Frontiers in Genetics ( IF 2.8 ) Pub Date : 2020-09-07 , DOI: 10.3389/fgene.2020.571880 Min Peng 1 , Digang Zeng 1 , Weilin Zhu 1 , Xiuli Chen 1 , Chunling Yang 1 , Qingyun Liu 1 , Qiangyong Li 1 , Huanling Wang 2 , Hong Liu 2 , Jingzhen Liang 3 , Yong Lin 1 , Xiaohan Chen 1 , Yongzhen Zhao 1
Nitrite is a major environmental toxin in aquaculture systems that disrupts multiple physiological functions in aquatic animals. Although nitrite tolerance in shrimp is closely related to successful industrial production, few genetic studies of this trait are available. In this study, we constructed a high-density genetic map of
中文翻译:
太平洋白虾(Litopenaeus vannamei)亚硝酸盐耐受性高密度遗传图谱的构建和数量性状位点的鉴定
亚硝酸盐是水产养殖系统中的主要环境毒素,会破坏水生动物的多种生理功能。尽管虾的亚硝酸盐耐受性与成功的工业生产密切相关,但对该性状的遗传研究很少。在这项研究中,我们构建了高密度遗传图谱凡纳滨对虾具有 17,242 个单核苷酸多态性标记,跨越 6,828.06 厘摩 (cM),44 个连锁群 (LG) 上相邻标记之间的平均距离为 0.4 cM。利用该遗传图谱,我们鉴定了两个与亚硝酸盐耐受性相关的标记。然后,我们对四个遗传上不同的个体中最耐亚硝酸盐和亚硝酸盐敏感的个体的转录组进行了测序。南美白对虾家庭(LV-I–4)。我们在 LV-1、LV-2、LV-3 和 LV-4 家族中分别发现了 2,002、1,983、1,954 和 1,867 个差异表达基因。通过整合 QTL 和转录组学分析,我们鉴定了一个与亚硝酸盐耐受性相关的候选基因。该基因被注释为溶质载体家族26成员6( SLC26A6 )。 RNA 干扰 (RNAi) 分析表明SLC26A6对于亚硝酸盐耐受性至关重要南美白对虾。本研究增加了我们对虾亚硝酸盐耐受性分子机制的理解,并为分子标记辅助虾育种提供了基础。