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Characterisation of the Salt Overly Sensitive ( SOS ) pathway genes in Sugarcane under salinity stress
Physiologia Plantarum ( IF 6.4 ) Pub Date : 2020-11-02 , DOI: 10.1111/ppl.13245
Chinnasamy Brindha 1 , Srinivasavedantham Vasantha 1 , Arun K. Raja 1 , Arjun S. Tayade 1
Affiliation  

The Salt Overly Sensitive (SOS) pathway is a crucial ion homeostasis process in crop plants trafficking excess Na+ ions for elimination/sequestration. The SOS pathway genes SOS1 (Na+ /H+ antiporter), SOS2 (CIPK), and SOS3 (CBL) associated with ion homeostasis were isolated and characterised in the sugarcane clone Co 85019. The isolated genes had a coding region of 1086, 904 and 636 bp, respectively. A nucleotide blast analysis of the isolated SOS gene sequences showed strong similarity with previous genes found to be involved in the active functioning of the SOS pathway for ion homeostasis conferring salinity tolerance in sugarcane. The analysis of tissue specific gene expression of the identified SOS genes revealed a significant linear increase in the leaves under the first 96 h of salt stress (2.5- to 21.6- fold) in the tolerant genotype Co 85019, while the expression in the roots showed a linear increase up to 48 h and thereafter a gradual decline. The expression of SOS genes in the susceptible genotype (Co 97010) was significantly lower than in the tolerant genotype. Tissue ion content analysis also revealed a differential accumulation of Na+ and K+ ions in the contrasting sugarcane genotypes (Co 85019 and Co 97010) and this corroborates the varied expressions of SOS genes between the tolerant and susceptible varieties under salinity. Genome-wide analysis of identified SOS family genes showed the homologs in Saccharum complex members, Sorghum bicolor and Zea mays and this verify a close genetic similarity among these genera. This article is protected by copyright. All rights reserved.

中文翻译:

盐胁迫下甘蔗盐分过度敏感(SOS)通路基因的表征

盐过度敏感 (SOS) 途径是作物植物运输过量 Na+ 离子以消除/隔离的关键离子稳态过程。在甘蔗克隆 Co 85019 中分离并表征了与离子稳态相关的 SOS 通路基因 SOS1(Na+ /H+ 逆向转运蛋白)、SOS2(CIPK)和 SOS3(CBL)。分离的基因的编码区为 1086、904 和 636 bp,分别。对分离的 SOS 基因序列的核苷酸爆炸分析表明,与先前发现的基因具有很强的相似性,这些基因与 SOS 途径的活性功能有关,用于离子稳态,赋予甘蔗耐盐性。对鉴定的 SOS 基因的组织特异性基因表达的分析显示,在盐胁迫的前 96 小时(2.5 到 21. 6 倍)在耐受基因型 Co 85019 中,而根中的表达显示线性增加至 48 小时,然后逐渐下降。SOS 基因在易感基因型 (Co 97010) 中的表达显着低于耐受基因型。组织离子含量分析还揭示了对比甘蔗基因型(Co 85019 和 Co 97010)中 Na+ 和 K+ 离子的差异积累,这证实了盐度下耐受和易感品种之间 SOS 基因的不同表达。已鉴定的 SOS 家族基因的全基因组分析显示,在 Saccharum 复合体成员、双色高粱和玉米中存在同源性,这证实了这些属之间的密切遗传相似性。本文受版权保护。版权所有。而在根中的表达在 48 小时内呈线性增加,然后逐渐下降。SOS 基因在易感基因型 (Co 97010) 中的表达显着低于耐受基因型。组织离子含量分析还揭示了对比甘蔗基因型(Co 85019 和 Co 97010)中 Na+ 和 K+ 离子的差异积累,这证实了盐度下耐受和易感品种之间 SOS 基因的不同表达。对已鉴定的 SOS 家族基因的全基因组分析显示,在 Saccharum 复合体成员、双色高粱和玉米中存在同源性,这证实了这些属之间的密切遗传相似性。本文受版权保护。版权所有。而在根中的表达在 48 小时内呈线性增加,然后逐渐下降。SOS 基因在易感基因型 (Co 97010) 中的表达显着低于耐受基因型。组织离子含量分析还揭示了对比甘蔗基因型(Co 85019 和 Co 97010)中 Na+ 和 K+ 离子的差异积累,这证实了盐度下耐受和易感品种之间 SOS 基因的不同表达。对已鉴定的 SOS 家族基因的全基因组分析显示,在 Saccharum 复合体成员、双色高粱和玉米中存在同源性,这证实了这些属之间的密切遗传相似性。本文受版权保护。版权所有。SOS 基因在易感基因型 (Co 97010) 中的表达显着低于耐受基因型。组织离子含量分析还揭示了对比甘蔗基因型(Co 85019 和 Co 97010)中 Na+ 和 K+ 离子的差异积累,这证实了盐度下耐受和易感品种之间 SOS 基因的不同表达。对已鉴定的 SOS 家族基因的全基因组分析显示,在 Saccharum 复合体成员、双色高粱和玉米中存在同源性,这证实了这些属之间的密切遗传相似性。本文受版权保护。版权所有。SOS 基因在易感基因型 (Co 97010) 中的表达显着低于耐受基因型。组织离子含量分析还揭示了对比甘蔗基因型(Co 85019 和 Co 97010)中 Na+ 和 K+ 离子的差异积累,这证实了盐度下耐受和易感品种之间 SOS 基因的不同表达。对已鉴定的 SOS 家族基因的全基因组分析显示,在 Saccharum 复合体成员、双色高粱和玉米中存在同源性,这证实了这些属之间的密切遗传相似性。本文受版权保护。版权所有。组织离子含量分析还揭示了对比甘蔗基因型(Co 85019 和 Co 97010)中 Na+ 和 K+ 离子的差异积累,这证实了盐度下耐受和易感品种之间 SOS 基因的不同表达。对已鉴定的 SOS 家族基因的全基因组分析显示,在 Saccharum 复合体成员、双色高粱和玉米中存在同源性,这证实了这些属之间的密切遗传相似性。本文受版权保护。版权所有。组织离子含量分析还揭示了对比甘蔗基因型(Co 85019 和 Co 97010)中 Na+ 和 K+ 离子的差异积累,这证实了盐度下耐受和易感品种之间 SOS 基因的不同表达。对已鉴定的 SOS 家族基因的全基因组分析显示,在 Saccharum 复合体成员、双色高粱和玉米中存在同源性,这证实了这些属之间的密切遗传相似性。本文受版权保护。版权所有。本文受版权保护。版权所有。本文受版权保护。版权所有。
更新日期:2020-11-02
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