Colistin is still a widely used antibiotic in veterinary medicine although it is a last-line treatment option for hospitalized patients with infections caused by multidrug-resistant Gram-negative bacteria. Colistin resistance has gained additional importance since the recent emergence of mobile colistin resistance (mcr) genes. In the scope of a study on colistin resistance in clinical Escherichia coli isolates from human patients in Germany we characterized the mcr-1 gene variants. Our PCR-based screening for mcr-carrying E. coli from German patients revealed the presence of mcr-1-like genes in 60 isolates. Subsequent whole-genome sequence-based analyses detected one non-synonymous mutation in the mcr-1 gene for two isolates. The mutations were verified by Sanger sequencing and resulted in amino acid changes Met1Thr (isolate 803-18) and Tyr9Cys (isolate 844-18). Genotyping revealed no relationship between the isolates. The two clinical isolates were assigned to sequence types ST155 (isolate 803-18) and ST69 (isolate 844-18). Both mcr-1 variants were found to be located on IncX4 plasmids of 33 kb size; these plasmids were successfully conjugated into sodium azide resistant E. coli J53 Azir in a broth mating experiment. Here we present the draft sequences of E. coli isolate 803-18 carrying the novel variant mcr-1.26 and isolate 844-14 carrying the novel variant mcr-1.27. The results highlight the increasing issue of transferable colistin resistance.

中文翻译：

---

两个临床大肠杆菌分离株的基因组序列含有新的粘菌素抗性基因变体 mcr-1.26 和 mcr-1.27。

粘菌素仍然是兽医学中广泛使用的抗生素，尽管它是由多重耐药革兰氏阴性菌引起的住院患者的最后一线治疗选择。自从最近出现可移动的粘菌素抗性 (mcr) 基因以来，粘菌素抗性已变得更加重要。在德国人类患者临床大肠杆菌分离株中粘菌素耐药性的研究范围内，我们对 mcr-1 基因变体进行了表征。我们对来自德国患者的携带 mcr 的大肠杆菌进行了基于 PCR 的筛查，结果显示在 60 个分离株中存在 mcr-1 样基因。随后基于全基因组序列的分析在两个分离株的 mcr-1 基因中检测到一个非同义突变。这些突变通过 Sanger 测序验证并导致氨基酸变化 Met1Thr（分离物 803-18）和 Tyr9Cys（分离物 844-18）。基因分型显示分离株之间没有关系。两种临床分离株被分配到序列类型 ST155（分离株 803-18）和 ST69（分离株 844-18）。发现这两种 mcr-1 变体都位于 33 kb 大小的 IncX4 质粒上。在肉汤交配实验中，这些质粒成功地与抗叠氮化钠的大肠杆菌 J53 Azir 结合。在这里，我们展示了携带新变体 mcr-1.26 的大肠杆菌分离株 803-18 和携带新变体 mcr-1.27 的分离株 844-14 的草稿序列。结果突出了可转移粘菌素耐药性日益严重的问题。两种临床分离株被分配到序列类型 ST155（分离株 803-18）和 ST69（分离株 844-18）。发现这两种 mcr-1 变体都位于 33 kb 大小的 IncX4 质粒上。在肉汤交配实验中，这些质粒成功地与抗叠氮化钠的大肠杆菌 J53 Azir 结合。在这里，我们展示了携带新变体 mcr-1.26 的大肠杆菌分离株 803-18 和携带新变体 mcr-1.27 的分离株 844-14 的草稿序列。结果突出了可转移粘菌素耐药性日益严重的问题。两种临床分离株被分配到序列类型 ST155（分离株 803-18）和 ST69（分离株 844-18）。发现这两种 mcr-1 变体都位于 33 kb 大小的 IncX4 质粒上。在肉汤交配实验中，这些质粒成功地与抗叠氮化钠的大肠杆菌 J53 Azir 结合。在这里，我们展示了携带新变体 mcr-1.26 的大肠杆菌分离株 803-18 和携带新变体 mcr-1.27 的分离株 844-14 的草稿序列。结果突出了可转移粘菌素耐药性日益严重的问题。携带新型变体 mcr-1.26 的大肠杆菌分离株 803-18 和携带新型变体 mcr-1.27 的分离株 844-14。结果突出了可转移粘菌素耐药性日益严重的问题。携带新型变体 mcr-1.26 的大肠杆菌分离株 803-18 和携带新型变体 mcr-1.27 的分离株 844-14。结果突出了可转移粘菌素耐药性日益严重的问题。