Previously, five putative quantitative trait loci (QTLs) for low-temperature germination (LTG) have been detected using 96 BC3F8 lines derived from an interspecific cross between the Korean japonica cultivar “Hwaseong” and Oryza rufipogon. In the present study, two introgression lines, CR1517 and CR1518, were used as parents to detect additional QTLs and analyze interactions among QTLs for LTG. The F2 population (154 plants) along with parental lines, Hwaseong and O. rufipogon, were evaluated for LTG and coleoptile length under low-temperature conditions (13 °C). Among five QTLs for LTG, two major QTLs, qLTG1 and qLTG3, were consistently detected at 6 and 7 days after incubation. Three minor QTLs were detected on chromosomes 8 and 10. Two QTLs, qLTG10.1 and qLTG10.2, showing linkage on chromosome 10, exerted opposite effects with the Hwaseong allele at qLTG10.2 and the O. rufipogon allele at qLTG10.1 respectively, in turn, increasing LTG. Interactions among QTLs were not significant, implying that the QTLs act in an additive manner. Near-isogenic line plants with the combination of favorable alleles from O. rufipogon and Hwaseong exhibited higher LTG than two introgression lines. With regard to coleoptile length, three QTLs observed on chromosomes 1, 3, and 8 were colocalized with QTLs for LTG, suggesting the pleiotropy of the single gene at each locus. According to the results, the introgression of favorable O. rufipogon alleles could hasten the development of rice with high LTG and high coleoptile elongation in japonica cultivars.

中文翻译：

---

低温条件下使用源自水稻种间杂交的基因渗入系表征发芽和胚芽鞘长度的数量性状位点

以前，已经使用源自韩国粳稻品种“华城”和 Oryza rufipogon 的种间杂交的 96 个 BC3F8 品系检测到了 5 个用于低温萌发 (LTG) 的推定数量性状基因座 (QTL)。在本研究中，两个基因渗入系 CR1517 和 CR1518 被用作亲本来检测额外的 QTL 并分析 LTG 的 QTL 之间的相互作用。F2 种群（154 株植物）以及亲本 Hwaseong 和 O. rufipogon 在低温条件下（13°C）评估 LTG 和胚芽鞘长度。在 LTG 的五个 QTL 中，两个主要的 QTL，qLTG1 和 qLTG3，在孵育后 6 天和 7 天始终检测到。在 8 号和 10 号染色体上检测到 3 个次要 QTL。 2 个 QTL，qLTG10.1 和 qLTG10.2，在 10 号染色体上显示连锁，分别与 qLTG10.2 的 Hwaseong 等位基因和 qLTG10.1 的 O. rufipogon 等位基因产生相反的作用，进而增加 LTG。QTLs之间的相互作用不显着，暗示QTLs以加性方式起作用。具有来自 O. rufipogon 和 Hwaseong 的有利等位基因组合的近等基因系植物表现出比两个基因渗入系更高的 LTG。关于胚芽鞘长度，在染色体 1、3 和 8 上观察到的三个 QTL 与 LTG 的 QTL 共定位，表明单个基因在每个位点的多效性。结果表明，有利的O. rufipogon等位基因的渗入可以加速粳稻品种的高LTG和高胚芽鞘伸长率水稻的发育。QTLs之间的相互作用不显着，暗示QTLs以加性方式起作用。具有来自 O. rufipogon 和 Hwaseong 的有利等位基因组合的近等基因系植物表现出比两个基因渗入系更高的 LTG。关于胚芽鞘长度，在染色体 1、3 和 8 上观察到的三个 QTL 与 LTG 的 QTL 共定位，表明单个基因在每个位点的多效性。结果表明，有利的O. rufipogon等位基因的渗入可以加速粳稻品种的高LTG和高胚芽鞘伸长率水稻的发育。QTLs之间的相互作用不显着，暗示QTLs以加性方式起作用。具有来自 O. rufipogon 和 Hwaseong 的有利等位基因组合的近等基因系植物表现出比两个基因渗入系更高的 LTG。关于胚芽鞘长度，在染色体 1、3 和 8 上观察到的三个 QTL 与 LTG 的 QTL 共定位，表明单个基因在每个位点的多效性。结果表明，有利的O. rufipogon等位基因的渗入可以加速粳稻品种的高LTG和高胚芽鞘伸长率水稻的发育。关于胚芽鞘长度，在染色体 1、3 和 8 上观察到的三个 QTL 与 LTG 的 QTL 共定位，表明单个基因在每个位点的多效性。结果表明，有利的O. rufipogon等位基因的渗入可以加速粳稻品种的高LTG和高胚芽鞘伸长率水稻的发育。关于胚芽鞘长度，在染色体 1、3 和 8 上观察到的三个 QTL 与 LTG 的 QTL 共定位，表明单个基因在每个位点的多效性。结果表明，有利的O. rufipogon等位基因的渗入可以加速粳稻品种的高LTG和高胚芽鞘伸长率水稻的发育。