Among the proteins encoded by the SARS-CoV-2 RNA, nsP3 (non-structural Protein3) is the largest multi-domain protein. Its role is multifaceted and important for the viral life cycle. Nonetheless, regarding the specific role of each domain there are many aspects of their function that have to be investigated. SARS Unique Domains (SUDs), constitute the nsP3c region of the nsP3, and were observed for the first time in SARS-CoV. Two of them, namely SUD-N (the first SUD) and the SUD-M (sequential to SUD-N), exhibit structural homology with nsP3b (“X” or macro domain); indeed all of them are folded in a three-layer α/β/α sandwich. On the contrary, they do not exhibit functional similarities, like ADP-ribose binding properties and ADP-ribose hydrolase activity. There are reports that suggest that these two SUDs may exhibit a binding selectivity towards G-oligonucleotides, a feature which may contribute to the characterization of their role in the formation of the replication/transcription viral complex (RTC) and of the interaction of various viral “components” with the host cell. While the structures of these domains of SARS-CoV-2 have not been determined yet, SUDs interaction with oligonucleotides and/or RNA molecules may provide a platform for drug discovery. Here, we report the almost complete NMR backbone and side-chain resonance assignment (¹H,¹³C,¹⁵N) of SARS-CoV-2 SUD-N protein, and the NMR chemical shift-based prediction of the secondary structure elements. These data may be exploited for its 3D structure determination and the screening of chemical compounds libraries, which may alter SUD-N function.

在 SARS-CoV-2 RNA 编码的蛋白质中，nsP3（非结构蛋白 3）是最大的多域蛋白质。它的作用是多方面的，对病毒生命周期很重要。尽管如此，关于每个领域的具体作用，必须研究其功能的许多方面。SARS 独特结构域 (SUD) 构成 nsP3 的 nsP3c 区域，并首次在 SARS-CoV 中观察到。其中两个，即 SUD-N（第一个 SUD）和 SUD-M（与 SUD-N 序列），表现出与 nsP3b（“X”或宏域）的结构同源性；事实上，它们都被折叠成一个三层的 α/β/α 夹层。相反，它们没有表现出功能相似性，如 ADP-核糖结合特性和 ADP-核糖水解酶活性。有报告表明，这两种 SUD 可能对 G-寡核苷酸表现出结合选择性，这一特征可能有助于表征它们在形成复制/转录病毒复合物 (RTC) 和各种病毒相互作用中的作用。 “组件”与宿主细胞。虽然 SARS-CoV-2 的这些结构域的结构尚未确定，但 SUD 与寡核苷酸和/或 RNA 分子的相互作用可能为药物发现提供了一个平台。在这里，我们报告了几乎完整的 NMR 主链和侧链共振分配（虽然 SARS-CoV-2 的这些结构域的结构尚未确定，但 SUD 与寡核苷酸和/或 RNA 分子的相互作用可能为药物发现提供了一个平台。在这里，我们报告了几乎完整的 NMR 主链和侧链共振分配（虽然 SARS-CoV-2 的这些结构域的结构尚未确定，但 SUD 与寡核苷酸和/或 RNA 分子的相互作用可能为药物发现提供了一个平台。在这里，我们报告了几乎完整的 NMR 主链和侧链共振分配（¹ H, ¹³ C, ¹⁵ N) 的 SARS-CoV-2 SUD-N 蛋白，以及基于 NMR 化学位移的二级结构元素预测。这些数据可用于其 3D 结构确定和化学化合物库的筛选，这可能会改变 SUD-N 功能。