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Development and validation of a UHPLC-ESI-QTOF mass spectrometry method to analyze opines, plant biomarkers of crown gall or hairy root diseases
Journal of Chromatography B ( IF 2.8 ) Pub Date : 2020-11-26 , DOI: 10.1016/j.jchromb.2020.122458
Rosa Padilla , Vincent Gaillard , Thao Nhi Le , Floriant Bellvert , David Chapulliot , Xavier Nesme , Yves Dessaux , Ludovic Vial , Céline Lavire , Isabelle Kerzaon

Opines are low-molecular-weight metabolites specifically biosynthesized by agrobacteria-transformed plant cells when plants are struck by crown gall and hairy root diseases, which cause uncontrolled tissue overgrowth. Transferred DNA is sustainably incorporated into the genomes of the transformed plant cells, so that opines constitute a persistent biomarker of plant infection by pathogenic agrobacteria and can be targeted for crown gall/hairy root disease diagnosis. We developed a general, rapid, specific and sensitive analytical method for overall opine detection using ultra-high-performance liquid chromatography-electrospray ionization quadrupole time-of-flight mass spectrometry (UHPLC-ESI-MS-QTOF), with easy preparation of samples. Based on MS, MS/MS and chromatography data, the detection selectivity of a wide range of standard opines was validated in pure solution and in different plant extracts. The method was successfully used to detect different structural types of opines, including opines for which standard compounds are unavailable, in tumors or hairy roots induced by pathogenic strains. As the method can detect a wide range of opines in a single run, it represents a powerful tool for plant gall analysis and crown gall/hairy root disease diagnosis. Using an appropriate dilution of plant extract and a matrix-based calibration curve, the quantification ability of the method was validated for three opines belonging to different families (nopaline, octopine, mannopine), which were accurately quantified in plant tissue extracts.



中文翻译:

UHPLC-ESI-QTOF质谱方法的开发和验证,用于分析冠op或毛状根病的阿片类,植物生物标志物

鸦片是低分子量代谢物,当植物受到冠,病和毛状根病侵害时,由农杆菌转化的植物细胞专门生物合成,这会导致组织过度生长。转移的DNA可持续地整合到转化的植物细胞的基因组中,因此阿片类药物构成了致病性农杆菌感染植物的持久性生物标志物,可以作为冠crown /毛根病诊断的靶标。我们使用超高效液相色谱-电喷雾电离四极杆飞行时间质谱(UHPLC-ESI-MS-QTOF)开发了一种用于总体鸦片检测的通用,快速,特异性和灵敏的分析方法,并且样品制备简单。根据MS,MS / MS和色谱数据,在纯溶液和不同植物提取物中验证了多种标准阿片类药物的检测选择性。该方法已成功用于检测由致病性菌株诱导的肿瘤或毛状根中不同结构类型的阿片类,包括无法使用标准化合物的阿片类。由于该方法可在一次运行中检测到广泛的阿片类药物,因此它是用于植物gall分析和冠gall /毛根病诊断的强大工具。使用适当的植物提取物稀释液和基于矩阵的校准曲线,该方法的定量能力针对属于不同家族(胭脂碱,章鱼碱,甘露醇)的三个阿片类药物进行了验证,并在植物组织提取物中进行了准确定量。该方法已成功用于检测由致病性菌株诱导的肿瘤或毛状根中不同结构类型的阿片类,包括无法使用标准化合物的阿片类。由于该方法可在一次运行中检测到广泛的阿片类药物,因此它是用于植物gall分析和冠gall /毛根病诊断的强大工具。使用适当的植物提取物稀释液和基于矩阵的校准曲线,该方法的定量能力针对属于不同家族(胭脂碱,章鱼碱,甘露醇)的三个阿片类药物进行了验证,并在植物组织提取物中进行了准确定量。该方法已成功用于检测由致病性菌株诱导的肿瘤或毛状根中不同结构类型的阿片类,包括无法使用标准化合物的阿片类。由于该方法可在一次运行中检测到广泛的阿片类药物,因此它是用于植物gall分析和冠gall /毛根病诊断的强大工具。使用适当的植物提取物稀释液和基于矩阵的校准曲线,该方法的定量能力针对属于不同家族(胭脂碱,章鱼碱,甘露醇)的三个阿片类药物进行了验证,并在植物组织提取物中进行了准确定量。由于该方法可在一次运行中检测到广泛的阿片类药物,因此它是用于植物gall分析和冠gall /毛根病诊断的强大工具。使用适当的植物提取物稀释液和基于矩阵的校准曲线,该方法的定量能力针对属于不同家族(胭脂碱,章鱼碱,甘露醇)的三个阿片类药物进行了验证,并在植物组织提取物中进行了准确定量。由于该方法可在一次运行中检测到广泛的阿片类药物,因此它是用于植物gall分析和冠gall /毛根病诊断的强大工具。使用适当的植物提取物稀释液和基于矩阵的校准曲线,该方法的定量能力针对属于不同家族(胭脂碱,章鱼碱,甘露醇)的三个阿片类药物进行了验证,并在植物组织提取物中进行了准确定量。

更新日期:2020-12-28
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