The real time PCR (qPCR) method provides a powerful method to assess levels of particular species of DNA. When combined with reverse transcription (RT-qPCR) it is the predominate technique to measure expression of gene transcripts. While this approach is very powerful, particular care must be taken in the design of the primers to facilitate specific and sensitive detection. Herein describes the framework for an undergraduate assignment which aims to teach primer design for SYBR based RT-qPCR. Beyond gaining direct experience with primer design, students will gain familiarity with important bioinformatic resources as well as a deeper theoretical understanding of the RT-qPCR approach and potential limitations. Moreover, as students' progress through the assignment they re-encounter many important concepts in molecular biology, gene expression, and nucleic acids, creating an opportunity for spiral learning. As this exercise only requires access to free web-based resources and does not require a laboratory it can be used in most science education settings. Despite not being a wet lab, this is a highly authentic research experience as this design process is commonplace in a molecular biology laboratory. Furthermore, the assignment is highly adaptable for different learning outcomes, time frames, and student background and ability. This article seeks to highlight connections and expanded learning outcomes for those already teaching such material, as well as a step-by-step guide for those new to teaching such content.

中文翻译：

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基于 SYBR 的 RT-qPCR 引物设计的适应性干实验室，以加强分子生物学和核酸的概念

实时 PCR (qPCR) 方法提供了一种强大的方法来评估特定 DNA 种类的水平。当与逆转录 (RT-qPCR) 结合使用时，它是测量基因转录本表达的主要技术。虽然这种方法非常强大，但在设计引物时必须特别小心，以促进特异性和灵敏的检测。本文描述了本科作业的框架，旨在教授基于 SYBR 的 RT-qPCR 的引物设计。除了获得引物设计的直接经验外，学生还将熟悉重要的生物信息学资源以及对 RT-qPCR 方法和潜在局限性的更深入的理论理解。此外，随着学生完成作业的进展，他们会重新遇到分子生物学、基因表达、和核酸，为螺旋式学习创造机会。由于此练习只需要访问基于网络的免费资源，不需要实验室，因此可以在大多数科学教育环境中使用。尽管不是湿实验室，但这是一种高度真实的研究体验，因为这种设计过程在分子生物学实验室中很常见。此外，该作业高度适应不同的学习成果、时间框架以及学生背景和能力。本文旨在为已经在教授此类材料的人强调联系和扩展的学习成果，并为那些不熟悉此类内容的人提供分步指南。由于此练习只需要访问基于网络的免费资源，不需要实验室，因此可以在大多数科学教育环境中使用。尽管不是湿实验室，但这是一种高度真实的研究体验，因为这种设计过程在分子生物学实验室中很常见。此外，该作业高度适应不同的学习成果、时间框架以及学生背景和能力。本文旨在为已经在教授此类材料的人强调联系和扩展的学习成果，并为那些不熟悉此类内容的人提供分步指南。由于此练习只需要访问基于网络的免费资源，不需要实验室，因此可以在大多数科学教育环境中使用。尽管不是湿实验室，但这是一种高度真实的研究体验，因为这种设计过程在分子生物学实验室中很常见。此外，该作业高度适应不同的学习成果、时间框架以及学生背景和能力。本文旨在为已经在教授此类材料的人强调联系和扩展的学习成果，并为那些不熟悉此类内容的人提供分步指南。该作业高度适应不同的学习成果、时间框架以及学生背景和能力。本文旨在为已经在教授此类材料的人强调联系和扩展的学习成果，并为那些不熟悉此类内容的人提供分步指南。该作业高度适应不同的学习成果、时间框架以及学生背景和能力。本文旨在为已经在教授此类材料的人强调联系和扩展的学习成果，并为那些不熟悉此类内容的人提供分步指南。