Somatic LINE-1 (L1) retrotransposition has been detected in early embryos, adult brains, and the gastrointestinal (GI) tract, and many cancers, including epithelial GI tumors. We previously found numerous somatic L1 insertions in paired normal and GI cancerous tissues. Here, using a modified method of single-cell analysis for somatic L1 insertions, we studied adenocarcinomas of colon, pancreas, and stomach, and found a variable number of somatic L1 insertions in tumors of the same type from patient to patient. We detected no somatic L1 insertions in single cells of 5 of 10 tumors studied. In three tumors, aneuploid cells were detected by FACS. In one pancreatic tumor, there were many more L1 insertions in aneuploid than in euploid tumor cells. In one gastric cancer, both aneuploid and euploid cells contained large numbers of likely clonal insertions. However, in a second gastric cancer with aneuploid cells, no somatic L1 insertions were found. We suggest that when the cellular environment is favorable to retrotransposition, aneuploidy predisposes tumor cells to L1 insertions, and retrotransposition may occur at the transition from euploidy to aneuploidy. Seventeen percent of insertions were also present in normal cells, similar to findings in genomic DNA from normal tissues of GI tumor patients. We provide evidence that: 1) The number of L1 insertions in tumors of the same type is highly variable, 2) most somatic L1 insertions in GI cancer tissues are absent from normal tissues, and 3) under certain conditions, somatic L1 retrotransposition exhibits a propensity for occurring in aneuploid cells.

已在早期胚胎、成人大脑和胃肠道 (GI) 以及包括上皮 GI 肿瘤在内的许多癌症中检测到体细胞 LINE-1 (L1) 逆转录转座。我们之前在成对的正常和 GI 癌组织中发现了许多体细胞 L1 插入。在这里，我们使用改进的单细胞分析方法对体细胞 L1 插入进行了研究，研究了结肠、胰腺和胃的腺癌，并在不同患者的同一类型肿瘤中发现了不同数量的体细胞 L1 插入。我们在研究的 10 个肿瘤中的 5 个的单个细胞中没有检测到体细胞 L1 插入。在三个肿瘤中，通过 FACS 检测到非整倍体细胞。在一个胰腺肿瘤中，非整倍体中的 L1 插入比整倍体肿瘤细胞中的多得多。在一个胃癌中，非整倍体和整倍体细胞都含有大量可能的克隆插入。然而，在第二个具有非整倍体细胞的胃癌中，没有发现体细胞 L1 插入。我们认为，当细胞环境有利于逆转录转座时，非整倍体使肿瘤细胞易发生 L1 插入，逆转录转座可能发生在从整倍体向非整倍体的转变中。17% 的插入也存在于正常细胞中，类似于 GI 肿瘤患者正常组织的基因组 DNA 中的发现。我们提供的证据表明：1）同一类型肿瘤中 L1 插入的数量是高度可变的，2）GI 癌组织中的大多数体细胞 L1 插入在正常组织中不存在，以及 3）在某些条件下，体细胞 L1 逆转录转座表现出在非整倍体细胞中发生的倾向。在第二个具有非整倍体细胞的胃癌中，没有发现体细胞 L1 插入。我们认为，当细胞环境有利于逆转录转座时，非整倍体使肿瘤细胞易发生 L1 插入，逆转录转座可能发生在从整倍体向非整倍体的转变中。17% 的插入也存在于正常细胞中，类似于 GI 肿瘤患者正常组织的基因组 DNA 中的发现。我们提供的证据表明：1）同一类型肿瘤中 L1 插入的数量是高度可变的，2）GI 癌组织中的大多数体细胞 L1 插入在正常组织中不存在，以及 3）在某些条件下，体细胞 L1 逆转录转座表现出在非整倍体细胞中发生的倾向。在第二个具有非整倍体细胞的胃癌中，没有发现体细胞 L1 插入。我们认为，当细胞环境有利于逆转录转座时，非整倍体使肿瘤细胞易发生 L1 插入，逆转录转座可能发生在从整倍体向非整倍体的转变中。17% 的插入也存在于正常细胞中，类似于 GI 肿瘤患者正常组织的基因组 DNA 中的发现。我们提供的证据表明：1）同一类型肿瘤中 L1 插入的数量是高度可变的，2）GI 癌组织中的大多数体细胞 L1 插入在正常组织中不存在，以及 3）在某些条件下，体细胞 L1 逆转录转座表现出在非整倍体细胞中发生的倾向。我们认为，当细胞环境有利于逆转录转座时，非整倍体使肿瘤细胞易发生 L1 插入，逆转录转座可能发生在从整倍体向非整倍体的转变中。17% 的插入也存在于正常细胞中，类似于 GI 肿瘤患者正常组织的基因组 DNA 中的发现。我们提供的证据表明：1）同一类型肿瘤中 L1 插入的数量是高度可变的，2）GI 癌组织中的大多数体细胞 L1 插入在正常组织中不存在，以及 3）在某些条件下，体细胞 L1 逆转录转座表现出在非整倍体细胞中发生的倾向。我们认为，当细胞环境有利于逆转录转座时，非整倍体使肿瘤细胞易发生 L1 插入，逆转录转座可能发生在从整倍体向非整倍体的转变中。17% 的插入也存在于正常细胞中，类似于 GI 肿瘤患者正常组织的基因组 DNA 中的发现。我们提供的证据表明：1）同一类型肿瘤中 L1 插入的数量是高度可变的，2）GI 癌组织中的大多数体细胞 L1 插入在正常组织中不存在，以及 3）在某些条件下，体细胞 L1 逆转录转座表现出在非整倍体细胞中发生的倾向。17% 的插入也存在于正常细胞中，类似于 GI 肿瘤患者正常组织的基因组 DNA 中的发现。我们提供的证据表明：1）同一类型肿瘤中 L1 插入的数量是高度可变的，2）GI 癌组织中的大多数体细胞 L1 插入在正常组织中不存在，以及 3）在某些条件下，体细胞 L1 逆转录转座表现出在非整倍体细胞中发生的倾向。17% 的插入也存在于正常细胞中，类似于 GI 肿瘤患者正常组织的基因组 DNA 中的发现。我们提供的证据表明：1）同一类型肿瘤中 L1 插入的数量是高度可变的，2）GI 癌组织中的大多数体细胞 L1 插入在正常组织中不存在，以及 3）在某些条件下，体细胞 L1 逆转录转座表现出在非整倍体细胞中发生的倾向。