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Myxovirus resistance 1 (Mx1) gene: Molecular characterization of complete coding sequence and expression profile in the endometrium of goat (Capra hircus)
Journal of Reproductive Immunology ( IF 3.4 ) Pub Date : 2020-11-18 , DOI: 10.1016/j.jri.2020.103247
Asit Jain 1 , Tripti Jain 2 , Khushboo Chandrakar 3 , Mohan Singh 1 , Sanjay Shakya 1
Affiliation  

Myxovirus resistance 1 (Mx1) gene plays an important role in uterine receptivity and conceptus development by creating a strong defense mechanism in the uterine environment. However, the specific role of Mx1 gene is not yet documented in the goat. Therefore, in the present study, full-length coding sequence (CDS) of the Mx1 gene was amplified, sequenced and characterized through various Bioinformatic tools. Temporal expression profile of Mx1 mRNA and protein was also examined by quantitative real-time PCR (qPCR) and western blot, respectively, in the endometrium of cyclic stage (non-pregnant), pregnancy stage I (16–24 days of gestation) and pregnancy stage II (25–40 days of gestation) of caprine (cp). A fragment of the cpMx1 gene, 2144 bp in length, was amplified from complementary DNA (cDNA) with a 1965 bp open reading frame. Coding and deduced amino acid sequences of the cpMx1 were aligned with other species and it exhibited 98.8–81.5 % identities with different species. On phylogenetic analysis, sheep and goat were found belonging to the same clade but differing from large ruminants. The cpMx1 protein possess the conserved signature motif (LPRGTGIVTR) of dynamin superfamily and the tripartite guanosine-5′-triphosphate (GTP) binding motif (GDQSSGKS, DLPG, TKPD) at the N-terminal end, and the leucine zipper motifs at the C-terminal end. Both cpMx1 mRNA and protein were found to be expressed maximally (P < 0.05) in the pregnancy stage I as compared to cyclic stage. It was concluded that the cpMx1 gene shares major structural and probably functional similarities with other species.



中文翻译:

粘病毒抗性 1 (Mx1) 基因:山羊子宫内膜中完整编码序列和表达谱的分子表征(Capra hircus)

粘病毒抗性 1 (Mx1) 基因通过在子宫环境中建立强大的防御机制,在子宫容受性和孕体发育中发挥重要作用。然而,尚未在山羊中记录 Mx1 基因的具体作用。因此,在本研究中,通过各种生物信息学工具对 Mx1 基因的全长编码序列 (CDS) 进行了扩增、测序和表征。Mx1 mRNA 和蛋白质的时间表达谱也分别通过实时定量 PCR (qPCR) 和蛋白质印迹在循环阶段(非妊娠)、妊娠阶段 I(妊娠 16-24 天)和山羊 (cp) 的妊娠 II 期(妊娠 25-40 天)。cpMx1 基因的一个片段,长度为 2144 bp,是从具有 1965 bp 开放阅读框的互补 DNA (cDNA) 中扩增出来的。cpMx1 的编码和推导的氨基酸序列与其他物种比对,它与不同物种具有 98.8-81.5% 的同一性。在系统发育分析中,发现绵羊和山羊属于同一进化枝,但与大型反刍动物不同。cpMx1 蛋白在 N 端具有动力蛋白超家族的保守特征基序 (LPRGTGIVTR) 和三方鸟苷-5'-三磷酸 (GTP) 结合基序(GDQSSGKS、DLPG、TKPD),以及 C 端的亮氨酸拉链基序-终端。与循环阶段相比,发现 cpMx1 mRNA 和蛋白质在妊娠阶段 I 中表达最大(P < 0.05)。结论是 cpMx1 基因与其他物种具有主要的结构和可能的功能相似性。8–81.5 % 与不同物种的同一性。在系统发育分析中,发现绵羊和山羊属于同一进化枝,但与大型反刍动物不同。cpMx1 蛋白在 N 端具有动力蛋白超家族的保守特征基序 (LPRGTGIVTR) 和三方鸟苷-5'-三磷酸 (GTP) 结合基序(GDQSSGKS、DLPG、TKPD),以及 C 端的亮氨酸拉链基序-终端。与循环阶段相比,发现 cpMx1 mRNA 和蛋白质在妊娠阶段 I 中表达最大(P < 0.05)。结论是 cpMx1 基因与其他物种具有主要的结构和可能的功能相似性。8–81.5 % 与不同物种的同一性。在系统发育分析中,绵羊和山羊属于同一进化枝,但与大型反刍动物不同。cpMx1 蛋白在 N 端具有动力蛋白超家族的保守特征基序 (LPRGTGIVTR) 和三方鸟苷-5'-三磷酸 (GTP) 结合基序(GDQSSGKS、DLPG、TKPD),以及 C 端的亮氨酸拉链基序-终端。与循环阶段相比,发现 cpMx1 mRNA 和蛋白质在妊娠阶段 I 中表达最大(P < 0.05)。结论是 cpMx1 基因与其他物种具有主要的结构和可能的功能相似性。cpMx1 蛋白在 N 端具有动力蛋白超家族的保守特征基序 (LPRGTGIVTR) 和三方鸟苷-5'-三磷酸 (GTP) 结合基序(GDQSSGKS、DLPG、TKPD),以及 C 端的亮氨酸拉链基序-终端。与循环阶段相比,发现 cpMx1 mRNA 和蛋白质在妊娠阶段 I 中表达最大(P < 0.05)。结论是 cpMx1 基因与其他物种具有主要的结构和可能的功能相似性。cpMx1 蛋白在 N 端具有动力蛋白超家族的保守特征基序 (LPRGTGIVTR) 和三方鸟苷-5'-三磷酸 (GTP) 结合基序(GDQSSGKS、DLPG、TKPD),以及 C 端的亮氨酸拉链基序-终端。与循环阶段相比,发现 cpMx1 mRNA 和蛋白质在妊娠阶段 I 中表达最大(P < 0.05)。结论是 cpMx1 基因与其他物种具有主要的结构和可能的功能相似性。

更新日期:2020-12-01
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