Introduction: The presence of Merkel cell polyomavirus (MCPyV) was identified in Merkel cell carcinoma (MCC). However, there was sparse information on the link of other common nonmelanoma skin cancers – basal cell carcinoma (BCC) and squamous cell carcinoma (SCC) – to MCPyV infection. The current study describes the phylogenetic information of MCPyV isolated from Iranian non-MCC (nonmelanoma skin cancers) focusing on tumorigenesis of mutations in large tumor (LT) antigen (LT-Ag) fragment. Methods: Sixty patients with BCC and 20 patients with SCC were included in this study (48 males and 32 females; average age 65 years). The MCPyV-DNA copy number in positive samples was measured by quantitative real-time PCR. Then, mutational analysis of the MCPyV LT gene was carried out by direct sequencing. Results: While MCPyV DNA was detected in 6 (10%) of 60 BCC samples, no viral genome was found in SCCs. There was no distinct association of MCPyV positivity with gender, age, or type of tumor (BCC or SCC) (p value >0.05). Quantitative real-time PCR revealed that the median number of viral DNA copies per cell was 0.7 in 6 MCPyV-positive BCC samples. Furthermore, full-length LT-Ag sequencing of positive samples indicated no stop codon or frameshift mutations compared to reference sequences. Conclusion: Considering the important role of the LT-Ag in the pathogenicity of MCPyV, non-synonymous mutations compared with the reference proteins triggered relevant amino acid substitutions. Overall, the results showed no tumor-associated mutations in the LT-Ag sequence of MCPyVs from positive samples.

中文翻译：

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伊朗患者非默克尔细胞癌肿瘤中默克尔细胞多瘤病毒基因表达及大肿瘤抗原突变分析

简介：在默克尔细胞癌 (MCC) 中发现了默克尔细胞多瘤病毒 (MCPyV)。然而，关于其他常见非黑色素瘤皮肤癌——基底细胞癌 (BCC) 和鳞状细胞癌 (SCC)——与 MCPyV 感染之间的联系的信息很少。目前的研究描述了从伊朗非 MCC（非黑色素瘤皮肤癌）中分离出的 MCPyV 的系统发育信息，重点是大肿瘤 (LT) 抗原 (LT-Ag) 片段突变的肿瘤发生。方法：本研究共纳入 60 例 BCC 患者和 20 例 SCC 患者（男 48 例，女 32 例；平均年龄 65 岁）。通过定量实时 PCR 测量阳性样品中的 MCPyV-DNA 拷贝数。然后，通过直接测序对 MCPyV LT 基因进行突变分析。结果：虽然在 60 个 BCC 样本中的 6 个（10%）中检测到 MCPyV DNA，但在 SCC 中没有发现病毒基因组。MCPyV 阳性与性别、年龄或肿瘤类型（BCC 或 SCC）之间没有明显关联（p 值 > 0.05）。定量实时 PCR 显示，在 6 个 MCPyV 阳性 BCC 样本中，每个细胞的病毒 DNA 拷贝数中位数为 0.7。此外，与参考序列相比，阳性样品的全长 LT-Ag 测序表明没有终止密码子或移码突变。结论：考虑到 LT-Ag 在 MCPyV 致病性中的重要作用，与参考蛋白相比的非同义突变触发了相关氨基酸取代。总体而言，结果显示阳性样本中 MCPyVs 的 LT-Ag 序列中没有肿瘤相关突变。MCPyV 阳性与性别、年龄或肿瘤类型（BCC 或 SCC）之间没有明显关联（p 值 > 0.05）。定量实时 PCR 显示，在 6 个 MCPyV 阳性 BCC 样本中，每个细胞的病毒 DNA 拷贝数中位数为 0.7。此外，与参考序列相比，阳性样品的全长 LT-Ag 测序表明没有终止密码子或移码突变。结论：考虑到 LT-Ag 在 MCPyV 致病性中的重要作用，与参考蛋白相比的非同义突变触发了相关的氨基酸取代。总体而言，结果显示阳性样本中 MCPyVs 的 LT-Ag 序列中没有肿瘤相关突变。MCPyV 阳性与性别、年龄或肿瘤类型（BCC 或 SCC）之间没有明显关联（p 值 > 0.05）。定量实时 PCR 显示，在 6 个 MCPyV 阳性 BCC 样本中，每个细胞的病毒 DNA 拷贝数中位数为 0.7。此外，与参考序列相比，阳性样品的全长 LT-Ag 测序表明没有终止密码子或移码突变。结论：考虑到 LT-Ag 在 MCPyV 致病性中的重要作用，与参考蛋白相比的非同义突变触发了相关氨基酸取代。总体而言，结果显示阳性样本中 MCPyVs 的 LT-Ag 序列中没有肿瘤相关突变。定量实时 PCR 显示，在 6 个 MCPyV 阳性 BCC 样本中，每个细胞的病毒 DNA 拷贝数中位数为 0.7。此外，与参考序列相比，阳性样品的全长 LT-Ag 测序表明没有终止密码子或移码突变。结论：考虑到 LT-Ag 在 MCPyV 致病性中的重要作用，与参考蛋白相比的非同义突变触发了相关氨基酸取代。总体而言，结果显示阳性样本中 MCPyVs 的 LT-Ag 序列中没有肿瘤相关突变。定量实时 PCR 显示，在 6 个 MCPyV 阳性 BCC 样本中，每个细胞的病毒 DNA 拷贝数中位数为 0.7。此外，与参考序列相比，阳性样品的全长 LT-Ag 测序表明没有终止密码子或移码突变。结论：考虑到 LT-Ag 在 MCPyV 致病性中的重要作用，与参考蛋白相比的非同义突变触发了相关氨基酸取代。总体而言，结果显示阳性样本中 MCPyVs 的 LT-Ag 序列中没有肿瘤相关突变。考虑到 LT-Ag 在 MCPyV 致病性中的重要作用，与参考蛋白相比的非同义突变触发了相关的氨基酸替换。总体而言，结果显示阳性样本中 MCPyVs 的 LT-Ag 序列中没有肿瘤相关突变。考虑到 LT-Ag 在 MCPyV 致病性中的重要作用，与参考蛋白相比的非同义突变触发了相关的氨基酸替换。总体而言，结果显示阳性样本中 MCPyVs 的 LT-Ag 序列中没有肿瘤相关突变。