revealing highest similarity with a seal parapoxvirus, confirming the presence of the virus in AFS for the first time. No PhHV-1 amplicons were generated, and antibodies against T. gondii or smooth Brucella spp. were not detected. Our data indicate that these seals are host for parapoxvirus but are neither exposed to smooth Brucella spp. nor T. gondii. Evidence of PhHV-1 shedding was not detected.

中文翻译:

南大洋鳍足类的病原体监测

了解南大洋动物群中疾病爆发的健康状况和潜在影响可能对其保护具有决定性意义。我们评估了南极海豹(Arctocephalus Gagella,AFS)和南象海豹(Mirounga leonine,SES)对副痘病毒、Phocid alphaherpesvirus-1 (PhHV-1)、光滑布鲁氏菌的暴露和感染。和弓形虫。AFS (n = 65) 血清和拭子样本,以及来自亚南极布韦托亚岛 (54°25'S, 03°22'E) 的 SES (n = 13) 血清样本是在两个南方夏季(2014/15 , 2017/18)。进行了三个扩增 DNA 聚合酶、B2L 和 GIF 副痘病毒基因组区域的聚合酶链反应 (PCR) 测试,研究了来自粘膜拭子样本的 DNA。糖蛋白 B 基因的目标是检测 PhHV-1 病毒 DNA。检测血清中的 T。刚地和光滑的布鲁氏菌属。抗体与间接酶联免疫吸附测定。在 29 只 AFS 幼崽中的两只(鼻拭子,2014/15)中产生了预期大小的副痘病毒 PCR 扩增子,靶向 B2L(n = 2)和 DNA 聚合酶(n = 1)基因,而 GIF PCR 未扩增目标序列。PCR 扩增子在 GenBank 中进行了测序和爆破,揭示了与海豹副痘病毒的最高相似性,首次证实了 AFS 中该病毒的存在。没有产生 PhHV-1 扩增子,并且产生了抗弓形虫或平滑布鲁氏菌的抗体。未被发现。我们的数据表明,这些海豹是副痘病毒的宿主,但都没有暴露于光滑的布鲁氏菌属。也不是弓形虫。没有检测到 PhHV-1 脱落的证据。在 29 只 AFS 幼崽中的两只(鼻拭子,2014/15)中产生了预期大小的副痘病毒 PCR 扩增子,靶向 B2L(n = 2)和 DNA 聚合酶(n = 1)基因,而 GIF PCR 未扩增目标序列。PCR 扩增子在 GenBank 中进行了测序和爆破,揭示了与海豹副痘病毒的最高相似性,首次证实了 AFS 中该病毒的存在。没有产生 PhHV-1 扩增子,并且产生了抗弓形虫或平滑布鲁氏菌的抗体。未被发现。我们的数据表明,这些海豹是副痘病毒的宿主,但都没有暴露于光滑的布鲁氏菌属。也不是弓形虫。没有检测到 PhHV-1 脱落的证据。在 29 只 AFS 幼崽中的两只(鼻拭子,2014/15)中产生了预期大小的副痘病毒 PCR 扩增子,靶向 B2L(n = 2)和 DNA 聚合酶(n = 1)基因,而 GIF PCR 未扩增目标序列。PCR 扩增子在 GenBank 中进行测序和爆破,显示出与海豹副痘病毒的最高相似性,首次证实了 AFS 中该病毒的存在。没有产生 PhHV-1 扩增子,并且产生了抗弓形虫或平滑布鲁氏菌的抗体。未被发现。我们的数据表明,这些海豹是副痘病毒的宿主,但都没有暴露于光滑的布鲁氏菌属。也不是弓形虫。没有检测到 PhHV-1 脱落的证据。而 GIF PCR 没有扩增目标序列。PCR 扩增子在 GenBank 中进行了测序和爆破,揭示了与海豹副痘病毒的最高相似性,首次证实了 AFS 中该病毒的存在。没有产生 PhHV-1 扩增子,并且产生了抗弓形虫或平滑布鲁氏菌的抗体。未被发现。我们的数据表明,这些海豹是副痘病毒的宿主,但都没有暴露于光滑的布鲁氏菌属。也不是弓形虫。没有检测到 PhHV-1 脱落的证据。而 GIF PCR 没有扩增目标序列。PCR 扩增子在 GenBank 中进行了测序和爆破,揭示了与海豹副痘病毒的最高相似性,首次证实了 AFS 中该病毒的存在。没有产生 PhHV-1 扩增子,并且产生了抗弓形虫或平滑布鲁氏菌的抗体。未被发现。我们的数据表明,这些海豹是副痘病毒的宿主,但都没有暴露于光滑的布鲁氏菌属。也不是弓形虫。没有检测到 PhHV-1 脱落的证据。我们的数据表明,这些海豹是副痘病毒的宿主,但都没有暴露于光滑的布鲁氏菌属。也不是弓形虫。没有检测到 PhHV-1 脱落的证据。我们的数据表明,这些海豹是副痘病毒的宿主,但都没有暴露于光滑的布鲁氏菌属。也不是弓形虫。没有检测到 PhHV-1 脱落的证据。
更新日期:2020-12-17
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