Background Urinary tract infections (UTIs) are the most common bacterial infections and are often caused by uropathogenic Escherichia coli (UPEC). We investigated the distribution of phylogenetic groups, adhesin genes, antimicrobial resistance, and biofilm formation in E. coli isolated from patients with UTIs. Methods In the present study, 208 UPEC isolated from Thai patients were classified into phylogenetic groups and adhesin genes were detected using multiplex PCR. Antimicrobial susceptibility testing was performed using agar disk diffusion. The Congo red agar method was used to determine the ability of the UPEC to form biofilm. Results The most prevalent UPEC strains in this study belonged to phylogenetic group B2 (58.7%), followed by group C (12.5%), group E (12.0%), and the other groups (16.8%). Among adhesin genes, the prevalence of fimH (91.8%) was highest, followed by pap (79.3%), sfa (12.0%), and afa (7.7%). The rates of resistance to fluoroquinolones, trimethoprim-sulfamethoxazole, and amoxicillin-clavulanate were 65%, 54.3%, and 36.5%, respectively. The presence of adhesin genes and antibiotic resistance were more frequent in groups B2 and C compared to the other groups. Of the 129 multidrug-resistant UPEC strains, 54% were biofilm producers. Our findings further indicated that biofilm production was significantly correlated with the pap adhesin gene (p ≤ 0.05). Conclusion These findings provide molecular epidemiologic data, antibiotic resistance profiles, and the potential for biofilm formation among UPEC strains that can inform further development of the appropriate prevention and control strategies for UTIs in this region.

中文翻译：

---

泰国住院患者尿路致病性大肠杆菌的系统发育群分布、粘附素基因、生物膜形成和抗菌素耐药性

背景 尿路感染 (UTI) 是最常见的细菌感染，通常由尿路致病性大肠杆菌 (UPEC) 引起。我们调查了从尿路感染患者中分离出的大肠杆菌中系统发育组、粘附素基因、抗菌素耐药性和生物膜形成的分布。方法在本研究中，从泰国患者中分离出的208个UPEC被分类为系统发育组，并使用多重PCR检测粘附素基因。使用琼脂盘扩散进行抗菌药敏试验。刚果红琼脂法用于确定 UPEC 形成生物膜的能力。结果本研究中最多见的UPEC菌株属于系统发育组B2（58.7%），其次是C组（12.5%）、E组（12.0%）和其他组（16.8%）。在粘附素基因中，fimH（91.8%）的患病率最高，其次是pap（79.3%）、sfa（12.0%）和afa（7.7%）。对氟喹诺酮类、甲氧苄啶-磺胺甲恶唑和阿莫西林-克拉维酸的耐药率分别为65%、54.3%和36.5%。与其他组相比，B2 组和 C 组中粘附素基因和抗生素耐药性的存在更频繁。在 129 种耐多药 UPEC 菌株中，54% 是生物膜生产者。我们的研究结果进一步表明，生物膜的产生与 pap 粘附素基因显着相关（p ≤ 0.05）。结论 这些发现提供了分子流行病学数据、抗生素耐药性概况以及 UPEC 菌株之间形成生物膜的潜力，可以为进一步制定该地区尿路感染的适当预防和控制策略提供信息。其次是pap（79.3%）、sfa（12.0%）和afa（7.7%）。对氟喹诺酮类、甲氧苄啶-磺胺甲恶唑和阿莫西林-克拉维酸的耐药率分别为65%、54.3%和36.5%。与其他组相比，B2 组和 C 组中粘附素基因和抗生素耐药性的存在更频繁。在 129 种耐多药 UPEC 菌株中，54% 是生物膜生产者。我们的研究结果进一步表明，生物膜的产生与 pap 粘附素基因显着相关（p ≤ 0.05）。结论 这些发现提供了分子流行病学数据、抗生素耐药性概况以及 UPEC 菌株之间形成生物膜的潜力，可以为进一步制定该地区尿路感染的适当预防和控制策略提供信息。其次是pap（79.3%）、sfa（12.0%）和afa（7.7%）。对氟喹诺酮类、甲氧苄啶-磺胺甲恶唑和阿莫西林-克拉维酸的耐药率分别为65%、54.3%和36.5%。与其他组相比，B2 组和 C 组中粘附素基因和抗生素耐药性的存在更频繁。在 129 种耐多药 UPEC 菌株中，54% 是生物膜生产者。我们的研究结果进一步表明，生物膜的产生与 pap 粘附素基因显着相关（p ≤ 0.05）。结论 这些发现提供了分子流行病学数据、抗生素耐药性概况以及 UPEC 菌株之间形成生物膜的潜力，可以为进一步制定该地区尿路感染的适当预防和控制策略提供信息。对氟喹诺酮类、甲氧苄啶-磺胺甲恶唑和阿莫西林-克拉维酸的耐药率分别为65%、54.3%和36.5%。与其他组相比，B2 组和 C 组中粘附素基因和抗生素耐药性的存在更频繁。在 129 种耐多药 UPEC 菌株中，54% 是生物膜生产者。我们的研究结果进一步表明，生物膜的产生与 pap 粘附素基因显着相关（p ≤ 0.05）。结论 这些发现提供了分子流行病学数据、抗生素耐药性概况以及 UPEC 菌株之间形成生物膜的潜力，可以为进一步制定该地区尿路感染的适当预防和控制策略提供信息。对氟喹诺酮类、甲氧苄啶-磺胺甲恶唑和阿莫西林-克拉维酸的耐药率分别为65%、54.3%和36.5%。与其他组相比，B2 组和 C 组中粘附素基因和抗生素耐药性的存在更频繁。在 129 种耐多药 UPEC 菌株中，54% 是生物膜生产者。我们的研究结果进一步表明，生物膜的产生与 pap 粘附素基因显着相关（p ≤ 0.05）。结论 这些发现提供了分子流行病学数据、抗生素耐药性概况以及 UPEC 菌株之间形成生物膜的潜力，可以为进一步制定该地区尿路感染的适当预防和控制策略提供信息。与其他组相比，B2 组和 C 组中粘附素基因和抗生素耐药性的存在更频繁。在 129 种耐多药 UPEC 菌株中，54% 是生物膜生产者。我们的研究结果进一步表明，生物膜的产生与 pap 粘附素基因显着相关（p ≤ 0.05）。结论 这些发现提供了分子流行病学数据、抗生素耐药性概况以及 UPEC 菌株之间形成生物膜的潜力，可以为进一步制定该地区尿路感染的适当预防和控制策略提供信息。与其他组相比，B2 组和 C 组中粘附素基因和抗生素耐药性的存在更频繁。在 129 种耐多药 UPEC 菌株中，54% 是生物膜生产者。我们的研究结果进一步表明，生物膜的产生与 pap 粘附素基因显着相关（p ≤ 0.05）。结论 这些发现提供了分子流行病学数据、抗生素耐药性概况以及 UPEC 菌株之间形成生物膜的潜力，可以为进一步制定该地区尿路感染的适当预防和控制策略提供信息。我们的研究结果进一步表明，生物膜的产生与 pap 粘附素基因显着相关（p ≤ 0.05）。结论 这些发现提供了分子流行病学数据、抗生素耐药性概况以及 UPEC 菌株之间形成生物膜的潜力，可以为进一步制定该地区尿路感染的适当预防和控制策略提供信息。我们的研究结果进一步表明，生物膜的产生与 pap 粘附素基因显着相关（p ≤ 0.05）。结论 这些发现提供了分子流行病学数据、抗生素耐药性概况以及 UPEC 菌株之间形成生物膜的潜力，可以为进一步制定该地区尿路感染的适当预防和控制策略提供信息。