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CONCUR: quick and robust calculation of codon usage from ribosome profiling data.
Bioinformatics ( IF 4.4 ) Pub Date : 2020-08-31 , DOI: 10.1093/bioinformatics/btaa733
Michaela Frye 1 , Susanne Bornelöv 2
Affiliation  

CONCUR is a standalone tool for codon usage analysis in ribosome profiling experiments. CONCUR uses the aligned reads in BAM format to estimate codon counts at the ribosome E-, P-, and A-sites and at flanking positions.

中文翻译:


CONCUR:根据核糖体分析数据快速而稳健地计算密码子使用情况。



CONCUR 是核糖体分析实验中密码子使用分析的独立工具。 CONCUR 使用 BAM 格式的对齐读数来估计核糖体 E、P 和 A 位点以及侧翼位置的密码子计数。
更新日期:2020-09-01
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