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Genomics of Natural History Collections for Understanding Evolution in the Wild.
Molecular Ecology Resources ( IF 5.5 ) Pub Date : 2020-08-18 , DOI: 10.1111/1755-0998.13245
Lua Lopez 1, 2 , Kathryn G Turner 2, 3 , Emily S Bellis 2, 4 , Jesse R Lasky 2
Affiliation  

A long‐standing question in biology is how organisms change through time and space in response to their environment. This knowledge is of particular relevance to predicting how organisms might respond to future environmental changes caused by human‐induced global change. Usually researchers make inferences about past events based on an understanding of current static genetic patterns, but these are limited in their capacity to inform on underlying past processes. Natural history collections (NHCs) represent a unique and critical source of information to provide temporally deep and spatially broad time‐series of samples. By using NHC samples, researchers can directly observe genetic changes over time and space and link those changes with specific ecological/evolutionary events. Until recently, such genetic studies were hindered by the intrinsic challenges of NHC samples (i.e. low yield of highly fragmented DNA). However, recent methodological and technological developments have revolutionized the possibilities in the novel field of NHC genomics. In this Special Feature, we compile a range of studies spanning from methodological aspects to particular case studies which demonstrate the enormous potential of NHC samples for accessing large genomic data sets from the past to advance our knowledge on how populations and species respond to global change at multiple spatial–temporal scales. We also highlight possible limitations, recommendations and a few opportunities for future researchers aiming to study NHC genomics.

中文翻译:

用于了解野外进化的自然历史收藏基因组学。

生物学中一个长期存在的问题是生物体如何随着时间和空间的变化来响应其环境。这些知识与预测生物体如何应对人类引起的全球变化引起的未来环境变化特别相关。通常,研究人员根据对当前静态遗传模式的理解对过去的事件进行推断,但这些推断在了解潜在的过去过程方面的能力是有限的。自然历史收藏 (NHC) 代表了一种独特且关键的信息来源,可提供时间深度和空间广泛的样本时间序列。通过使用 NHC 样本,研究人员可以直接观察基因随时间和空间的变化,并将这些变化与特定的生态/进化事件联系起来。直到最近,NHC 样本的内在挑战(即高度片段化的 DNA 产量低)阻碍了此类遗传研究。然而,最近的方法和技术发展已经彻底改变了 NHC 基因组学新领域的可能性。在这个特辑中,我们汇编了从方法学方面到特定案例研究的一系列研究,这些研究证明了 NHC 样本在访问过去的大型基因组数据集方面的巨大潜力,以提高我们对人口和物种如何应对全球变化的认识多个时空尺度。我们还强调了未来研究 NHC 基因组学的研究人员可能存在的局限性、建议和一些机会。最近的方法和技术发展彻底改变了 NHC 基因组学新领域的可能性。在这个特辑中,我们汇编了从方法学方面到特定案例研究的一系列研究,这些研究证明了 NHC 样本在访问过去的大型基因组数据集方面的巨大潜力,以提高我们对人口和物种如何应对全球变化的认识多个时空尺度。我们还强调了未来研究 NHC 基因组学的研究人员可能存在的局限性、建议和一些机会。最近的方法和技术发展彻底改变了 NHC 基因组学新领域的可能性。在这个特辑中,我们汇编了从方法学方面到特定案例研究的一系列研究,这些研究证明了 NHC 样本在访问过去的大型基因组数据集方面的巨大潜力,以提高我们对人口和物种如何应对全球变化的认识多个时空尺度。我们还强调了未来研究 NHC 基因组学的研究人员可能存在的局限性、建议和一些机会。我们汇编了从方法学方面到特定案例研究的一系列研究,这些研究证明了 NHC 样本在访问过去的大型基因组数据集方面的巨大潜力,以提高我们对种群和物种如何在多个时空尺度上应对全球变化的认识. 我们还强调了未来研究 NHC 基因组学的研究人员可能存在的局限性、建议和一些机会。我们汇编了从方法学方面到特定案例研究的一系列研究,这些研究证明了 NHC 样本在访问过去的大型基因组数据集方面的巨大潜力,以提高我们对种群和物种如何在多个时空尺度上应对全球变化的认识. 我们还强调了未来研究 NHC 基因组学的研究人员可能存在的局限性、建议和一些机会。
更新日期:2020-09-22
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