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Host transcriptional response to TB preventive therapy differentiates two sub-groups of IGRA-positive individuals
Tuberculosis ( IF 3.2 ) Pub Date : 2021-03-01 , DOI: 10.1016/j.tube.2020.102033
Claire Broderick 1 , Jacqueline M Cliff 2 , Ji-Sook Lee 2 , Myrsini Kaforou 3 , David Aj Moore 4
Affiliation  

Abstract We hypothesised that individuals with immunological sensitisation to Mycobacterium tuberculosis (Mtb), conventionally regarded as evidence of latent tuberculosis infection (LTBI), would demonstrate binary responses to preventive therapy (PT), reflecting the differential immunological consequences of the sterilisation of viable infection in those with active Mtb infection versus no Mtb killing in those who did not harbour viable bacilli. We investigated longitudinal whole blood transcriptional profile responses to PT of Interferon gamma release assay (IGRA)-positive tuberculosis contacts and IGRA-negative, tuberculosis-unexposed controls. Longitudinal unsupervised clustering analysis with a subset of 474 most variable genes in antigen-stimulated blood separated the IGRA-positive participants into two distinct subgroups, one of which clustered with the IGRA-negative controls. 117 probes were differentially expressed over time between the two cluster groups, many of them associated with immunological pathways important in mycobacterial control. We contend that the differential host RNA response reflects lack of Mtb viability in the group that clustered with the IGRA-negative unexposed controls, and Mtb viability in the group (1/3 of IGRA-positives) that clustered away. Gene expression patterns in the blood of IGRA-positive individuals emerging during the course of PT, which reflect Mtb viability, could have major implications in the identification of risk of progression, treatment stratification and biomarker development.

中文翻译:

宿主对结核病预防性治疗的转录反应区分了 IGRA 阳性个体的两个亚组

摘要我们假设对结核分枝杆菌 (Mtb) 具有免疫敏感性的个体,通常被认为是潜伏性结核感染 (LTBI) 的证据,将表现出对预防性治疗 (PT) 的二元反应,这反映了在那些有活跃 Mtb 感染的人与那些没有存活的杆菌的人没有 Mtb 杀死。我们调查了对干扰素 γ 释放测定 (IGRA) 阳性结核病接触者和 IGRA 阴性、未暴露于结核病的对照的 PT 的纵向全血转录谱反应。对抗原刺激血液中 474 个最可变基因的子集进行纵向无监督聚类分析,将 IGRA 阳性参与者分为两个不同的亚组,其中一个与 IGRA 阴性对照聚集在一起。随着时间的推移,两个簇组之间有 117 个探针出现差异表达,其中许多与分枝杆菌控制中重要的免疫途径相关。我们认为,差异宿主 RNA 反应反映了与 IGRA 阴性未暴露对照聚集的组中缺乏 Mtb 活力,以及聚集在一起的组(IGRA 阳性的 1/3)中的 Mtb 活力。在 PT 过程中出现的 IGRA 阳性个体血液中的基因表达模式反映了 Mtb 的生存能力,可能对确定进展风险、治疗分层和生物标志物的发展产生重大影响。其中许多与分枝杆菌控制中重要的免疫途径有关。我们认为,差异宿主 RNA 反应反映了与 IGRA 阴性未暴露对照聚集的组中缺乏 Mtb 活力,以及聚集在一起的组(IGRA 阳性的 1/3)中的 Mtb 活力。在 PT 过程中出现的 IGRA 阳性个体血液中的基因表达模式反映了 Mtb 的生存能力,可能对确定进展风险、治疗分层和生物标志物的发展产生重大影响。其中许多与分枝杆菌控制中重要的免疫途径有关。我们认为,差异宿主 RNA 反应反映了与 IGRA 阴性未暴露对照聚集的组中缺乏 Mtb 活力,以及聚集在一起的组(IGRA 阳性的 1/3)中的 Mtb 活力。在 PT 过程中出现的 IGRA 阳性个体血液中的基因表达模式反映了 Mtb 的生存能力,可能对确定进展风险、治疗分层和生物标志物的发展产生重大影响。和集群中的 Mtb 生存能力(IGRA 阳性的 1/3)。在 PT 过程中出现的 IGRA 阳性个体血液中的基因表达模式反映了 Mtb 的生存能力,可能对确定进展风险、治疗分层和生物标志物的发展产生重大影响。和集群中的 Mtb 生存能力(IGRA 阳性的 1/3)。在 PT 过程中出现的 IGRA 阳性个体血液中的基因表达模式反映了 Mtb 的生存能力,可能对确定进展风险、治疗分层和生物标志物的发展产生重大影响。
更新日期:2021-03-01
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