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Prevalence of mild citrus tristeza virus isolates of the T30 genotype in Cuban commercial citrus fields after the dissemination of huanglongbing
Crop Protection ( IF 2.5 ) Pub Date : 2021-02-01 , DOI: 10.1016/j.cropro.2020.105422
Yilian Llanes-Alvarez , Inés Peña-Bárzaga , Lochy Batista-Le Riverend , Ronal Pacheco , Victoria Zamora-Rodríguez , María José Benítez-Galeano , Fernando Rivas , Ana Bertalmío , Lester Hernández-Rodríguez

Abstract Huanglongbing (HLB) disease detection in Cuba in 2006 led to a turn in citrus management in the country, including the production of certified budwood in protected nurseries, eradication of symptomatic plants and old orchards, and chemical control of the vector Diaphorina citri. This dramatic shift in citrus farming could have affected the incidence and composition of citrus tristeza virus (CTV) populations. This work aimed to determine CTV incidence and characterize viral isolates from the main Cuban citrus-producing areas. A survey throughout the country was carried out which resulted in the collection of 27 CTV isolates. Results showed a decrease of CTV incidence in western and central areas of the country, but an increase in the East, compared to previous reports. Bioindexing showed that most of the isolates induced none or mild symptoms. Serological characterization using seven different CTV specific monoclonal antibodies (MAb) showed heterogeneity among the 27 isolates. Six out of twenty-seven were MCA13-reactive, a MAb associated to the presence of severe CTV isolates. Nevertheless, sequence comparison of the p20, p23 and p25 genes evidenced a high nucleotide sequence identity among isolates, and according to the phylogenetic analyses, all the sequences belonged to the CTV T30 genotype. Thus, our results showed a decrease in the CTV incidence in the surveyed areas and the broad dissemination of mild CTV isolates of the T30 genotype, which could be partially explained by the shift in the management programs implemented for CTV and HLB control in Cuba.

中文翻译:

黄龙病传播后古巴商业柑橘田T30基因型温和柑橘tristeza病毒分离株流行情况

摘要 2006 年古巴的黄龙病 (HLB) 病害检测导致该国柑橘管理发生转变,包括在受保护的苗圃中生产经过认证的芽木,根除有症状的植物和老果园,以及对媒介柑橘黄腐病进行化学控制。柑橘种植业的这种巨大转变可能影响了柑橘特里斯特萨病毒 (CTV) 种群的发生率和组成。这项工作旨在确定 CTV 发病率并表征来自古巴主要柑橘产区的病毒分离株。在全国范围内进行了一项调查,收集到了 27 个 CTV 分离株。结果显示,与之前的报告相比,该国西部和中部地区的 CTV 发病率有所下降,但东部地区有所增加。生物指数显示,大多数分离株不会引起症状或引起轻微症状。使用七种不同的 CTV 特异性单克隆抗体 (MAb) 进行的血清学表征显示 27 种分离株之间存在异质性。二十七人中有六人是 MCA13 反应性的,这是一种与严重 CTV 分离株的存在相关的单克隆抗体。尽管如此,p20、p23 和 p25 基因的序列比较证明了分离株之间的高核苷酸序列同一性,并且根据系统发育分析,所有序列都属于 CTV T30 基因型。因此,我们的结果显示调查区域的 CTV 发病率下降,T30 基因型的轻度 CTV 分离株的广泛传播,这可以部分解释为古巴 CTV 和 HLB 控制实施管理计划的转变。使用七种不同的 CTV 特异性单克隆抗体 (MAb) 进行的血清学表征显示 27 种分离株之间存在异质性。二十七人中有六人是 MCA13 反应性的,这是一种与严重 CTV 分离株的存在相关的单克隆抗体。尽管如此,p20、p23 和 p25 基因的序列比较证明了分离株之间的高核苷酸序列同一性,并且根据系统发育分析,所有序列都属于 CTV T30 基因型。因此,我们的结果显示调查区域的 CTV 发病率下降,T30 基因型的轻度 CTV 分离株的广泛传播,这可以部分解释为古巴 CTV 和 HLB 控制实施管理计划的转变。使用七种不同的 CTV 特异性单克隆抗体 (MAb) 进行的血清学表征显示 27 种分离株之间存在异质性。二十七人中有六人是 MCA13 反应性的,这是一种与严重 CTV 分离株的存在相关的单克隆抗体。尽管如此,p20、p23 和 p25 基因的序列比较证明了分离株之间的高核苷酸序列同一性,并且根据系统发育分析,所有序列都属于 CTV T30 基因型。因此,我们的结果显示调查区域的 CTV 发病率下降,T30 基因型的轻度 CTV 分离株的广泛传播,这可以部分解释为古巴 CTV 和 HLB 控制实施管理计划的转变。与严重 CTV 分离株相关的 MAb。尽管如此,p20、p23 和 p25 基因的序列比较证明了分离株之间的高核苷酸序列同一性,并且根据系统发育分析,所有序列都属于 CTV T30 基因型。因此,我们的结果显示调查区域的 CTV 发病率下降,T30 基因型的轻度 CTV 分离株的广泛传播,这可以部分解释为古巴 CTV 和 HLB 控制实施管理计划的转变。与严重 CTV 分离株相关的 MAb。尽管如此,p20、p23 和 p25 基因的序列比较证明了分离株之间的高核苷酸序列同一性,并且根据系统发育分析,所有序列都属于 CTV T30 基因型。因此,我们的结果显示调查区域的 CTV 发病率下降,T30 基因型的轻度 CTV 分离株的广泛传播,这可以部分解释为古巴 CTV 和 HLB 控制实施管理计划的转变。
更新日期:2021-02-01
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