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Transitions in microbial communities along two sediment cores collected from the landward walls of the New Britain trench
Marine Biology ( IF 2.1 ) Pub Date : 2020-11-01 , DOI: 10.1007/s00227-020-03788-6
Li Wang , Rulong Liu , Xing Wei , Zixuan Wang , Ziyi Shen , Junwei Cao , Yuli Wei , Zhe Xie , Liangbiao Chen , Jiasong Fang

The landward wall of the New Britain Trench (NBT) is an active continental margin. Unlike passive margins, it lacks a continental rise and the abyssal plain, and has a steep continental slope ending in an oceanic trench. Although the trench systems are receiving more and more attentions, our understanding of the microbiology of the NBT and its trench walls is limited. In this study, we collected a 70 cm gravity core (4524 m depth) and a 30 cm box core (4130 m depth) from the western and eastern landward walls of the NBT, respectively. Diversity and composition of microbial communities were investigated at high resolution in 2 cm depth intervals. In two cores, obvious vertical transitions from the aerobic to anaerobic but distinct dominant anaerobic microbes were observed. In the eastern trench wall, anaerobic fermenters, such as Anaerolineales and Alphaproteobacteria, were dominant, but the western contained abundant Dehalococcoidia, and Gammaproteobacteria, such as Alteromonadales and Oceanospirillales. Combined with the results of higher bacteria abundance and probable shallower aerobic active zone in the eastern core, such patterns of species composition might be related with richer input of labile allochthonous terrestrial organic matter by mass wasting processes in the steeper eastern wall. Our analysis also revealed highly diversified Dehalococcoidia including some new phylotypes, extending the current understandings on Dehalococcoidia diversity. This study fills the gap of benthic microbial study in the NBT, and highlights the need of multi-point sampling in trench studies for the great geographical variations along the trench wall.

中文翻译:

沿从新不列颠海沟向陆壁收集的两个沉积岩芯的微生物群落转变

新不列颠海沟 (NBT) 的向陆墙是一个活跃的大陆边缘。与被动边缘不同,它没有大陆隆起和深海平原,有一个陡峭的大陆坡,终止于海沟。尽管沟渠系统受到越来越多的关注,但我们对 NBT 及其沟壁微生物学的了解是有限的。在这项研究中,我们分别从 NBT 的西部和东部向陆壁收集了一个 70 cm 的重力岩心(4524 m 深)和一个 30 cm 的箱形岩心(4130 m 深)。微生物群落的多样性和组成以 2 厘米深度间隔的高分辨率进行了研究。在两个核心中,观察到从好氧到厌氧的明显垂直转变,但观察到明显的优势厌氧微生物。在东沟壁,厌氧发酵罐,Anaerolineales 和 Alphaproteobacteria 等占优势,但西部含有丰富的 Dehalococcocoidia 和 Gammaproteobacteria,例如交替单胞菌目和海洋螺旋菌目。结合东部核心较高的细菌丰度和可能较浅的有氧活动带的结果,这种物种组成模式可能与较陡峭的东部墙壁中通过质量浪费过程输入的不稳定的外来陆地有机物更丰富有关。我们的分析还揭示了高度多样化的 Dehalococcocoidia,包括一些新的系统发育型,扩展了目前对 Dehalococcocoidia 多样性的理解。这项研究填补了NBT底栖微生物研究的空白,并强调了在沟渠研究中多点采样的必要性,以应对沿沟壁的巨大地理变化。占主导地位,但西部含有丰富的脱盐球虫和 Gammaproteobacteria,如交替单胞菌目和海洋螺旋菌目。结合东部核心较高的细菌丰度和可能较浅的有氧活动带的结果,这种物种组成模式可能与较陡峭的东部墙壁中通过质量浪费过程输入的不稳定的外来陆地有机物更丰富有关。我们的分析还揭示了高度多样化的 Dehalococcocoidia,包括一些新的系统发育型,扩展了目前对 Dehalococcocoidia 多样性的理解。这项研究填补了NBT底栖微生物研究的空白,并强调了在沟渠研究中多点采样的必要性,以应对沿沟壁的巨大地理变化。占主导地位,但西部含有丰富的脱盐球虫和 Gammaproteobacteria,如交替单胞菌目和海洋螺旋菌目。结合东部核心较高的细菌丰度和可能较浅的有氧活动带的结果,这种物种组成模式可能与较陡峭的东部墙壁中通过质量浪费过程输入的不稳定的外来陆地有机物更丰富有关。我们的分析还揭示了高度多样化的 Dehalococcocoidia,包括一些新的系统发育型,扩展了目前对 Dehalococcocoidia 多样性的理解。这项研究填补了NBT底栖微生物研究的空白,并强调了在沟渠研究中多点采样的必要性,以应对沿沟壁的巨大地理变化。和 Gammaproteobacteria,如交替单胞菌目和海洋螺旋菌目。结合东部核心较高的细菌丰度和可能较浅的有氧活动带的结果,这种物种组成模式可能与较陡峭的东部墙壁中通过质量浪费过程输入的不稳定的外来陆地有机物更丰富有关。我们的分析还揭示了高度多样化的 Dehalococcocoidia,包括一些新的系统发育型,扩展了目前对 Dehalococcocoidia 多样性的理解。这项研究填补了NBT底栖微生物研究的空白,并强调了在沟渠研究中多点采样的必要性,以应对沿沟壁的巨大地理变化。和 Gammaproteobacteria,如交替单胞菌目和海洋螺旋菌目。结合东部核心较高的细菌丰度和可能较浅的有氧活动带的结果,这种物种组成模式可能与较陡峭的东部墙壁中通过质量浪费过程输入的不稳定的外来陆地有机物更丰富有关。我们的分析还揭示了高度多样化的 Dehalococcocoidia,包括一些新的系统发育型,扩展了目前对 Dehalococcocoidia 多样性的理解。这项研究填补了NBT底栖微生物研究的空白,并强调了在沟渠研究中多点采样的必要性,以应对沿沟壁的巨大地理变化。结合东部核心较高的细菌丰度和可能较浅的有氧活动带的结果,这种物种组成模式可能与较陡峭的东部墙壁中通过质量浪费过程输入的不稳定的外来陆地有机物更丰富有关。我们的分析还揭示了高度多样化的 Dehalococcocoidia,包括一些新的系统发育型,扩展了目前对 Dehalococcocoidia 多样性的理解。这项研究填补了NBT底栖微生物研究的空白,并强调了在沟渠研究中多点采样的必要性,以应对沿沟壁的巨大地理变化。结合东部核心较高的细菌丰度和可能较浅的有氧活动带的结果,这种物种组成模式可能与较陡峭的东部墙壁中通过质量浪费过程输入的不稳定的外来陆地有机物更丰富有关。我们的分析还揭示了高度多样化的 Dehalococcocoidia,包括一些新的系统发育型,扩展了目前对 Dehalococcocoidia 多样性的理解。这项研究填补了NBT底栖微生物研究的空白,并强调了在沟渠研究中多点采样的必要性,以应对沿沟壁的巨大地理变化。物种组成的这种模式可能与更陡峭的东墙中大量消耗过程导致的不稳定的外来陆生有机物质的输入更丰富有关。我们的分析还揭示了高度多样化的 Dehalococcocoidia,包括一些新的系统发育型,扩展了目前对 Dehalococcocoidia 多样性的理解。这项研究填补了NBT底栖微生物研究的空白,并强调了在沟渠研究中多点采样的必要性,以应对沿沟壁的巨大地理变化。物种组成的这种模式可能与更陡峭的东墙中大量消耗过程导致的不稳定的外来陆生有机物质的输入更丰富有关。我们的分析还揭示了高度多样化的 Dehalococcocoidia,包括一些新的系统发育型,扩展了目前对 Dehalococcocoidia 多样性的理解。这项研究填补了NBT底栖微生物研究的空白,并强调了在沟渠研究中多点采样的必要性,以应对沿沟壁的巨大地理变化。
更新日期:2020-11-01
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